Ilkka Paatero
 Ph.D.
| 
 ilanpa@utu.fi +358 29 450 3789 Tykistökatu 6 Turku ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5926-2396 | 
cancer; cardiovascular biology; toxicology; microscopy; zebrafish models; model organisms;
My research covers broad range of topics in biomedicine. Current work is dealing mainly with cancer and cardiovascular biology.
My expertise is in application of model organisms, especially zebrafish (Danio rerio),
 in biomedical research. These models can help to understand and solve 
biomedical problems efficiently and ethically. Especially, when combined
 with high-resolution intravital microscopy, these models can give deep 
insights into developmental and disease processes in vivo. By using fish
 eggs and embryos, it is also possible to reduce the number of more 
complex and developed organisms used in research. These models, however, require certain set of skills and knowledge which is not part of the training of most medical and biomedical scientist. To facilite them to utilize the power of zebrafish models to advance their research, I have established a Zebrafish Core under Turku Centre for Biotechnology (University of Turku and Åbo Akademi University).
- High-resolution live imaging of tardigrade response to anoxiaJnk1 and downstream signalling hubs regulate anxiety-like behaviours in a zebrafish larvae phenotypic screen  (2025)  - MicronScientific Reports
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- LIMA1-alpha staining predicts curative intent surgery response in HPV negative head and neck cancer  (2025)  - Embo molecular medicine
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Phosphoproteomic analysis reveals the diversity of signaling behind ErbB‐inhibitor‐induced phenotypes  (2025)  - FEBS Journal
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- The ERBB2 c.1795C>T, p.Arg599Cys variant is associated with left ventricular outflow tract obstruction defects in humans  (2025)  - HGG advances
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- DUSP6 inhibition overcomes neuregulin/HER3-driven therapy tolerance in HER2+ breast cancer  (2024)  - Embo molecular medicineOncogenesis
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Empagliflozin attenuates hypoxia-induced heart failure of zebrafish embryos via influencing MMP13 expression  (2024)  - Biomedicine and Pharmacotherapy
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Glutaraldehyde-enhanced autofluorescence as a general tool for 3D morphological imaging  (2024)  - Biology OpenZebrafish
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Heat stress sensitizes zebrafish embryos to neurological and cardiac toxicityPP2A methylesterase PME-1 suppresses anoikis and is associated with therapy relapse of PTEN-deficient prostate cancers  (2024)  - Biochemical and Biophysical Research CommunicationsMolecular Oncology
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- HERC5 downregulation in non-small cell lung cancer is associated with altered energy metabolism and metastasis  (2024)  - Journal of Experimental and Clinical Cancer ResearchEMBO Reports
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
-   (2024)  
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- SIX2 promotes cell plasticity via Wnt/β-catenin signalling in androgen receptor independent prostate cancer  (2024)  - Nucleic Acids Research
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- TLNRD1 is a CCM complex component and regulates endothelial barrier integrity  (2024)  - Journal of Cell BiologyDevelopmental Cell
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Effect of caldesmon mutations in the development of zebrafish embryos  (2023)  - Biochemical and Biophysical Research Communications
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Glucocorticoid receptor-induced non-muscle caldesmon regulates metastasis in castration-resistant prostate cancer  (2023)  
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Impaired fin regeneration and angiogenesis in aged zebrafish and turquoise killifish  (2023)  - Biology Open
 
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Modeling of Zebrafish Housing Temperatures During Power Outage and Instrument Failure  (2023)  
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
-   (2023)  
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- STAT5b is a key effector of NRG-1/ERBB4-mediated myocardial growth  (2023)  
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Distinctive effects of SGLT2 inhibitors on angiogenesis in zebrafish embryos  (2022)  - Biomedicine and Pharmacotherapy
 
- MYO10-filopodia support basement membranes at pre-invasive tumor boundaries2022
 (A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )




