Dosentti (Adjunct professor) Juha Mykkänen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Juha Mykkänen
Dosentti (Adjunct professor)

- erikoistutkija,
sydäntutkimuskeskus (väestötutkimuskeskus)
- dosentti,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

juha.mykkanen@utu.fi

+358 29 450 4364

+358 50 406 3612

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Työhuone: B503

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9898-2660

Selected 20 Publications.pdf

The Cardiovascular Risk in Young Finns Study (YFS)

Asiantuntijuusalueet

sydän- ja verisuonitautien riskitekijät; obesiteetti; metaboliset taudit; molekyyligenetiikka; genomiikka; metabolomiikka; transkriptomiikka; lipidomiikka; data-analyysi; statistiikka; tyypin 1 diabetes; lysinuurinen proteiini-intoleranssi; tutkimusprojektisuunnittelu

Biografia

KOULUTUS JA OPPIARVO

2015 Dosentti (Molekyyligenetiikka), Turun yliopisto
2003 FT, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1998 FM, Perinnöllisyystiede, Turun yliopisto

TÄMÄNHETKINEN ASEMA

Erikoistutkija, Sydäntutkimuskeskus, Lääketieteellinen tiedekunta, Turun yliopisto

AIKAISEMPI TYÖKOKEMUS

2009 – 2015 Erikoistutkija, Type 1 Diabetes Prediction and Prevention (DIPP) -tutkimus, Lasten ja nuorten klinikka, Turun yliopistollinen keskussairaala (Tyks)
2005 – 2008 Suomen Akatemian Tutkijatohtori, Turun Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
2003 – 2008 Post-doc -tutkija, Turku Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
1998 – 2003 Tohtoriopiskelija, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
2000 – 2002 Tuntiopettaja (osa-aikainen), Biologian laitos, Turun yliopisto
1998 – 1999 Assistentti (8 kk), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1995 – 1997 Tutkimusavustaja (osa-aikainen), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto

Tutkimus

Olen koko tutkimusurani ajan tehnyt ihmisen terveyteen liittyvää tutkimusta. Tämä alkoi jo perusopintojeni aikana pro-gradu –vaiheessa työskennellessäni Turun yliopiston Lääketieteellisen genetiikan osastolla dos. Jaana Lähdetien tutkimusryhmässä aiheenani sädehoitoa saaneiden kivessyöpäpotilaiden siittiöiden aneuploidia. Tämän jälkeen olen perehtynyt lastentautien molekyyligenetiikkaan. Väitöskirjatyössäni tutkin perinnöllisen LPI-taudin molekyyligenetiikkaa emeritusprofessori Pertti Aulan ohjauksessa. Tänä aikana perehdyin lääketieteellisen genetiikan tutkimusalaan, erilaisiin ihmisgenomiikan menetelmiin ja nk. suomalaiseen tautiperintöön.

Tutkimusurani post-doc –vaiheessa siirryin Turun Biotekniikan Keskukseen tutkimaan tyypin 1 diabetesta osana suomalaista Tyypin 1 diabeteksen ennustaminen ja ehkäisy (DIPP) –tutkimusta, mentoreinani ja esimiehinäni emeritusprofessori Olli Simell ja professori Riitta Lahesmaa. Tänä aikana perehdyin tyypin 1 diabetekseen, molekyyli-immunologiaan ja erilaisiin genominlaajuisiin biolääketieteen tutkimusmenetelmiin, kuten cDNA- ja DNA-mikrosirut. Post-doc –kaudella toimin 2005-2008 Suomen Akatemian tutkijatohtorina, aiheena Tyypin 1 diabeteksen molekylaariset markkerit, missä DIPP-tutkimuslasten näytteitä tutkittiin eri mikrosirumenetelmin (Affymetrix ja Illumina) tarkoituksena löytää geenejä tai geeniverkkoja, joiden toiminta muuttuu varhaisessa vaiheessa tyypin 1 diabeteksen taudinkehityksen aikana.

Tutkimusurani kolmas vaihe alkoi vuoden 2009 alusta siirtyessäni tutkijaksi DIPP-tutkimusklinikalle (Lasten ja nuorten klinikka, Tyks) emeritusprofessori Olli Simellin alaisuuteen. Tutkimukseni tavoitteena oli löytää Tyypin 1 diabeteksen autoimmuniteetin puhkeamiseen vaikuttavia tekijöitä.

Tutkimusurani neljäs vaihe alkoi maaliskuussa 2015 siirryttyäni erikoistutkijaksi Sydäntutkimuskeskukseen Akatemiaprofessori Olli Raitakarin koordinoimaan LASERI-tutkimukseen, missä tutkitaan sydän- ja verisuonitautien riskitekijöitä lapsuudesta aikuisuuteen. Kuten edellä kuvatuissa tutkimuksissa, myös LASERI hyödyntää ansiokkaasti erilaisia omiikkatyökaluja bionäytteiden tutkimiseen. Tutkimukseni päätavoitteena on lisätä ymmärrystämme kardiovaskulaaristen ja metabolisten tautien patofysiologiasta ja em. sairauksien riskitekijöiden monitahoisista yhteyksistä ihmisen genomiin, transkriptomiin ja metaboliaan.

