PhD Harri Savilahti - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Harri Savilahti
PhD

- professori,
fysiologia ja genetiikka (biologian laitos)

harri.savilahti@utu.fi

+358 40 708 5795

Vesilinnantie 5

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0002-6246-2572

Research page

Asiantuntijuusalueet

Molekyyligenetiikka; DNA-transpositioteknologia

Julkaisut

1/2

Petter Erik Portin 1940-2023 (2023)
- Turun Sanomat
Nokkala Christina, Savilahti Harri, Vuorisalo Timo
(O2 Muu julkaisu )
Petter Portin 1940-2023 (2023)
- Helsingin Sanomat
Nokkala Christina, Savilahti Harri, Vuorisalo Timo
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä)
The C-terminal region of phytoene synthase is a key element to control carotenoid biosynthesis in the haloarchaeon Haloferax volcanii (2022)
- Biochemical Journal
Cerletti Micaela, Rabino Agustin, Paggi Roberto A, Ferrari Celeste, Poetsch Ansgar, Savilahti Harri, Kiljunen Saija, De Castro Rosana E
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A systematic approach to inserting split inteins for Boolean logic gate engineering and basal activity reduction (2021)
- Nature Communications
Ho Trevor Y. H., Shao Alexander, Lu Zeyu, Savilahti Harri, Menolascina Filippo, Wang Lei, Dalchau Neil, Wang Baojun
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Intein-assisted bisection mapping systematically splits proteins for Boolean logic and inducibility engineering (2020)
- bioRxiv
Trevor Y. H. Ho, Alexander Shao, Zeyu Lu, Harri Savilahti, Filippo Menolascina, Lei Wang, Neil Dalchau, Baojun Wang
(O2 Muu julkaisu )
Applications of the bacteriophage Mu in vitro transposition reaction and genome manipulation via electroporation of DNA transposition complexes (2018) Bacteriophages: Methods and Protocols, Volume 3 Saija Haapa-Paananen, Harri Savilahti
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Molecular Factors of Hypochlorite Tolerance in the Hypersaline Archaeon Haloferax volcanii (2018)
- Genes
Gomez M., Leung W., Dantuluri S., Pillai A., Gani Z., Hwang S., McMillan L.J., Kiljunen S., Savilahti H., Maupin-Furlow J.A.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Mu transpososome activity-profiling yields hyperactive MuA variants for highly efficient genetic and genome engineering (2018)
- Nucleic Acids Research
Tiina S. Rasila, Elsi Pulkkinen, Saija Kiljunen, Saija Haapa-Paananen, Maria I. Pajunen, Anu Salminen, Lars Paulin, Mauno Vihinen, Phoebe A. Rice, Harri Savilahti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Transposon Insertion Mutagenesis for Archaeal Gene Discovery (2017) In Vitro Mutagenesis - Methods and Protocols Kiljunen Saija, Pajunen Maria, Savilahti Harri
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
A set of mini-Mu transposons for versatile cloning of circular DNA and novel dual-transposon strategy for increased efficiency (2016)
- Plasmid
Pulkkinen E, Haapa-Paananen S, Turakainen H, Savilahti H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
MuA-mediated in vitro cloning of circular DNA: transpositional autointegration and the effect of MuB (2016)
- Molecular Genetics and Genomics
Pulkkinen E, Haapa-Paananen S, Savilahti H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Screening of a Haloferax volcanii Transposon Library Reveals Novel Motility and Adhesion Mutants (2016)
- Life
Legerme Georgio, Yang Evan, Esquivel Rianne N, Kiljunen Saija, Savilahti Harri, Pohlschroder Metchild
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
An assay to monitor the activity of DNA transposition complexes yields a general quality control measure for transpositional recombination reactions (2014)
- Mobile Genetic Elements
Elsi Pulkkinen, Saija Haapa-Paananen, Harri Savilahti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Generation of comprehensive transposon insertion mutant library for the model archaeon, Haloferax volcanii, and its use for gene discovery (2014)
- BMC Biology
Saija Kiljunen, Maria I Pajunen, Kieran Dilks, Stefanie Storf, Mechthild Pohlschroder, Harri Savilahti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Phylogenetic analysis of Maverick/Polinton giant transposons across organisms (2014)
- Molecular Phylogenetics and Evolution
Haapa-Paananen S, Wahlberg N, Savilahti H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Flexibility in MuA Transposase Family Protein Structures: Functional Mapping with Scanning Mutagenesis and Sequence Alignment of Protein Homologues (2012)
- PLoS ONE
Rasila TS, Vihinen M, Paulin L, Haapa-Paananen S, Savilahti H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A method to sequence and quantify DNA integration for monitoring outcome in gene therapy (2011)
- Nucleic Acids Research
Brady T, Roth SL, Malani N, Wang GP, Berry CC, Leboulch P, Hacein-Bey-Abina S, Cavazzana-Calvo M, Papapetrou EP, Sadelain M, Savilahti H, Bushman FD
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Boundary cell specific adhesion molecule, PB-cadherin, is not required for maintenance the midbrain-hindbrain border (2010)
- International Journal of Developmental Neuroscience
Saarimaki-Vire J, Turakainen H, Alitalo A, Sinjushina N, Savilahti H, Partanen J
(O2 Muu julkaisu )
Genetic recombination pathways and their application for genome modification of human embryonic stem cells (2010)
- Experimental Cell Research
Nieminen M, Tuuri T, Savilahti H
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Mso1p Regulates Membrane Fusion through Interactions with the Putative N-Peptide-binding Area in Sec1p Domain 1 (2010)
- Molecular Biology of the Cell
Weber M, Chernov K, Turakainen H, Wohlfahrt G, Pajunen M, Savilahti H, Jantti J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )