Leo Lahti
 Professor
 leo.lahti@utu.fi +358 29 450 2390 +358 50 436 4626 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 452E ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5537-637X  | 
Data science; AI; Machine Learning; Applied statistics; Statistical programming; Probabilistic models; Complex natural and social systems; Microbial ecology; Computational humanities; Open knowledge
Leo Lahti is professor in Data Science in University of Turku, Finland. His research team focuses on computational analysis and modeling of complex natural and social systems. Lahti obtained doctoral degree (DSc) from Aalto University in Finland (2010), developing probabilistic machine learning methods for high-throughput life science data integration. This was followed by subsequent postdoctoral research at EBI/Hinxton (UK), Wageningen University (NL), and VIB/KU Leuven (BE). Lahti has coordinated international networks in data science methods and applications and organizes international data science training events on a regular basis. He is vice chair for the national coordination on open science Finland, executive committee member for the International Science Council Committee on Data (2023-2025), member of the global Bioconductor Community Advisory Board, and founder of the open science work group of Open Knowledge Finland ry. For more information, see the research homepage iki.fi/Leo.Lahti
Computational scientist focusing on change in complex natural and social systems, and how they can be understood through a computational lens.
Computational and data science, statistical and probabilistic programming, machine learning, AI, applied statistics, ecological models, open science
- Assessing the safety of microbiome perturbations  (2025)  
- Microbial genomics
 
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Association of leisure time physical activity with gut microbiota composition in early adulthood  (2025)  
- Scientific Reports
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Associations between gut microbiome and circulating cytokines: a cross-sectional analysis in the FINRISK 2002 population cohort  (2025)  
- Gut Pathogens
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Associations of alcohol with the human gut microbiome and prospective health outcomes in the FINRISK 2002 cohort  (2025)  
- European Journal of Nutrition
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Breast Milk Proteome: Changes in the Different Stages of Lactation and Impacts of Gestational Diabetes Mellitus and Body Mass Index  (2025)  
- Molecular Nutrition and Food Research
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Chronological age estimation from human microbiomes with transformer-based Robust Principal Component Analysis  (2025)  
- Communications Biology
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of missing data handling methods for variant pathogenicity predictors  (2025)  
- NAR Genomics and Bioinformatics: Nucleic Acids Research Genomics and Bioinformatics
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Elementary methods provide more replicable results in microbial differential abundance analysis  (2025)  
- Briefings in Bioinformatics
 
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Fermented foods affect the seasonal stability of gut bacteria in an Indian rural population  (2025)  
- Nature Communications
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Fractional modelling of COVID-19 transmission incorporating asymptomatic and super-spreader individuals  (2025)  
- Mathematical Biosciences
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gender differences in global antimicrobial resistance  (2025)  
- npj biofilms and microbiomes
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut Microbiome as a Risk Factor for Future CKD  (2025)  
- Kidney International Reports
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbiome-derived bacterial extracellular vesicles in patients with solid tumours  (2025)  
- Journal of Advanced Research
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbiota-derived extracellular vesicles form a distinct entity from gut microbiota  (2025)  
- MSystems
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - iSEEtree: interactive explorer for hierarchical data  (2025)  
- Bioinformatics Advances
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Learning and teaching biological data science in the Bioconductor community  (2025)  
- PLoS Computational Biology
 
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - LimROTS: A Hybrid Method Integrating Empirical Bayes and Reproducibility-Optimized Statistics for Robust Differential Expression Analysis  (2025)  
- Bioinformatics
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Links between gut microbiota with specific serum metabolite groups in pregnant women with overweight or obesity  (2025)  
- Nutrition, Metabolism and Cardiovascular Diseases
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Maternal pre- and postnatal stress and maternal and infant gut microbiota features  (2025)  
- Psychoneuroendocrinology
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Multi-omics time-series analysis in microbiome research: a systematic review  (2025)  
- Briefings in Bioinformatics
 
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) 