Opetus

Opetustehtäviini kuuluu nuorten (bio)lääketieteen opiskelijoiden ohjaus joko syventävissä tai väitöskirjaan tähtäävissä jatko-opinnoissa.

Julkaisut

1/4

Association of leisure time physical activity with gut microbiota composition in early adulthood (2025)
- Scientific Reports
Boelius, Hanna-Mari; Aatsinki, Anna-Katariina; Heiskanen, Marja A.; Haapala, Eero A.; Munukka, Eveliina; Mykkänen, Juha; Kartiosuo, Noora; Lahti, Leo; Keskitalo, Anniina; Huovinen, Pentti; Niinikoski, Harri; Viikari, Jorma; Rönnemaa, Tapani; Lagström, Hanna; Jula, Antti; Rovio, Suvi P.; Raitakari, Olli T.; Pahkala, Katja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Blood pressure in childhood, young- and mid-adulthood: association with carotid plaque severity (2025)
- European Heart Journal
Meng, Yaxing; Koskinen, Juhani S.; Thomson, Russell; Juonala, Markus; Pahkala, Katja; Mykkanen, Juha; Rovio, Suvi P.; Kaehoenen, Mika; Lehtimaki, Terho; Viikari, Jorma S. A.; Raitakari, Olli T.; Magnussen, Costan G.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Cardiometabolic determinants of aortic and carotid intima-media thickness in adolescence (2025)
- Atherosclerosis
Laitinen, Tomi T.; Mikola, Hanna; Pahkala, Katja; Mykkänen, Juha; Rovio, Suvi P.; Niinikoski, Harri; Rönnemaa, Tapani; Viikari, Jorma S. A.; Jula, Antti; Lagström, Hanna; Salo, Pia; Nuotio, Joel; Ala-Korpela, Mika; Juonala, Markus; Magnussen, Costan G.; Raitakari, Olli T.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Association of Serum Trimethylamine-N-Oxide Concentration from Childhood to Early Adulthood with Age and Sex (2024)
- Clinical Chemistry
Almer, Gunter; Enko, Dietmar; Kartiosuo, Noora; Niinikoski, Harri; Lehtimäki, Terho; Munukka, Eveliina; Viikari, Jorma; Rönnemaa, Tapani; Rovio, Suvi P; Mykkänen, Juha; Lagström, Hanna; Jula, Antti; Herrmann, Markus; Raitakari, Olli T; Meinitzer, Andreas; Pahkala, Katja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Associations of Cumulative Adulthood, Childhood and Lifelong Insulin With Adulthood Retinal Microvasculature (2024)
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism
Repo, Oskari; Juonala, Markus; Rovio, Suvi P.; Mykkänen, Juha; Nevalainen, Jaakko; Kähönen, Mika; Lehtimäki, Terho; Laitinen, Tomi P.; Viikari, Jorma; Raitakari, Olli; Tapp, Robyn; Pahkala, Katja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Early intermittent hyperlipidaemia alters tissue macrophages to fuel atherosclerosis (2024)
- Nature
Takaoka, M; Zhao, X; Lim, HY, Magnussen, CG; Ang, O; Suffee, N; Schrank, PR; Ong, WS; Tsiantoulas, D; Sommer, F; Mohanta, SK; Harrison, J; Meng, Y; Laurans, L; Wu, F; Lu, Y; Masters, L; Newland, SA; Denti, L; Hong, M; Chajadine, M; Juonala, M; Koskinen, JS; Kähönen, M; Pahkala, K; Rovio, SP; Mykkänen, J; Thomson, R; Kaisho, T; Habenicht, AJR; Clement, M; Tedgui, A; Ait-Oufella, H; Zhao, TX; Nus, M; Ruhrberg, C; Taleb, S; Williams, JW; Raitakari, OT; Angeli, V; Mallat, Z
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Exploring machine learning strategies for predicting cardiovascular disease risk factors from multi-omic data (2024)
- BMC Medical Informatics and Decision Making
Drouard Gabin, Mykkänen Juha, Heiskanen Jarkko, Pohjonen Joona, Ruohonen Saku, Pahkala Katja, Lehtimäki Terho, Wang Xiaoling, Ollikainen Miina, Ripatti Samuli, Pirinen Matti, Raitakari Olli, Kaprio Jaakko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Randomized 20-year infancy-onset dietary intervention, life-long cardiovascular risk factors and retinal microvasculature (2024)
- European Heart Journal
Repo, Oskari; Juonala, Markus; Niinikoski, Harri; Rovio, Suvi; Mykkänen, Juha; Lagström, Hanna; Cheung, Carol Y; Yang, Dawei; Vaahtoranta-Lehtonen, Hanna; Jula, Antti; Nevalainen, Jaakko; Rönnemaa, Tapani; Viikari, Jorma; Raitakari, Olli; Tapp, Robyn; Pahkala, Katja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Subclinical atherosclerosis in young adults predicting cardiovascular disease : The cardiovascular risk in young Finns study (2024)
- Atherosclerosis
