Coordinator/Senior researcher (PhD) Tuomas Huokko - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Tuomas Huokko
Coordinator/Senior researcher (PhD)

- erikoistutkija,
molekulaarinen kasvibiologia (bioteknologian laitos)

Photosynthetic Microbes group

ttthuo@utu.fi

Tykistökatu 6

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-4409-3651

Photosynthetic Microbes

Asiantuntijuusalueet

syanobakteerit; fotomiksotrofia; fotosynteesin ja respiraation elektronisiirto ja sen säätely; tylakoidikalvojen biogeneesi

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

Photosynthetic Microbes -tutkimusryhmä

Biografia

Suoritin maisterin tutkinnon fysiologiasta ja genetiikasta Turun yliopiston biologian laitokselta vuonna 2012. Tämän jälkeen aloitin väitöskirjatutkimukseni akatemiaprofessori Eva-Mari Aron tutkimusryhmässä Turun yliopiston biokemian laitoksella ja valmistuin vuonna 2018. Väitöskirjatutkimukseni keskittyi syanobakteerien tärkeimpien bioenergiaprosessien säätelyyn. Vuodet 2018–2021 työskentelin postdoc-tutkijana professori Luning Liun ryhmässä Liverpoolin yliopistossa, Isossa-Britanniassa, tutkien syanobakteerien tylakoidikalvojen biogeneesiä ja dynamiikkaa. Tämän jälkeen liityin tutkijatohtorina professori Yagut Allahverdiyevan tutkimusryhmään Turun yliopistossa ja pääprojektini koski yhteyttävien mikrobien bioenergetiikan säätelyä fotomiksotrofisissa olosuhteisa. Alkuvuodesta 2025 aloitin tehtäväni erikoistutkijana samassa ryhmässä.

Tutkimus

Julkaisut

1/2

Differences in photosystem II activity and carbon allocation during photomixotrophic growth in distinct wild-type strains of Synechocystis sp. PCC 6803 (2026)
- Plant Journal
Huokko, Tuomas; Sporre, Emil; Koch, Bradley; Patil, Priyanka Pradeep; Wey, Laura; Nikkanen, Lauri; Napaumpaiporn, Pornpan; Virtanen, Olli; Hubácek, Michal; Kulik, Natalia; Komenda, Josef; Hudson, Elton; Vass, Imre; Allahverdiyeva, Yagut
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Curvature Thylakoid1‐like protein CurT mediates thylakoid membrane architecture in Synechococcus elongatus PCC 7942 (2025)
- mLife
Zhang, Zimeng; Ge, Xingwu; Huokko, Tuomas; Liu, Lu‐Ning
(B1 Vertaisarvioitu muu artikkeli (esim. pääkirjoitus, letter, comment) tieteellisessä lehdessä)
The role of the LysR-type transcription factor PacR in regulating nitrogen metabolism in Anabaena sp. PCC7120 (2025)
- Physiologia Plantarum
Werner, Elisa; Huokko, Tuomas; Santana-Sánchez, Anita; Picossi, Silvia; Nikkanen, Lauri; Herrero, Antonia; Allahverdiyeva, Yagut
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The role of the LysR-type transcription factor PacR in regulating nitrogen metabolism in Anabaena sp. PCC7120 (2024)
- bioRxiv
Werner, E.; Huokko, T.; Santana-Sanchez, A.; Picossi, S.; Nikkanen, L.; Herrero, A.; Allahverdiyeva, Y.
(O2 Muu julkaisu )
Dynamic Changes in the Thylakoid Proteome of Cyanobacteria during Light-Regulated Thylakoid Membrane Development (2023)
- Plants
Huang, Fang; Grauslys, Arturas; Huokko, Tuomas; Caamaño Gutiérrez, Eva; Jones, Andrew R.; Liu, Lu-Ning
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Patterning of the Autotrophic, Mixotrophic, and Heterotrophic Proteomes of Oxygen-Evolving Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 (2022)
- Frontiers in microbiology
Muth-Pawlak Dorota, Kreula Sanna, Gollan Peter J., Huokko Tuomas, Allahverdiyeva Yagut, Aro Eva-Mari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Hydrocarbon Desaturation in Cyanobacterial Thylakoid Membranes Is Linked With Acclimation to Suboptimal Growth Temperatures (2021)
- Frontiers in microbiology
Vuorio Eerika, Thiel Kati, Fitzpatrick Duncan, Huokko Tuomas, Kämäräinen Jari, Dandapani Hariharan, Aro Eva-Mari, Kallio Pauli
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Probing the biogenesis pathway and dynamics of thylakoid membranes (2021)
- Nature Communications
Huokko Tuomas, Ni Tao, Dykes Gregory F, Simpson Deborah M, Brownridge Philip, Conradi Fabian D, Beynon Robert J, Nixon Peter J, Mullineaux Conrad W, Zhang Peijun, Liu Lu-Ning
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
mRNA localization, reaction centre biogenesis and thylakoid membrane targeting in cyanobacteria (2020)
- Nature Plants
Mahbub M, Hemm L, Yang YX, Kaur R, Carmen H, Engl C, Huokko T, Riediger M, Watanabe S, Liu LN, Wilde A, Hess WR, Mullineaux CW
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Structural variability, coordination and adaptation of a native photosynthetic machinery (2020)
- Nature Plants
Zhao LS, Huokko T, Wilson S, Simpson DM, Wang Q, Ruban AV, Mullineaux CW, Zhang YZ, Liu LN
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )