Kari Kopra - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Kari Kopra

- dosentti,
kemian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)
- yliopisto-opettaja,
lääkekehityksen kemia (kemian laitos)

khkopr@utu.fi

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-7585-6020

Julkaisut

1/3

ADP-ribosyltransferase-based biocatalysis of non-hydrolyzable NAD+ analogs (2025)
- Journal of Biological Chemistry
Sakari, Moona; Bhadane, Rajendra; Kumar, Sujit; Azevedo, Rita; Malakoutikhah, Morteza; Masoumi, Ahmadreza; Littler, Dene R; Härmä, Harri; Kopra, Kari; Pulliainen, Art To
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A nucleotide‐independent, pan‐RAS‐targeted DARPin elicits anti‐tumor activity in a multimodal manner (2025)
- Molecular Oncology
Kapp, Jonas N.; Verdurmen, Wouter P. R.; Schaefer, Jonas V.; Kopra, Kari; Nagy‐Davidescu, Gabriela; Richard, Elodie; Nokin, Marie‐Julie; Ernst, Patrick; Tamaskovic, Rastislav; Schwill, Martin; Degen, Ralph; Scholl, Claudia; Santamaria, David; Plückthun, Andreas
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Binding modes of the KRAS(G12C) inhibitors GDC-6036 and LY3537982 revealed by all atom molecular dynamics simulations (2025)
- Scientific Reports
Leini, Renne; Kapp, Jonas; Kopra, Kari; Pantsar, Tatu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Early insulin fibril detection: Insulin fibril research and TR structural transition detection with FRET-Probe (2025)
- Analytica Chimica Acta
Malakoutikhah, Morteza; Kauppi, Laura; Mäntylä, Kalle; Härmä, Harri; Kopra, Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Beyond KRAS(G12C): Biochemical and Computational Characterization of Sotorasib and Adagrasib Binding Specificity and the Critical Role of H95 and Y96 (2024)
- ACS Chemical Biology
Mahran, Randa; Kapp, Jonas N.; Valtonen, Salla; Champagne, Allison; Ning, Jinying; Gillette, William; Stephen, Andrew G.; Hao, Feng; Pluckthun, Andreas; Härmä, Harri; Pantsar, Tatu; Kopra, Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Fluorescence-Based Protein Stability Monitoring : A Review (2024)
- International Journal of Molecular Sciences
Gooran Negin, Kopra Kari
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Label-free electronic detection of peptide post-translational modification with functional enzyme-driven assay at the physical limit (2024)
- Cell Reports Physical Science
Macchia, Eleonora; Björkström, Kim; Tewari, Amit; Eskonen, Ville; Luukkonen, Axel; Ghafari, Amir Mohammad; Sarcina, Lucia; Caputo, Mariapia; Tong-Ochoa, Natalia; Kopra, Kari; Pettersson, Fredrik; Gounani, Zahra; Torsi, Luisa; Härmä, Harri; Österbacka, Ronald
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Luminescence-Based Techniques for KRAS Thermal Stability Monitoring (2024)
- Methods in Molecular Biology
KRAS : Methods and Protocols Kopra Kari
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Homogeneous luminescent quantitation of cellular guanosine and adenosine triphosphates (GTP and ATP) using QT-Luc GTP&ATP assay (2023)
- Analytical and Bioanalytical Chemistry
Kopra Kari, Mahran Randa, Yli-Hollo Titta, Tabata Sho, Vuorinen Emmiliisa, Fujii Yuki, Vuorinen Iida, Ogawa-Iio Aki, Hirayama Akiyoshi, Soga Tomoyoshi, Sasaki Atsuo T, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Isothermal chemical denaturation assay for monitoring protein stability and inhibitor interactions (2023)
- Scientific Reports
Mahran Randa, Vello Niklas, Komulainen Anita, Malakoutikhah Morteza, Härmä Harri, Kopra Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Nanomolar Protein Thermal Profiling with Modified Cyanine Dyes (2023)
- Analytical Chemistry
Malakoutikhah Morteza, Mahran Randa, Gooran Negin, Masoumi Ahmadreza, Lundell Katri, Liljeblad Arto, Guiley Keelan, Dai Shizhong, Zheng Qinheng, Zhu Lawrence, Shokat Kevan M., Kopra Kari, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Luminophore Chemistry for Detection of Urinary Bladder Cancer - Comparison to Cytology and Urinary Rapid Tests (BTA stat®, NMP22® BladderChek® and UBC® Rapid Test) (2022)
- Anticancer Research
Ecke Thorsten H, Scislowski Mikolaj, Hassan Nazia, Saura Mari, Hallmann Steffen, Koch Stefan, Vuolle Sari, Malakoutikhah Morteza, Kopra Kari, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Rapid high-throughput compatible label-free virus particle quantification method based on time-resolved luminescence (2022)
- Analytical and Bioanalytical Chemistry
Kopra Kari, Hassan Nazia, Vuorinen Emmiliisa, Valtonen Salla, Mahran Randa, Habib Huda, Jalkanen Pinja, Susi Petri, Hytönen Vesa, Hankaniemi Minna, Ylä-Herttuala Seppo, Kakkola Laura, Peurla Markus, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Thermal Shift Assay for Small GTPase Stability Screening: Evaluation and Suitability (2022)
- International Journal of Molecular Sciences
Kopra Kari, Valtonen Salla, Mahran Randa, Kapp Jonas N, Hassan Nazia, Gillette William, Dennis Bryce, Li Lianbo, Westover Kenneth D, Plückthun Andreas, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Methods to Monitor Ras Activation State (2021) Ras Activity and Signaling: Methods and Protocols Kopra Kari, Härmä Harri
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Protease substrate‐independent universal assay for monitoring digestion of native unmodified proteins (2021)
- International Journal of Molecular Sciences
Vuorinen Emmiliisa, Valtonen Salla, Hassan Nazia, Mahran Randa, Habib Huda, Malakoutikhah Morteza, Kopra Kari, Härmä, Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Sensitive, homogeneous, and label-free protein-probe assay for antibody aggregation and thermal stability studies (2021)
- mAbs
Valtonen Salla, Vuorinen Emmiliisa, Eskonen Ville, Malakoutikhah Morteza, Kopra Kari, Härmä Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Homogeneous Dual-Parametric-Coupled Assay for Simultaneous Nucleotide Exchange and KRAS/RAF-RBD Interaction Monitoring (2020)
- Analytical Chemistry
Kari Kopra, Emmiliisa Vuorinen, Maria Abreu-Blanco, Qi Wang, Ville Eskonen, William Gillette, Arto T. Pulliainen, Matthew Holderfield, Harri Härmä
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Homogeneous single-label cGMP detection platform for the functional study of nitric oxide-sensitive (soluble) guanylyl cyclases and cGMP-specific phosphodiesterases (2020)
- Scientific Reports
Kari Kopra, Iraida Sharina, Emil Martin, Harri Härmä
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Nanomolar Protein-Protein Interaction Monitoring with a Label-Free Protein-Probe Technique (2020)
- Analytical Chemistry
Valtonen S, Vuorinen E, Kariniemi T, Eskonen V, Le Quesne J, Bushell M, Härmä H, Kopra K
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )