Leo Lahti
Professor
leo.lahti@utu.fi +358 29 450 2390 +358 50 436 4626 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 452E ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5537-637X |
Data science; AI; Machine Learning; Applied statistics; Statistical programming; Probabilistic models; Complex natural and social systems; Microbial ecology; Computational humanities; Open knowledge
Leo Lahti is professor in Data Science in University of Turku, Finland. His research team focuses on computational analysis and modeling of complex natural and social systems. Lahti obtained doctoral degree (DSc) from Aalto University in Finland (2010), developing probabilistic machine learning methods for high-throughput life science data integration. This was followed by subsequent postdoctoral research at EBI/Hinxton (UK), Wageningen University (NL), and VIB/KU Leuven (BE). Lahti has coordinated international networks in data science methods and applications and organizes international data science training events on a regular basis. He is vice chair for the national coordination on open science Finland, executive committee member for the International Science Council Committee on Data (2023-2025), member of the global Bioconductor Community Advisory Board, and founder of the open science work group of Open Knowledge Finland ry. For more information, see the research homepage iki.fi/Leo.Lahti
Computational scientist focusing on change in complex natural and social systems, and how they can be understood through a computational lens.
Computational and data science, statistical and probabilistic programming, machine learning, AI, applied statistics, ecological models, open science
- Advancing microbiome research with machine learning: key findings from the ML4Microbiome COST action (2023)
- Frontiers in Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A toolbox of machine learning software to support microbiome analysis (2023)
- Frontiers in Microbiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Author Correction: Greengenes2 unifies microbial data in a single reference tree (Nature Biotechnology, (2023), 10.1038/s41587-023-01845-1) (2023)
- Nature Biotechnology
(O2 Muu julkaisu ) - Dealing with dimensionality: the application of machine learning to multi-omics data (2023)
- Bioinformatics
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Ebola epidemic model with dynamic population and memory (2023)
- Chaos, Solitons and Fractals
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbiome and atrial fibrillation: results from a large population-based study (2023)
- EBioMedicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbiota composition and function in pregnancy as determinants of prediabetes at two-year postpartum (2023)
- Acta Diabetologica
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Impacts of maternal microbiota and microbial metabolites on fetal intestine, brain, and placenta (2023)
- BMC Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Machine learning approaches in microbiome research: challenges and best practices (2023)
- Frontiers in Microbiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Maternal microbiota communicates with the fetus through microbiota-derived extracellular vesicles (2023)
- Microbiome
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - miaSim: an R/Bioconductor package to easily simulate microbial community dynamics (2023)
- Methods in Ecology and Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Microbiome-based risk prediction in incident heart failure: a community challenge (2023) Erawijantari PP, Kartal E, Liñares-Blanco J, Laajala TD, Feldman LE, Carmona-Saez P, Shigdel R, Claesson MJ, Bertelsen RJ, Gomez-Cabrero D, Minot S, Albrecht J, Chung V, Inouye M, Jousilahti P, Schultz JH, Friederich HC, Knight R, Salomaa V, Niiranen T, Havulinna AS, Saez-Rodriguez J, Levinson RT, Lahti L; FINRISK Microbiome DREAM Challenge and ML4 Microbiome Communities
(O2 Muu julkaisu ) - The gut microbiome is a significant risk factor for future chronic lung disease (2023)
- Journal of Allergy and Clinical Immunology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The preterm gut microbiota and administration routes of different probiotics: a randomized controlled trial (2023)
- Pediatric Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - What are patterns of rise and decline? (2023)
- Royal Society Open Science
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - An Infancy-Onset 20-Year Dietary Counselling Intervention and Gut Microbiota Composition in Adulthood (2022)
- Nutrients
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Can gut microbiota throughout the first 10 years of life predict executive functioning in childhood? (2022)
- Developmental Psychobiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort (2022)
- Nature Genetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comprehensive biomarker profiling of hypertension in 36 985 Finnish individuals (2022)
- Journal of Hypertension
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - COMPREHENSIVE BIOMARKER PROFILING OF HYPERTENSION IN 36,985 FINNISH INDIVIDUALS (2022)
- Journal of Hypertension
(O2 Muu julkaisu )