Vilja Siitonen
PhD (FT)
vksiit@utu.fi Tykistökatu 6 Turku Työhuone: 6108 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-1444-2622 |
Molekyylibiologia; Proteiinibiologia; Bioaktiiviset pienyhdisteet; Mikrobiologia, Biotransformaatio, HPLC, MS, NMR, GC
Photosynthetic Microbes group
Työskentelen tutkijana Photomicrobes-tutkimusryhmässä, jota johtaa professori Yagut Allahverdiyeva-Rinne (www.utu.fi/photo-microbes). Keskityn muunneltujen Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis sp. PCC 6803 tuottamiin yhdisteisiin tai kantojen käyttämiseen fotosynteettisinä solutehtaina. Aiemmassa postdoc-tutkimuksessani tutkin bioaktiivisia sekundaarimetaboliitteja, etenkin keskittyen niiden rakennetutkimukseen NMR:n avulla. Valmistuin tohtoriksi vuonna 2016 ja väitöskirjatutkimukseni keskittyi streptomykeettien sekundaarimetaboliaan, etenkin antrasykliiniantibiootti nogalamysiinin biosynteesiin. Maisteriksi valmistuin 2010, Pro gradu -tutkielmani keskittyi streptomykeettien rasva-aineenvaihduntaan. Ennen valmistumistani vietin vaihtovuoden 2005-2006 Itävallassa, Salzburgissa.
Tutkin viherleviä ja syanobakteereja. Niiden tuottamia yhdisteitä ja niiden tekemiä biotransformaatioita. Aiemmin olen tutkinut streptomykeettien tuottamia yhdisteitä.
Olen opettanut vedyntuotantoa ja sen mittausta sekä biotransformaatiota käyttäen mikroleviä osana fotosynteesikurssia (2022).
Olen opettanut biotransformaatio-kurssin osana fotosynteesilaboratoriokurssia (2022).
Olen pitänyt HPLC-kurssin pigmenttien tutkimiseen osana osana fotosynteesilaboratoriokurssia (2021).
Olen opettanut molekyylibiologian kurssin koskien streptomykeettien geneettistä muokkausta ja yhdisteiden erottamista (2011).
Lisäksi ohjaan yhtä maisterintutkielmaa ja olen ohjannut 2 maisterivaiheen erikoistyötä ja gradun, 3 luonnontieteen kandidaatin tutkielmaa ja olen suunnitellut ja ohjannut 12 projektityöntekijän laboratoriatyötä (1-6 kuukautta).
- ActVI-ORFA directs metabolic flux towards actinorhodin by preventing intermediate degradation (2024)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Employing photocurable biopolymers to engineer photosynthetic 3D-printed living materials for production of chemicals (2024)
- Green Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Mechanism of Two-Component Mono-Oxygenases Involved in Anthracycline 1-Hydroxylation (2024)
- ACS Catalysis
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Sucrose as an electron source for cofactor regeneration in recombinant Escherichia coli expressing invertase and a Baeyer Villiger monooxygenase (2024)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Bakteerien avulla antibiootteja mikrobi- ja syöpälääkkeiksi (2023)
- Duodecim
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Bioinspired mechanically stable all-polysaccharide based scaffold for photosynthetic production (2023)
- Journal of Materials Chemistry B
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Co-factor independent oxidases ncnN and actVA-3 are involved in the dimerization of benzoisochromanequinone antibiotics in naphthocyclinone and actinorhodin biosynthesis (2023)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Engineered green alga Chlamydomonas reinhardtii as a whole-cell photosynthetic biocatalyst for stepwise photoproduction of H-2 and ε-caprolactone (2023)
- Green Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolution-inspired engineering of anthracycline methyltransferases (2023)
- PNAS nexus
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Mapping Nanocellulose- and Alginate-Based Photosynthetic Cell Factory Scaffolds: Interlinking Porosity, Wet Strength, and Gas Exchange (2023)
- Biomacromolecules
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Photosynthetically produced sucrose by immobilized Synechocystis sp. PCC 6803 drives biotransformation in E. coli (2022)
- Biotechnology for Biofuels and Bioproducts
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Single cell mutant selection for metabolic engineering of actinomycetes (2022)
- Metabolic Engineering
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Biosynthesis of Diverse Type II Polyketide Core Structures in Streptomyces coelicolor M1152 (2021)
- ACS Synthetic Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differential regulation of undecylprodigiosin biosynthesis in the yeast-scavenging Streptomyces strain MBK6 (2021)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolution‐Guided Engineering of Non‐Heme Iron Enzymes Involved in Nogalamycin Biosynthesis (2020)
- FEBS Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Genotyping-Guided Discovery of Persiamycin A From Sponge-Associated Halophilic Streptomonospora sp. PA3 (2020)
- Frontiers in Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structural characterization of three noncanonical NTF2-like superfamily proteins: implications for polyketide biosynthesis (2020)
- Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The Rieske Oxygenase SnoT Catalyzes 2''-Hydroxylation of L-Rhodosamine in Nogalamycin Biosynthesis (2020)
- ChemBioChem
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Enzymatic Synthesis of the C-glycosidic Moiety of Nogalamycin R (2018)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Discovery of the Showdomycin Gene Cluster from Streptomyces showdoensis ATCC 15227 Yields Insight into the Biosynthetic Logic of C-Nucleoside Antibiotics (2017)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
