Jarmo Niemi
Ph.D.
jarnie@utu.fi +358 29 450 4701 +358 50 470 4758 Tykistökatu 6 Turku Työhuone: B6130 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-7447-8379 |
Asiantuntijuusalueet
Antibioottien biosynteesi; Streptomyces'in biologia; proteiinitutkimus
Antibioottien biosynteesi; Streptomyces'in biologia; proteiinitutkimus
Biografia
Olen syntynyt Porissa 1958, valmistunut FK:ksi Turun yliopistosta 1983 ja suorittanut FT-tutkinnon 1998. Biokemian y.p. lehtoriksi minut nimitettiin 2005.
Olen naimisissa, ja minulla on 2 lasta.
Tutkimus
Olen työskennellyt antibioottien biosynteesin parissa ensin lääketehdas Leiraksessa ja sittemmin Turun yliopistossa.
Väittelin 1995 aiheesta "Hybrid
Anthracycline Antibiotics: Analysis and
Application
of Rhodomycin Biosynthetic Genes from Streptomyces purpurascens"
Tutkimustyöni
on käsitellyt antibioottien biosynteesin molekyylibiologiaa,
entsyymitutkimusta ja entsyymien rakennebiologiaa. Osallistun nykyään
tutkimusryhmän "Antibiotic biosynthesis engineering".(http://abelab.utu.fi/) tutkimuksiin.
Opetus
Opetan useita biokemian peruskursseja Turun yliopistossa: BKEM5030 Solu ja biomolekyylit-teoria ,
BKEM5010 Mikrobiologia-teoria, BKEM5011 Mikrobiologia-käytäntö ja osittain BKEM5160 Solu ja energia-teoria ja BKEM5161 Solu ja energia-käytäntö.
Lisäksi opetan kurssia BJ01A1060 Biokemian perusteet Lappeenrannan teknillisessä yliopistossa.
Julkaisut 
1/2
- (2024)
- ACS Synthetic Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Pseudouridine-Modifying Enzymes SapB and SapH Control Entry into the Pseudouridimycin Biosynthetic Pathway (2023)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differential regulation of undecylprodigiosin biosynthesis in the yeast-scavenging Streptomyces strain MBK6 (2021)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Characterization of C-nucleoside Antimicrobials from Streptomyces albus DSM 40763: Strepturidin is Pseudouridimycin (2019
- Scientific Reports
- Evolutionary Trajectories for the Functional Diversification of Anthracycline Methyltransferases (2019)
- ACS Chemical Biology
- Discovery of the Showdomycin Gene Cluster from Streptomyces showdoensis ATCC 15227 Yields Insight into the Biosynthetic Logic of C-Nucleoside AntibioticsTracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE2017
- ACS Chemical BiologyBiochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Divergent evolution of an atypical S-adenosyl-L-methionine-dependent monooxygenase involved in anthracycline biosynthesis2015
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of AmericaTetrahedron: Asymmetry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Coordinate changes in gene expression and triacylglycerol composition in the developing seeds of oilseed rape (Brassica napus) and turnip rape (Brassica rapa)Biosynthetic pathway toward carbohydrate-like moieties of alnumycins contains unusual steps for C-C bond formation and cleavage2014
- Food ChemistryProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2014)
- Chemistry and BiologyJournal of Bacteriology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Expression of genes encoding enzymes in the triacylglycerol biosynthesis pathway in developing oilseed rape (Brassica napus) and turnip rape (Brassica rapa) seeds (2013) EuroFoodChem XVII Anssi L. Vuorinen, Marika Kalpio, Maaria Kortesniemi, Kaisa Linderborg, Baoru Yang, Kirsi Lehto, Jarmo Niemi, Heikki P. Kallio
(O2 Muu julkaisu ) - Structural and Functional Analysis of Angucycline C-6 Ketoreductase LanV Involved in Landomycin Biosynthesis (2013)
- BiochemistryChemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2013)
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of AmericaComputational and Theoretical Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2013)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Alnumycins A2 and A3: new inverse-epimeric pairs stereoisomeric to alnumycin A1 (2012)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2012)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Characterization of the Two-Component Monooxygenase System AlnT/AlnH Reveals Early Timing of Quinone Formation in Alnumycin Biosynthesis (2012)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Epimers vs. inverse epimers: the C-1 configuration in alnumycin A1 (2012)
- RSC Advances
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Tailoring Enzymes Involved in the Biosynthesis of Angucyclines Contain Latent Context-Dependent Catalytic Activities (2012)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The potential of VCD to resolve the epimer vs. inverse epimer quandary (2012)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Flavoprotein Hydroxylase PgaE Catalyzes Two Consecutive Oxygen-Dependent Tailoring Reactions in Angucycline Biosynthesis (2011)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali