Mikko Metsä-Ketelä
|
mianme@utu.fi
+358 29 450 4786
+358 50 436 6523
Tykistökatu 6
Turku
ABE
|
Asiantuntijuusalueet
Natural products; Streptomyces; biosynthesis
Tutkimus
http://abelab.utu.fi
Opetus
Molecular Biology
Structural Biology
Julkaisut
- MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration (2025) Zdouc, Mitja M.; Blin, Kai; Louwen, Nico L.L.; Navarro, Jorge; Loureiro, Catarina; Bader, Chantal D.; Bailey, Constance B.; Barra, Lena; Booth, Thomas J.; Bozhüyük, Kenan A.J.; Cediel-Becerra, José D.D.; Charlop-Powers, Zachary; Chevrette, Marc G.; Chooi, Yit Heng; D’Agostino, Paul M.; de Rond, Tristan; Del Pup, Elena; Duncan, Katherine R.; Gu, Wenjia; Hanif, Novriyandi; Helfrich, Eric J.N.; Jenner, Matthew; Katsuyama, Yohei; Korenskaia, Aleksandra; Krug, Daniel; Libis, Vincent; Lund, George A.; Mantri, Shrikant; Morgan, Kalindi D.; Owen, Charlotte; Phan, Chin-Soon; Philmus, Benjamin; Reitz, Zachary L.; Robinson, Serina L.; Singh, Kumar Saurabh; Teufel, Robin; Tong, Yaojun; Tugizimana, Fidele; Ulanova, Dana; Winter, Jaclyn M.; Aguilar, César; Akiyama, Daniel Y.; Al-Salihi, Suhad A.A.; Alanjary, Mohammad; Alberti, Fabrizio; Aleti, Gajender; Alharthi, Shumukh A.; Rojo, Mariela Y. Arias; Arishi, Amr A.; Augustijn, Hannah E.; Avalon, Nicole E.; Avelar-Rivas, J. Abraham; Axt, Kyle K.; Barbieri, Hellen B.; Barbosa, Julio Cesar J.; Barboza Segato, Lucas Gabriel; Barrett, Susanna E.; Baunach, Martin; Beemelmanns, Christine; Beqaj, Dardan; Berger, Tim; Bernaldo-Agüero, Jordan; Bettenbühl, Sandra M.; Bielinski, Vincent A.; Biermann, Friederike; Borges, Ricardo M.; Borriss, Rainer; Breitenbach, Milena; Bretscher, Kevin M.; Brigham, Michael W.; Buedenbender, Larissa; Bulcock, Brodie W.; Cano-Prieto, Carolina; Capela, João; Carrion, Victor J.; Carter, Riley S.; Castelo-Branco, Raquel; Castro-Falcón, Gabriel; Chagas, Fernanda O.; Charria-Girón, Esteban; Chaudhri, Ayesha Ahmed; Chaudhry, Vasvi; Choi, Hyukjae; Choi, Yukyung; Choupannejad, Roya; Chromy, Jakub; Donahey, Melinda S. Chue; Collemare, Jérôme; Connolly, Jack A.; Creamer, Kaitlin E.; Crüsemann, Max; Cruz, Andres Arredondo; Cumsille, Andres; Dallery, Jean-Felix; Damas-Ramos, Luis Caleb; Damiani, Tito; de Kruijff, Martinus; Martín, Belén Delgado; Sala, Gerardo Della; Dillen, Jelle; Doering, Drew T.; Dommaraju, Shravan R.; Durusu, Suhan; Egbert, Susan; Ellerhorst, Mark; Faussurier, Baptiste; Fetter, Artem; Feuermann, Marc; Fewer, David P.; Foldi, Jonathan; Frediansyah, Andri; Garza, Erin A.; Gavriilidou, Athina; Gentile, Andrea; Gerke, Jennifer; Gerstmans, Hans; Gomez-Escribano, Juan Pablo; González-Salazar, Luz A.; Grayson, Natalie E.; Greco, Claudio; Gomez, Juan E. Gris; Guerra, Sebastian; Flores, Shaday Guerrero; Gurevich, Alexey; Gutiérrez-García, Karina; Hart, Lauren; Haslinger, Kristina; He, Beibei; Hebra, Teo; Hemmann, Jethro L.; Hindra, Hindra; Höing, Lars; Holland, Darren C.; Holme, Jonathan E.; Horch, Therese; Hrab, Pavlo; Hu, Jie; Huynh, Thanh-Hau; Hwang, Ji-Yeon; Iacovelli, Riccardo; Iftime, Dumitrita; Iorio, Marianna; Jayachandran, Sidharth; Jeong, Eunah; Jing, Jiayi; Jung, Jung J.; Kakumu, Yuya; Kalkreuter, Edward; Kang, Kyo Bin; Kang, Sangwook; Kim, Wonyong; Kim, Geum Jin; Kim, Hyunwoo; Kim, Hyun Uk; Klapper, Martin; Koetsier, Robert A.; Kollten, Cassandra; Kovács, Ákos T.; Kriukova, Yelyzaveta; Kubach, Noel; Kunjapur, Aditya M.; Kushnareva, Aleksandra K.; Kust, Andreja; Lamber, Jessica; Larralde, Martin; Larsen, Niels J.; Launay, Adrien P.; Le, Ngoc-Thao-Hien; Lebeer, Sarah; Lee, Byung Tae; Lee, Kyungha; Lev, Katherine L.; Li, Shu-Ming; Li, Yong-Xin; Licona-Cassani, Cuauhtémoc; Lien, Annette; Liu, Jing; Lopez, Julius Adam V.; Machushynets, Nataliia V.; Macias, Marla I.; Mahmud, Taifo; Maleckis, Matiss; Martinez-Martinez, Añadir Maharai; Mast, Yvonne; Maximo, Marina F.; McBride, Christina M.; McLellan, Rose M.; Bhatt, Khyati Mehta; Melkonian, Chrats; Merrild, Aske; Metsä-Ketelä, Mikko; Mitchell, Douglas A.; Müller, Alison V.; Nguyen, Giang-Son; Nguyen, Hera T.; Niedermeyer, Timo H.J.; O’Hare, Julia H.; Ossowicki, Adam; Ostash, Bohdan O.; Otani, Hiroshi; Padva, Leo; Paliyal, Sunaina; Pan, Xinya; Panghal, Mohit; Parade, Dana S.; Park, Jiyoon; Parra, Jonathan; Rubio, Marcos Pedraza; Pham, Huong T.; Pidot, Sacha J.; Piel, Jörn; Pourmohsenin, Bita; Rakhmanov, Malik; Ramesh, Sangeetha; Rasmussen, Michelle H.; Rego, Adriana; Reher, Raphael; Rice, Andrew J.; Rigolet, Augustin; Romero-Otero, Adriana; Rosas-Becerra, Luis Rodrigo; Rosiles, Pablo Y.; Rutz, Adriano; Ryu, Byeol; Sahadeo, Libby-Ann; Saldanha, Murrel; Salvi, Luca; Sánchez-Carvajal, Eduardo; Santos-Medellin, Christian; Sbaraini, Nicolau; Schoellhorn, Sydney M.; Schumm, Clemens; Sehnal, Ludek; Selem, Nelly; Shah, Anjali D.; Shishido, Tania K.; Sieber, Simon; Silviani, Velina; Singh, Garima; Singh, Hemant; Sokolova, Nika; Sonnenschein, Eva C.; Sosio, Margherita; Sowa, Sven T.; Steffen, Karin; Stegmann, Evi; Streiff, Alena B.; Strüder, Alena; Surup, Frank; Svenningsen, Tiziana; Sweeney, Douglas; Szenei, Judit; Tagirdzhanov, Azat; Tan, Bin; Tarnowski, Matthew J.; Terlouw, Barbara R.; Rey, Thomas; Thome, Nicola U.; Torres Ortega, Laura Rosina; Tørring, Thomas; Trindade, Marla; Truman, Andrew W.; Tvilum, Marie; Udwary, Daniel W.; Ulbricht, Christoph; Vader, Lisa; van Wezel, Gilles P.; Walmsley, Max; Warnasinghe, Randika; Weddeling, Heiner G.; Weir, Angus N.M.; Williams, Katherine; Williams, Sam E.; Witte, Thomas E.; Rocca, Steffaney M. Wood; Yamada, Keith; Yang, Dong; Yang, Dongsoo; Yu, Jingwei; Zhou, Zhenyi; Ziemert, Nadine; Zimmer, Lukas; Zimmermann, Alina; Zimmermann, Christian; van der Hooft, Justin J.J.; Linington, Roger G.; Weber, Tilmann; Medema, Marnix H.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- ActVI-ORFA directs metabolic flux towards actinorhodin by preventing intermediate degradation (2024) Zhu, Xuechen; Wang, Rongbin; Siitonen, Vilja; Vuksanovic, Nemanja; Silvaggi, Nicholas R.; Melançon III, Charles E.; Metsä-Ketelä, Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Divergence of Classical and C-Ring-Cleaved Angucyclines : Elucidation of Early Tailoring Steps in Lugdunomycin and Thioangucycline Biosynthesis (2024) Nuutila Aleksi, Xiao Xiansha, van der Heul Helga U., van Wezel Gilles P., Dinis Pedro, Elsayed Somayah S., Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Diverse Combinatorial Biosynthesis Strategies for C-H Functionalization of Anthracyclinones (2024) Wang Rongbin, Nji Wandi Benjamin, Schwartz Nora, Hecht Jacob, Ponomareva Larissa, Paige Kendall, West Alexis, Desanti Kathryn, Nguyen Jennifer, Niemi Jarmo, Thorson Jon S., Shaaban Khaled A., Metsä-Ketelä Mikko, Nybo S. Eric
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Mechanism of Two-Component Mono-Oxygenases Involved in Anthracycline 1-Hydroxylation (2024) Wandi, Benjamin Nji; Dinis, Pedro; Siitonen, Vilja; Schneider, Gunter; Schnell, Robert; Metsä-Ketelä, Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Metabolic engineering of Streptomyces peucetius for biosynthesis of N,N-dimethylated anthracyclines (2024)
- Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
Hulst Mandy B., Zhang Le, van der Heul Helga U., Du Chao, Elsayed Somayah S., Koroleva Arina, Grocholski Thadee, Wander Dennis P. A., Metsa-Ketela Mikko, Neefjes Jacques J. C., van Wezel Gilles P.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Probing the nucleobase selectivity of RNA polymerases with dual-coding substrates (2024)
- Journal of Biological Chemistry
Mäkinen, Janne J.; Rosenqvist, Petja; Virta, Pasi; Metsä-Ketelä, Mikko; Belogurov, Georgiy A.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Bakteerien avulla antibiootteja mikrobi- ja syöpälääkkeiksi (2023) Metsä-Ketelä Mikko, Siitonen Vilja, Artukka Erika
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
- Co-factor independent oxidases ncnN and actVA-3 are involved in the dimerization of benzoisochromanequinone antibiotics in naphthocyclinone and actinorhodin biosynthesis (2023)
- FEMS Microbiology Letters
Baral Bikash, Matroodi Soheila, Siitonen Vilja, Thapa Keshav, Akhgari Amir, Yamada Keith, Nuutila Aleksi, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Engineering BioBricks for Deoxysugar Biosynthesis and Generation of New Tetracenomycins (2023) Tirkkonen Heli, Brown Katelyn V, Niemczura Magdalena, Faudemer Zélie, Brown Cortney, Ponomareva Larissa V , Helmy Yorsta A, Thorson Jon S, Nybo S Eric, Metsä-Ketelä Mikko, Shaaban Khaled A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Evolution-inspired engineering of anthracycline methyltransferases (2023) Dinis Pedro, Tirkkonen Heli, Nji Wandi Benjamin N, Siitonen Vilja, Niemi Jarmo, Grocholski Thadée, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Pseudouridine-Modifying Enzymes SapB and SapH Control Entry into the Pseudouridimycin Biosynthetic Pathway (2023) Artukka Erika, Schnell Robert, Palmu Kaisa, Rosenqvist Petja, Szodorai Edit, Niemi Jarmo, Virta Pasi, Schneider Gunter, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Unravelling key enzymatic steps in C-ring cleavage during angucycline biosynthesis (2023) Elsayed Somayah S., van der Heul Helga U., Xiao Xiansha, Nuutila Aleksi, Baars Laura R., Wu Changsheng, Metsä-Ketelä Mikko, van Wezel Gilles P.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- A BioBricks Metabolic Engineering Platform for the Biosynthesis of Anthracyclinones in Streptomyces coelicolor (2022) Wang Rongbin, Nguyen Jennifer, Hecht Jacob, Schwartz Nora, Brown Katelyn V, Ponomareva Larissa V, Niemczura Magdalena, van Dissel Dino, van Wezel Gilles P, Thorson Jon S, Metsä-Ketelä Mikko, Shaaban Khaled A, Nybo S Eric
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Anthracyclines: biosynthesis, engineering and clinical applications (2022) Hulst Mandy B., Grocholski Thadee, Neefjes Jacques J.C., van Wezel Gilles P., Metsä-Ketelä Mikko
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
- Fluorogenic RNA aptamers to probe transcription initiation and co-transcriptional RNA folding by multi-subunit RNA polymerases (2022) Methods in Enzymology Huang Yong-Heng, Trapp Vilma, Puro Oskari, Mäkinen Janne J., Metsä-Ketelä Mikko, Wahl Markus C., Belogurov Georgiy A.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
- Single cell mutant selection for metabolic engineering of actinomycetes (2022) Akhgari Amir., Baral Bikash, Koroleva Arina, Siitonen Vilja, Fewer David P., Melançon Charles E., Rahkila Jani, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- The role of the maleimide ring system on the structure-activity relationship of showdomycin (2022)
- European Journal of Medicinal Chemistry
Rosenqvist Petja, Mäkinen Janne J, Palmu Kaisa, Jokinen Johanna, Prajapati Ranjit K, Korhonen Heidi J, Virta Pasi, Belogurov Georgiy A, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Biosynthesis of Diverse Type II Polyketide Core Structures in Streptomyces coelicolor M1152 (2021) Zhu Xuechen, Siitonen Vilja, Melancon III Charles E, Metsä-Ketelä Mikko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
- Deciphering the Origin and Formation of Aminopyrrole Moiety in Kosinostatin Biosynthesis (2021)
- Chinese Journal of Chemistry
Hu Yu, Zhou Qiang, Zhang Zhuan, Pan Hai-Xue, Ilina Yulia, Metsä-Ketelä Mikko, Igarashi Yasuhiro, Tang Gong-Li
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
