Tomi Suomi
Medical Bioinformatics Centre tomi.suomi@utu.fi +358 29 450 3803 Tykistökatu 6 Turku ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-3639-979X |
Julkaisut 
2/3
- Introducing untargeted data-independent acquisition for metaproteomics of complex microbial samples (2022)
- ISME Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - PhosPiR: an automated phosphoproteomic pipeline in R (2022)
- Briefings in Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Statistical and machine learning methods to study human CD4+ T cell proteome profiles (2022)
- Immunology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)
- Diabetes Care
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)
- Nature Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021) Suomi Tomi
(G5 Artikkeliväitöskirja) - Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry in Metaproteomics of Gut Microbiota—Implementation and Computational Analysis (2020)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A Data Analysis Protocol for Quantitative Data-Independent Acquisition Proteomics. (2019)
- Methods in Molecular Biology
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - A comprehensive evaluation of popular proteomics software workflows for label-free proteome quantification and imputation (2018)
- Briefings in Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection (2018)
- Nature Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A systematic evaluation of normalization methods in quantitative label-free proteomics (2018)
- Briefings in Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Phosphonormalizer: an R package for normalization of MS-based label-free phosphoproteomics (2018)
- Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - SimPhospho: a software tool enabling confident phosphosite assignment (2018)
- Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Accurate detection of differential expression and splicing using low-level features (2017)
- Methods in Molecular Biology
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Enhanced differential expression statistics for data-independent acquisition proteomics (2017)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - HIF prolyl hydroxylase PHD3 regulates translational machinery and glucose metabolism in clear cell renal cell carcinoma (2017)
- Cancer and Metabolism
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - ROTS: An R package for reproducibility-optimized statistical testing (2017)
- PLoS Computational Biology
Laura L. Elo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Brief Isoflurane Anesthesia Produces Prominent Phosphoproteomic Changes in the Adult Mouse Hippocampus (2016)
- ACS Chemical Neuroscience
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Optimization of Statistical Methods Impact on Quantitative Proteomics Data (2015)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Using peptide-level proteomics data for detecting differentially expressed proteins. (2015)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali