Tomi Suomi - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Tomi Suomi

- dosentti,
lääketieteellinen tiedekunta (Turun yliopisto)
- tutkijatohtori,
Turun biotiedekeskus (erilliset laitokset)

Medical Bioinformatics Centre

tomi.suomi@utu.fi

+358 29 450 3803

Tykistökatu 6

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-3639-979X

Medical Bioinformatics Centre

Turku Bioscience

Julkaisut

4/5

Statistical and machine learning methods to study human CD4+ T cell proteome profiles (2022)
- Immunology Letters
Suomi Tomi, Elo Laura L
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)
- Diabetes Care
Suomi Tomi, Kalim Ubaid Ullah, Rasool Omid, Laiho Asta, Kallionpää Henna, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Mykkänen Juha, Härkönen Taina, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Veijola Riitta, Toppari Jorma, Knip Mikael, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Compressive stress-mediated p38 activation required for ERα + phenotype in breast cancer (2021)
- Nature Communications
Munne Pauliina M., Martikainen Lahja, Räty Iiris, Bertula Kia, Nonappa, Ruuska Janika, Ala-Hongisto Hanna, Peura Aino, Hollmann Babette, Euro Lilya, Yavuz Kerim, Patrikainen Linda, Salmela Maria, Pokki Juho, Kivento Mikko, Väänänen Juho, Suomi Tomi, Nevalaita Liina, Mutka Minna, Kovanen Panu, Leidenius Marjut, Meretoja Tuomo, Hukkinen Katja, Monni Outi, Pouwels Jeroen, Sahu Biswajyoti, Mattson Johanna, Joensuu Heikki, Heikkilä Päivi, Elo Laura L., Metcalfe Ciara, Junttila Melissa R., Ikkala Olli, Klefström Juha
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Data analysis tools for mass spectrometry proteomics (2021) Suomi Tomi
(G5 Artikkeliväitöskirja)
Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry in Metaproteomics of Gut Microbiota—Implementation and Computational Analysis (2020)
- Journal of Proteome Research
Juhani Aakko, Sami Pietilä, Tomi Suomi, Mehrad Mahmoudian, Raine Toivonen, Petri Kouvonen, Anne Rokka, Arno Hänninen, Laura L. Elo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Data Analysis Protocol for Quantitative Data-Independent Acquisition Proteomics. (2019)
- Methods in Molecular Biology
Functional Proteomics Pietilä S, Suomi T, Aakko J, Elo LL.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
A comprehensive evaluation of popular proteomics software workflows for label-free proteome quantification and imputation (2018)
- Briefings in Bioinformatics
Välikangas T, Suomi T, Elo LL
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection (2018)
- Nature Communications
Slim Fourati, Aarthi Talla, Mehrad Mahmoudian, Joshua G. Burkhart, Riku Klén, Ricardo Henao, Thomas Yu, Zafer Aydın, Ka Yee Yeung, Mehmet Eren Ahsen, Reem Almugbel, Samad Jahandideh, Xiao Liang, Torbjörn E.M. Nordling, Motoki Shiga, Ana Stanescu, Robert Vogel, The Respiratory Viral DREAM Challenge Consortium, Gaurav Pandey, Christopher Chiu, Micah T. McClain, Christopher W. Woods, Geoffrey S. Ginsburg, Laura L. Elo, Ephraim L. Tsalik, Lara M. Mangravite, Solveig K. Sieberts
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A systematic evaluation of normalization methods in quantitative label-free proteomics (2018)
- Briefings in Bioinformatics
Tommi Välikangas, Tomi Suomi, Laura L. Elo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Phosphonormalizer: an R package for normalization of MS-based label-free phosphoproteomics (2018)
- Bioinformatics
Sohrab Saraei, Tomi Suomi, Otto Kauko, Laura L. Elo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )