Vilja Siitonen
PhD (FT)
vksiit@utu.fi Tykistökatu 6 Turku Työhuone: 6108 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-1444-2622 |
Asiantuntijuusalueet
Molekyylibiologia; Proteiinibiologia; Bioaktiiviset pienyhdisteet; Mikrobiologia, Fermentaatio; Biotransformaatio, HPLC, MS, NMR, GC
Molekyylibiologia; Proteiinibiologia; Bioaktiiviset pienyhdisteet; Mikrobiologia, Fermentaatio; Biotransformaatio, HPLC, MS, NMR, GC
Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe
Photosynthetic Microbes group
Photosynthetic Microbes group
Biografia
Erikoistutkija, Fotosynteettiset mikrobit -tutkimusryhmä (www.utu.fi/photo-microbes) (2025–
Tutkijatohtori, Fotosynteettiset mikrobit -tutkimusryhmä (2020–2025)
Tutkijatohtori, ABE – Antibioottien biosynteesin muuntelu -tutkimusryhmä (https://abelab.utu.fi) (2017–2020)
Väitöskirjatyöntekijä, ABE – Antibioottien biosynteesin muuntelu -tutkimusryhmä (2011–2016)
Tutkimusavustaja, ABE – Antibioottien biosynteesin muuntelu -tutkimusryhmä (2009–2010)
Kesäharjoittelija, Salzburgin yliopisto (https://www.plus.ac.at/) (2007)
Tutkimus
Tutkimukseni fotosynteettiset mikrobit -tutkimusryhmässä keskittyy viherlevien ja syanobakteerien hyödyntämiseen biokatalyytteinä tai solutehtaina.
Aiempi tutkumukseni ABE-rtutkimusryhmässä keskittyi maaperäbakteereihin, niiden fermentointiin, geneettisen muunteluun ja niiden tuottamien yhdisteiden rakennetutkimukseen, sekä antibioottien biosynteesiin osallistuvien proteiinien toiminnan tutkimukseen.
Opetus
Olen opettanut osia seuraavilla kursseilla:
Photosynthetic Biotechnologies (DIBT0608-3001) (2025)
Applied Photosynthesis Research - Theory (KABI4015) (2023, 2024)
Applied Photosynthesis Research - Practical (KABI4016-3002) (2021, 2022)
Harjoitustyö biokemian tutkimusryhmässä I/II (BKEM1028/1029) (2011–2019, 8 krt.)
Molekyylibiologian harjoitustyöt (BKEM1010) (2011)
Olen ohjannut opinnäytetöitä opintojen eri tasoilla.
Olen suorittanut yliopistopedagogiikkaa 10 op.
Julkaisut 
1/2
- ActVI-ORFA directs metabolic flux towards actinorhodin by preventing intermediate degradation (2024)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Employing photocurable biopolymers to engineer photosynthetic 3D-printed living materials for production of chemicals (2024)
- Green Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Mechanism of Two-Component Mono-Oxygenases Involved in Anthracycline 1-Hydroxylation (2024)
- ACS Catalysis
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Sucrose as an electron source for cofactor regeneration in recombinant Escherichia coli expressing invertase and a Baeyer Villiger monooxygenase (2024)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Bakteerien avulla antibiootteja mikrobi- ja syöpälääkkeiksi (2023)
- Duodecim
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Bioinspired mechanically stable all-polysaccharide based scaffold for photosynthetic production (2023)
- Journal of Materials Chemistry. B
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Co-factor independent oxidases ncnN and actVA-3 are involved in the dimerization of benzoisochromanequinone antibiotics in naphthocyclinone and actinorhodin biosynthesis (2023)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Engineered green alga Chlamydomonas reinhardtii as a whole-cell photosynthetic biocatalyst for stepwise photoproduction of H-2 and ε-caprolactone (2023)
- Green Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolution-inspired engineering of anthracycline methyltransferases (2023)
- PNAS nexus
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Mapping Nanocellulose- and Alginate-Based Photosynthetic Cell Factory Scaffolds: Interlinking Porosity, Wet Strength, and Gas Exchange (2023)
- Biomacromolecules
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Photosynthetically produced sucrose by immobilized Synechocystis sp. PCC 6803 drives biotransformation in E. coli (2022)
- Biotechnology for Biofuels and Bioproducts
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Single cell mutant selection for metabolic engineering of actinomycetes (2022)
- Metabolic Engineering
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Biosynthesis of Diverse Type II Polyketide Core Structures in Streptomyces coelicolor M1152 (2021)
- ACS Synthetic Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differential regulation of undecylprodigiosin biosynthesis in the yeast-scavenging Streptomyces strain MBK6 (2021)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolution‐Guided Engineering of Non‐Heme Iron Enzymes Involved in Nogalamycin Biosynthesis (2020)
- FEBS Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Genotyping-Guided Discovery of Persiamycin A From Sponge-Associated Halophilic Streptomonospora sp. PA3 (2020)
- Frontiers in microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structural characterization of three noncanonical NTF2-like superfamily proteins: implications for polyketide biosynthesis (2020)
- Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The Rieske Oxygenase SnoT Catalyzes 2''-Hydroxylation of L-Rhodosamine in Nogalamycin Biosynthesis (2020)
- ChemBioChem
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Enzymatic Synthesis of the C-glycosidic Moiety of Nogalamycin R (2018)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Discovery of the Showdomycin Gene Cluster from Streptomyces showdoensis ATCC 15227 Yields Insight into the Biosynthetic Logic of C-Nucleoside Antibiotics (2017)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali