Guillaume Jacquemet
 PhD


guillaume.jacquemet@utu.fi




ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-9286-920X

Julkaisut
  
null
  
null
  
1/4
  
null
  
null
  
  • Customizable FDM-based zebrafish larva mold for live imaging  (2026)  
    • Biology Open
     Rivera Pineda, Marcela Xiomara; Lehtimäki, Jaakko; Jacquemet, Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Fast label-free live imaging with FlowVision reveals key principles of cancer cell arrest on endothelial monolayers  (2026)  
    • EMBO Journal
     Follain, Gautier; Ghimire, Sujan; Pylvänäinen, Joanna W; Vaitkevičiūtė, Monika; Hidalgo-Cenalmor, Iván; Wurzinger, Diana; Guzmán, Camilo; Conway, James R W; Dibus, Michal; Härkönen, Jouni; Oikari, Sanna; Rilla, Kirsi; Salmi, Marko; Ivaska, Johanna; Jacquemet, Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Roadmap on deep learning for microscopy  (2026)  
    • JPhys photonics
     Volpe, Giovanni; Wahlby, Carolina; Tian, Lei; Hecht, Michael; Yakimovich, Artur; Monakhova, Kristina; Waller, Laura; Sbalzarini, Ivo F.; Metzler, Christopher A.; Xie, Mingyang; Zhang, Kevin; Lenton, Isaac C. D.; Rubinsztein-Dunlop, Halina; Brunner, Daniel; Bai, Bijie; Ozcan, Aydogan; Midtvedt, Daniel; Wang, Hao; Li, Tongyu; Sladoje, Natasa; Lindblad, Joakim; Smith, Jason T.; Ochoa, Marien; Barroso, Margarida; Intes, Xavier; Qiu, Tong; Yu, Li-Yu; You, Sixian; Liu, Yongtao; Ziatdinov, Maxim A.; Kalinin, Sergei, V; Sheridan, Arlo; Manor, Uri; Nehme, Elias; Goldenberg, Ofri; Shechtman, Yoav; Moberg, Henrik K.; Langhammer, Christoph; Spackova, Barbora; Helgadottir, Saga; Midtvedt, Benjamin; Argun, Aykut; Thalheim, Tobias; Cichos, Frank; Bo, Stefano; Hubatsch, Lars; Pineda, Jesus; Manzo, Carlo; Bachimanchi, Harshith; Selander, Erik; Homs-Corbera, Antoni; Franzl, Martin; De Haan, Kevin; Rivenson, Yair; Korczak, Zofia; Adiels, Caroline Beck; Mijalkov, Mite; Vereb, Daniel; Chang, Yu-Wei; Pereira, Joana B.; Matuszewski, Damian; Kylberg, Gustaf; Sintorn, Ida-Maria; Caicedo, Juan C.; Cimini, Beth A.; Lediju Bell, Muyinatu A.; Saraiva, Bruno M.; Jacquemet, Guillaume; Henriques, Ricardo; Ouyang, Wei; Le, Trang; Gomez-de-Mariscal, Estibaliz; Sage, Daniel; Munoz-Barrutia, Arrate; Lindqvist, Ebba Josefson; Bergman, Johanna
    (    A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)


  • Efficiently accelerated bioimage analysis with NanoPyx, a Liquid Engine-powered Python framework  (2025)  
    • Nature Methods
     Saraiva, Bruno M.; Cunha, Inês; Brito, António D.; Follain, Gautier; Portela, Raquel; Haase, Robert; Pereira, Pedro M.; Jacquemet, Guillaume; Henriques, Ricardo
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Nuclear talin-1 provides a bridge between cell adhesion and gene expression  (2025)  
    • iScience
     Da Silva, Alejandro J.; Hästbacka, Hendrik S. E.; Puustinen, Mikael C.; Pessa, Jenny C.; Luoto, Jens C.; Sundström, Erika; Goult, Benjamin T.; Jacquemet, Guillaume; Henriksson, Eva; Sistonen, Lea
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • PhotoFiTT: a quantitative framework for assessing phototoxicity in live-cell microscopy experiments  (2025)  
    • Nature Communications
     Del Rosario, Mario; Gómez-de-Mariscal, Estibaliz; Morgado, Leonor; Portela, Raquel; Jacquemet, Guillaume; Pereira, Pedro M.; Henriques, Ricardo
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Practical considerations for data exploration in quantitative cell biology  (2025)  
    • Journal of Cell Science
     Pylvänäinen, Joanna W.; Grobe, Hanna; Jacquemet, Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Practical recommendations for developing software for life science applications  (2025)  
    • Journal of Cell Science
     Pylvänäinen, Joanna W.; Jacquemet, Guillaume; Marcotti, Stefania
    (    B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )


  • Regulation of cell dynamics by rapid integrin transport through the biosynthetic pathway  (2025)  
    • Journal of Cell Biology
     Lerche, Martina; Mathieu, Mathilde; Hamidi, Hellyeh; Chastney, Megan; Jacquemet, Guillaume; Bruininks, Bart Marlon Herwig; Kaptan, Shreyas; Malerød, Lene; Pedersen, Nina Marie; Brech, Andreas; Matoba, Nobuyuki; Sato, Yuichiro; Vattulainen, Ilpo; Roca-Cusachs, Pere; Perez, Franck; Boncompain, Gaelle; Miserey, Stéphanie; Ivaska, Johanna
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Structural Repetition Detector for multi-scale quantitative mapping of molecular complexes through microscopy  (2025)  
    • Nature Communications
     Mendes, Afonso; Saraiva, Bruno M.; Jacquemet, Guillaume; Mamede, Joao I.; Leterrier, Christophe; Henriques, Ricardo
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Time, the final frontier  (2025)  
    • Molecular Oncology
     Follain, Gautier; Dibus, Michal; Joshi, Omkar; Jacquemet, Guillaume
    (    A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)


  • CellTracksColab is a platform that enables compilation, analysis, and exploration of cell tracking data  (2024)  
    • PLoS Biology
     Gómez-de-Mariscal, Estibaliz; Grobe, Hanna; Pylvänäinen, Joanna W.; Xénard, Laura; Henriques, Ricardo; Tinevez, Jean-Yves; Jacquemet, Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • DL4MicEverywhere: deep learning for microscopy made flexible, shareable and reproducible  (2024)  
    • Nature Methods
     Hidalgo-Cenalmor, Iván; Pylvänäinen, Joanna W.; Ferreira, Mariana G.; Russell, Craig T.; Saguy, Alon; Arganda-Carreras, Ignacio; Shechtman, Yoav; Jacquemet, Guillaume; Henriques, Ricardo; Gómez-de-Mariscal, Estibaliz; AI4Life Horizon Europe Program Consortium
    (    B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )


  • Harnessing artificial intelligence to reduce phototoxicity in live imaging  (2024)  
    • Journal of Cell Science
     Gómez-de-Mariscal Estibaliz, Del Rosario Mario, Pylvänäinen Joanna W, Jacquemet Guillaume, Henriques Ricardo
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Imaging cell architecture and dynamics  (2024)  
    • Journal of Cell Science
     Collinson, Lucy; Jacquemet, Guillaume
    (    B1 Vertaisarvioitu muu artikkeli (esim. pääkirjoitus, letter, comment) tieteellisessä lehdessä)


  • SHANK3 depletion leads to ERK signalling overdose and cell death in KRAS-mutant cancers  (2024)  
    • Nature Communications
     Lilja, Johanna; Kaivola, Jasmin; Conway, James R. W.; Vuorio, Joni; Parkkola, Hanna; Roivas, Pekka; Dibus, Michal; Chastney, Megan R.; Varila, Taru; Jacquemet, Guillaume; Peuhu, Emilia; Wang, Emily; Pentikäinen, Ulla; Posada, Itziar Martinez D.; Hamidi, Hellyeh; Najumudeen, Arafath K.; Sansom, Owen J.; Barsukov, Igor L.; Abankwa, Daniel; Vattulainen, Ilpo; Salmi, Marko; Ivaska, Johanna
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • TLNRD1 is a CCM complex component and regulates endothelial barrier integrity  (2024)  
    • Journal of Cell Biology
     Ball, Neil J.; Ghimire, Sujan; Follain, Gautier; Pajari, Ada O.; Wurzinger, Diana; Vaitkevičiūtė, Monika; Cowell, Alana R.; Berki, Bence; Ivaska, Johanna; Paatero, Ilkka; Goult, Benjamin T.; Jacquemet, Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Fast4DReg – fast registration of 4D microscopy datasets  (2023)  
    • Journal of Cell Science
     Pylvänäinen Joanna W., Laine Romain F., Saraiva Bruno M.S., Ghimire Sujan, Follain Gautier, Henriques Ricardo, Jacquemet Guillaume
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • High-fidelity 3D live-cell nanoscopy through data-driven enhanced super-resolution radial fluctuation  (2023)  
    • Nature Methods
     Laine R.F., Heil H.S., Coelho S., Nixon-Abell J., Jimenez A., Wiesner T., Martínez D., Galgani T., Régnier L., Stubb A., Follain G., Webster S., Goyette J., Dauphin A., Salles A., Culley S., Jacquemet G., Hajj B., Leterrier C., Henriques R.
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Live-cell imaging in the deep learning era  (2023)  
    • Current Opinion in Cell Biology
     Pylvänäinen Joanna W., Gómez-de-Mariscal Estibaliz, Henriques Ricardo, Jacquemet Guillaume
    (    A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)



Last updated on