PhD Ivana Mikocziova - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Ivana Mikocziova
PhD

- tutkijatohtori,
Turun biotiedekeskus (erilliset laitokset)

ivana.mikocziova@utu.fi

Työhuone: 5022

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-2928-445X

Asiantuntijuusalueet

Immunology; Single-cell omics; Spatial omics; Autoimmunity; T cells; B cells; Adaptive Immune Receptor Repertoires (AIRR)

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

InFLAMES Research Flagship

Biografia

Postdoctoral researcher at the Single Cell Omics core facility (Turku Bioscience) & Single-cell Immunogemoics research group.

Tutkimus

My research focuses on adaptive immune cells in health and disease, and I am particularly interested in autoimmune and immune-mediated diseases. In the lab, I perform various single-cell omics and spatial omics experiments, with focus on transcriptomics. On the analysis side, I specialise in T cell receptor (TCR) and B cell receptor/antibody (BCR) repertoires, collectivelly also known as Adaptive Immune Receptor Repertoires (AIRR).

Opetus

Teaching:

BIOT1524_30004_1 Modernit bioteknologiat ja bioinformatiikka/Modern biotechnologies and bioinformatics (2023 - present)

BIOT2308 Omics Technologies and Bioinformatics

IFDM2001-3001 Methods of Immunological Research

Other teaching activities:

Single Cell Course Week | HiLIFE (Helsinki, Finland): "Single Cell Sequencing: Zooming in on 10x Genomics’ Chromium System"

Julkaisut

Dynamics of T cell and B cell receptor repertoires in response to obesity in a murine model of
atherosclerosis (2024)
- European Journal of ImmunologyiScience
Mikocziova, Ivana; Mikkola, Lea; Palani, Senthil; Roivainen, Anne; Hernández de Sande, Ana; Heinäniemi, Merja; Örd, Tiit; Kaikkonen, Minna U; Lönnberg, Tapio
(Abstrakti)
(2024)
- European Journal of Immunology
Mikkola, Lea; Mikocziova, Ivana; Piipponen, Minna; Valkonen, Mira; Fagersund, Jimmy; Palani, Senthil; Roivainen, Anne; Hernández de Sande, Ana; Heinäniemi, Merja; Ruusuvuori, Pekka; Örd, Tiit; Kaikkonen, Minna U; Lönnberg, Tapio
(Abstrakti)
Germline polymorphisms and alternative splicing of human immunoglobulin light chain genes (2021)
Mikocziova Ivana, Peres Ayelet, Gidoni Moriah, Greiff Victor, Yaari Gur, Sollid Ludvig M.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Immunoglobulin germline gene variation and its impact on human disease (2021)
- Genes and ImmunityNucleic Acids Research
Mikocziova Ivana, Greiff Victor, Sollid Ludvig M
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Individualized VDJ recombination predisposes the available Ig sequence space (2021)
- Genome Research
Slabodkin Andrei, Chernigovskaya Maria, Mikocziova Ivana, Akbar Rahmad, Scheffer Lonneke, Pavlović Milena, Bashour Habib, Snapkov Igor, Mehta Brij Bhushan, Weber Cédric R., Gutierrez-Marcos Jose, Sollid Ludvig M., Haff Ingrid Hobæk, Sandve Geir Kjetil, Robert Philippe A., Greiff Victor
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Polymorphisms in human immunoglobulin heavy chain variable genes and their upstream regions2020)
Mikocziova I, Gidoni M, Lindeman I, Peres A, Snir O, Yaari G, Sollid LM
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2019)
- Nature Communications
Gidoni M, Snir O, Peres A, Polak P, Lindeman I, Mikocziova I, Sarna VK, Lundin KEA, Clouser C, Vigneault F, Collins AM, Sollid LM, Yaari G
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )