Leo Lahti
Professor
leo.lahti@utu.fi +358 29 450 2390 +358 50 436 4626 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 452E ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5537-637X |
Data science; AI; Machine Learning; Applied statistics; Statistical programming; Probabilistic models; Complex natural and social systems; Microbial ecology; Computational humanities; Open knowledge
Leo Lahti is professor in Data Science in University of Turku, Finland. His research team focuses on computational analysis and modeling of complex natural and social systems. Lahti obtained doctoral degree (DSc) from Aalto University in Finland (2010), developing probabilistic machine learning methods for high-throughput life science data integration. This was followed by subsequent postdoctoral research at EBI/Hinxton (UK), Wageningen University (NL), and VIB/KU Leuven (BE). Lahti has coordinated international networks in data science methods and applications and organizes international data science training events on a regular basis. He is vice chair for the national coordination on open science Finland, executive committee member for the International Science Council Committee on Data (2023-2025), member of the global Bioconductor Community Advisory Board, and founder of the open science work group of Open Knowledge Finland ry. For more information, see the research homepage iki.fi/Leo.Lahti
Computational scientist focusing on change in complex natural and social systems, and how they can be understood through a computational lens.
Computational and data science, statistical and probabilistic programming, machine learning, AI, applied statistics, ecological models, open science
- Microbiome yarns: The Global Phenotype-Genotype Survey. Episode III: importance of microbiota diversification for microbiome function and biome health (2019)
- Microbial BiotechnologyMicrobiome
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Reconstructing intellectual networks: From the ESTC’s bibliographic metadata to historical materialStability estimation of autoregulated genes under Michaelis-Menten-type kinetics (2019)
- CEUR Workshop ProceedingsPhysical review E
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa) - Reply to the Letter to the Editor: Gut microbiota composition is associated with temperament traits in infants (2019)
- Brain, Behavior, and Immunity
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Scaling up bibliographic data science (2019)
- CEUR Workshop ProceedingsMicrobiome
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa) - The Emerging Paradigm of Bibliographic Data Science (2019) Vaara V, Ijaz A, Tiihonen I, Kanner A, Säily T, Lahti L
(O2 Muu julkaisu ) - A Hierarchical Ornstein-Uhlenbeck Model for Stochastic Time Series AnalysisIntestinal microbiome landscaping: insight in community assemblage and implications for microbial modulation strategies2018
- Lecture Notes in Computer ScienceFEMS Microbiology Reviews
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa) - Digitaaliset ihmistieteet ja historiantutkimus (2018) Menneisyyden rakentajat : teoriat historiantutkimuksessa Mikko Tolonen, Leo Lahti
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Gut Microbiota Composition in Mid-Pregnancy Is Associated with Gestational Weight Gain but Not Prepregnancy Body Mass Index (2018)
- Journal of Women's Health
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Microbial communities as dynamical systems (2018)
- Current Opinion in Microbiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - microbiome R package (v.3.5) (2018) Leo Lahti, Sudarshan Shetty
(I2 Tieto- ja viestintätekninen sovellus) - Microbiome Yarns: human biome reproduction, evolution and visual acuity (2018)
- Microbial Biotechnology
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Open Data Science (2018)
- Lecture Notes in Computer Science
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa) - Opening academic publishing - Development and application of systematic evaluation criteria (2018) Anna Björk, Juho-Matti Paavola, Teemu Ropponen, Mikael Laakso, Leo Lahti
(D4 Julkaistu kehittämis- tai tutkimusraportti tai -selvitys ) - Signatures of ecological processes in microbial community time series (2018)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2018)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Stool Microbiota Composition Differs in Patients with Stomach, Colon, and Rectal Neoplasms (2018)
- Digestive Diseases and Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Alchemy & algorithms: perspectives on the philosophy and history of open science (2017)
- Research Ideas and Outcomes
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Comparative gut microbiota and resistome profiling of intensive care patients receiving selective digestive tract decontamination and healthy subjects (2017)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2017)
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Linking Statistical and Ecological Theory: Hubbell's Unified Neutral Theory of Biodiversity as a Hierarchical Dirichlet Process (2017)
- Proceedings of the IEEE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )



