Jarmo Niemi
Ph.D.
jarnie@utu.fi +358 29 450 4701 +358 50 470 4758 Tykistökatu 6 Turku Työhuone: B6130 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-7447-8379 |
Antibioottien biosynteesi; Streptomyces'in biologia; proteiinitutkimus
Olen syntynyt Porissa 1958, valmistunut FK:ksi Turun yliopistosta 1983 ja suorittanut FT-tutkinnon 1998. Biokemian y.p. lehtoriksi minut nimitettiin 2005.
Olen naimisissa, ja minulla on 2 lasta.
Olen työskennellyt antibioottien biosynteesin parissa ensin lääketehdas Leiraksessa ja sittemmin Turun yliopistossa.
Väittelin 1995 aiheesta "Hybrid
Anthracycline Antibiotics: Analysis and
Application
of Rhodomycin Biosynthetic Genes from Streptomyces purpurascens"
Tutkimustyöni
on käsitellyt antibioottien biosynteesin molekyylibiologiaa,
entsyymitutkimusta ja entsyymien rakennebiologiaa. Osallistun nykyään
tutkimusryhmän "Antibiotic biosynthesis engineering".(http://abelab.utu.fi/) tutkimuksiin.
Opetan useita biokemian peruskursseja Turun yliopistossa: BKEM5030 Solu ja biomolekyylit-teoria ,
BKEM5010 Mikrobiologia-teoria, BKEM5011 Mikrobiologia-käytäntö ja osittain BKEM5160 Solu ja energia-teoria ja BKEM5161 Solu ja energia-käytäntö.
Lisäksi opetan kurssia BJ01A1060 Biokemian perusteet Lappeenrannan teknillisessä yliopistossa.
- Diverse Combinatorial Biosynthesis Strategies for C-H Functionalization of Anthracyclinones (2024)
- ACS Synthetic Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Pseudouridine-Modifying Enzymes SapB and SapH Control Entry into the Pseudouridimycin Biosynthetic Pathway (2023)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differential regulation of undecylprodigiosin biosynthesis in the yeast-scavenging Streptomyces strain MBK6 (2021)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Characterization of C-nucleoside Antimicrobials from Streptomyces albus DSM 40763: Strepturidin is Pseudouridimycin (2019)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evolutionary Trajectories for the Functional Diversification of Anthracycline Methyltransferases (2019)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Discovery of the Showdomycin Gene Cluster from Streptomyces showdoensis ATCC 15227 Yields Insight into the Biosynthetic Logic of C-Nucleoside Antibiotics (2017)
- ACS Chemical Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Divergent evolution of an atypical S-adenosyl-L-methionine-dependent monooxygenase involved in anthracycline biosynthesis (2015)
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Coordinate changes in gene expression and triacylglycerol composition in the developing seeds of oilseed rape (Brassica napus) and turnip rape (Brassica rapa) (2014)
- Food Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structure-Based Engineering of Angucyclinone 6-Ketoreductases. (2014)
- Chemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Expression of genes encoding enzymes in the triacylglycerol biosynthesis pathway in developing oilseed rape (Brassica napus) and turnip rape (Brassica rapa) seeds (2013) EuroFoodChem XVII Anssi L. Vuorinen, Marika Kalpio, Maaria Kortesniemi, Kaisa Linderborg, Baoru Yang, Kirsi Lehto, Jarmo Niemi, Heikki P. Kallio
(O2 Muu julkaisu ) - Structural and Functional Analysis of Angucycline C-6 Ketoreductase LanV Involved in Landomycin Biosynthesis (2013)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structural basis for C-ribosylation in the alnumycin A biosynthetic pathway (2013)
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE (2013)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Alnumycins A2 and A3: new inverse-epimeric pairs stereoisomeric to alnumycin A1 (2012)
- Tetrahedron: Asymmetry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Biosynthetic pathway toward carbohydrate-like moieties of alnumycins contains unusual steps for C-C bond formation and cleavage (2012)
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Characterization of the Two-Component Monooxygenase System AlnT/AlnH Reveals Early Timing of Quinone Formation in Alnumycin Biosynthesis (2012)
- Journal of Bacteriology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Epimers vs. inverse epimers: the C-1 configuration in alnumycin A1 (2012)
- RSC Advances
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Tailoring Enzymes Involved in the Biosynthesis of Angucyclines Contain Latent Context-Dependent Catalytic Activities (2012)
- Chemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The potential of VCD to resolve the epimer vs. inverse epimer quandary (2012)
- Computational and Theoretical Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Flavoprotein Hydroxylase PgaE Catalyzes Two Consecutive Oxygen-Dependent Tailoring Reactions in Angucycline Biosynthesis (2011)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )