Pauli Kallio
Ph.D.
pataka@utu.fi +358 29 450 4209 +358 50 339 6978 Itäinen Pitkäkatu 4 C Turku Työhuone: 6038.1 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-3590-9882 |
Asiantuntijuusalueet
Synteettinen biologia; Syanobakteerien metabolian muokkaus; Molekyylibiologia; Entsymologia
Synteettinen biologia; Syanobakteerien metabolian muokkaus; Molekyylibiologia; Entsymologia
Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe
Bioteknologian laitos, Teknillinen tiedekunta
Bioteknologian laitos, Teknillinen tiedekunta
Tutkimus
Tutkimuksemme (Syanobakteerien Synteettinen Biologia; Synthetic Biology of Cyanobacteria) keskittyy yhteyttävien syanobakteerien muokkaukseen, molekyylitason karakterisointiin, sekä synteettisen biologian menetelmien kehitämiseen. Tavoitteena on luoda uusia bioteknologian sovelluksia, jotka mahdollistaisivat erilaisten hiilipohjaisten yhdisteiden tuottamisen suoraan hiilidioksidista, auringon energian avulla - käyttäen muokattuja syanobakteereita biologisina solutehtaina.
Tutkimus pohjautuu molekulaarisen kasvibiologian yksikössä tehtävään fotosynteesitutkimukseen ja yhdistää molekyylibiologian, mikrobiologian ja analytiikan eri osa-alueita.
Lisää tietoa löydät ryhmämme verkkosivuilta http://utu.fi/sbc
Opetus
DIBT0603 Microbial Metabolic Engineering - Practice
DIBT0084-3001 Kestävien bioteknisten prosessien perusteet
https://opas.peppi.utu.fi/fi/opintojakso/DIBT0084/87338
DIBT0607-3001 Scientific Writing in Biosciences
https://opas.peppi.utu.fi/fi/opintojakso/DIBT0607/91865
DIBT0604-3001 Technology Outreach
https://opas.peppi.utu.fi/fi/opintojakso/DIBT0604/88473
https://sites.utu.fi/technologyoutreach
DIBT0602 Microbial Metabolic Engineering I
https://opas.peppi.utu.fi/fi/opintojakso/DIBT0602/89496
DIBT0603 Microbial Metabolic Engineering - Practice
https://opas.peppi.utu.fi/fi/opintojakso/DIBT0603/89497
Julkaisut 
1/2
- Engineering RNA polymerase to construct biotechnological host strains of cyanobacteriaSequence optimization of efegene from P. syringae is not required for stable ethylene production in recombinant Synechocystis sp. PCC6803. (2024)
- Physiologia PlantarumInternational Journal of Innovative Research in Technology and Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Interplay between photosynthetic electron flux and organic carbon sinks in sucrose-excreting Synechocystis sp PCC 6803 revealed by omics approachesA microbial platform for renewable propane synthesis based on a fermentative butanol pathway (2024)
- Microbial Cell FactoriesBiotechnology for Biofuels
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A Plasmid-Based Fluorescence Reporter System for Monitoring Oxidative Damage in E. coli (2022)
- Sensors
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Photosynthetically produced sucrose by immobilized Synechocystis sp. PCC 6803 drives biotransformation in E. coli (2022)
- Biotechnology for Biofuels and Bioproducts
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of alternative integration sites in the chromosome and the native plasmids of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 in respect to expression efficiency and copy number (2021)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Hydrocarbon Desaturation in Cyanobacterial Thylakoid Membranes Is Linked With Acclimation to Suboptimal Growth Temperatures (2021)
- Frontiers in Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Photoautotrophic production of renewable ethylene by engineered cyanobacteria: Steering the cell metabolism towards biotechnological use (2021)
- Physiologia Plantarum
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Enhanced stable production of ethylene in photosynthetic cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942 (2019)
- World Journal of Microbiology and Biotechnology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Redirecting photosynthetic electron flux in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 by the deletion of flavodiiron protein Flv3 (2019)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of ethanol tolerance between potential cyanobacterial production hosts (2018)
- Journal of Biotechnology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Translation efficiency of heterologous proteins is significantly affected by the genetic context of RBS sequences in engineered cyanobacterium Synechocystis sp PCC 6803 (2018)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of orthologous cyanobacterial aldehyde deformylating oxygenases in the production of volatile C3-C7 alkanes in engineered E. coli (2017)
- Metabolic Engineering Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Engineering the cyanobacterium synechocystis Sp. PCC 6803 towards optimized solutions for future biotechnological applications (2017) Nagy C., Aro E., Kallio P., Patrikainen P., Thiel K., Dandapani H., Mulaku E., Kakko L.
(O2 Muu julkaisu ) - Inactivation of iron-sulfur cluster biogenesis regulator SufR in Synechocystis sp. PCC 6803 induces unique iron-dependent protein-level responses (2017)
- BBA - General Subjects
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Pyridine nucleotide transhydrogenase PntAB is essential for optimal growth and photosynthetic integrity under low-light mixotrophic conditions in Synechocystis sp. PCC 6803 (2017)
- New Phytologist
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - SRM dataset of the proteome of inactivated iron-sulfur cluster biogenesis regulator SufR in Synechocystis sp. PCC 6803 (2017)
- Data in Brief
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The effect of enhanced acetate influx on Synechocystis sp. PCC 6803 metabolism (2017)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Development of a Quantitative SRM-Based Proteomics Method to Study Iron Metabolism of Synechocystis sp. PCC 6803 (2016)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2016)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2015)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali