Accurate detection of differential expression and splicing using low-level features - UTU Tutkimustietojärjestelmä

A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa

Accurate detection of differential expression and splicing using low-level features

Tekijät: Suomi Tomi, Elo Laura L

Toimittaja: Wajapeyee Narendra, Gupta Romi

Painos: 1

Kustantaja: HUMANA PRESS INC, 999 RIVERVIEW DR, STE 208, TOTOWA, NJ 07512-1165 USA

Kustannuspaikka: New York

Julkaisuvuosi: 2017

Journal: Methods in Molecular Biology

Kokoomateoksen nimi: Eukaryotic transcriptional and post-transcriptional gene expression regulation

Tietokannassa oleva lehden nimi: EUKARYOTIC TRANSCRIPTIONAL AND POST-TRANSCRIPTIONAL GENE EXPRESSION REGULATION

Lehden akronyymi: METHODS MOL BIOL

Sarjan nimi: Methods in Molecular Biology

Vuosikerta: 1507

Aloitussivu: 141

Lopetussivu: 151

Sivujen määrä: 11

ISBN: 978-1-4939-6516-8

eISBN: 978-1-4939-6518-2

ISSN: 1064-3745

DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-4939-6518-2_11

Tiivistelmä

Gene expression can be quantified in high throughput using microarray technology. Here we describe how to accurately detect differential expression and splicing using a probe-level expression change averaging (PECA) method. PECA is available as an R package from Bioconductor (https://www.bioconductor.org), and it supports multiple operating systems.