Raitakari Olli T., Magnussen Costan G., Juonala Markus, Kartiosuo Noora, Pahkala Katja, Rovio Suvi, Koskinen Juhani S., Mykkänen Juha, Laitinen Tomi P., Kähönen Mika, Nuotio Joel, Viikari Jorma S.A.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glycoprotein Acetyls: A Novel Inflammatory Biomarker of Early Cardiovascular Risk in the Young (2022)
- Journal of the American Heart Association
Chiesa Scott T., Charakida Marietta, Georgiopoulos Georgios, Roberts Justin D., Stafford Simon J., Park Chloe, Mykkänen Juha, Kähönen Mika, Lehtimäki Terho, Ala‐Korpela Mika, Raitakari Olli, Pietiäinen Milla, Pussinen Pirkko, Muthurangu Vivek, Hughes Alun D., Sattar Naveed, Timpson Nicholas J., Deanfield John E.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Long-term tracking and population characteristics of lipoprotein (a) in the Cardiovascular Risk in Young Finns Study (2022)
- Atherosclerosis
Raitakari Olli, Kivelä Annukka, Pahkala Katja, Rovio Suvi, Mykkänen Juha, Ahola-Olli Ari, Loo Britt-Marie, Lyytikäinen Leo-Pekka, Lehtimäki Terho, Kähönen Mika, Juonala Markus, Rönnemaa Tapani, Lamina Claudia, Kronenberg Florian, Viikari Jorma
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Multi-Omics Integration in a Twin Cohort and Predictive Modeling of Blood Pressure Values (2022)
- OMICS
Drouard Gabin, Ollikainen Miina, Mykkänen Juha, Raitakari Olli, Lehtimaki Terho, Kähönen Mika, Mishra Pashupati P, Wang Xiaoling L, Kaprio Jaakko
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Permutation-based significance analysis reduces the type 1 error rate in bisulfite sequencing data analysis of human umbilical cord blood samples (2022)
- Epigenetics
Laajala Essi, Halla-Aho Viivi, Grönroos Toni, Kalim Ubaid Ullah, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Kallionpää Henna, Lietzén Niina, Mykkänen Juha, Rasool Omid, Toppari Jorma, Oresic Matej, Knip Mikael, Lund Riikka, Lahesmaa Riitta, Lähdesmäki Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Type 1 Diabetes in Children With Genetic Risk May Be Predicted Very Early With a Blood miRNA (2022)
- Diabetes Care
Suomi Tomi, Kalim Ubaid Ullah, Rasool Omid, Laiho Asta, Kallionpää Henna, Vähä-Mäkilä Mari, Nurmio Mirja, Mykkänen Juha, Härkönen Taina, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Veijola Riitta, Toppari Jorma, Knip Mikael, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Umbilical cord blood DNA methylation in children who later develop type 1 diabetes (2022)
- Diabetologia
Laajala Essi, Kalim Ubaid U, Grönroos Toni, Rasool Omid, Halla-aho Viivi, Konki Mikko, Kattelus Roosa, Mykkänen Juha, Nurmio Mirja, Vähä-Mäkilä Mari, Kallionpää Henna, Lietzen Niina, Ghimire Bishwa R, Laiho Asta, Hyöty Heikki, Elo Laura L, Ilonen Jorma, Knip Mikael, Lund Riikka J, Orešič Matej, Veijola Riitta, Lähdesmäki Harri, Toppari Jorma, Lahesmaa Riitta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Childhood exposure to parental smoking and life-course overweight and central obesity (2021)
- Annals of Medicine
Jaakkola Johanna M, Rovio Suvi P, Pahkala Katja, Viikari Jorma, Rönnemaa Tapani, Jula Antti, Niinikoski Harri, Mykkänen Juha, Juonala Markus, Hutri-Kähönen Nina, Kähönen Mika, Lehtimäki Terho, Raitakari Olli T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evaluating the direct effects of childhood adiposity on adult systemic metabolism: a multivariable Mendelian randomization analysis (2021)
- International Journal of Epidemiology
Richardson Tom G, Mykkänen Juha, Pahkala Katja, Ala-Korpela Mika, Bell Joshua A, Taylor Kurt, Viikari Jorma, Lehtimäki Terho, Raitakari Olli, Davey Smith George
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Systematic evaluation of the association between hemoglobin levels and metabolic profile implicates beneficial effects of hypoxia (2021)
- Science Advances
Auvinen Juha, Tapio Joona, Karhunen Ville, Kettunen Johannes, Serpi Raisa, Dimova Elitsa Y, Gill Dipender, Soininen Pasi, Tammelin Tuija, Mykkänen Juha, Puukka Katri, Kähonen Mika, Raitoharju Emma, Lehtimäki Terho, Ala-Korpela Mika, Raitakari Olli T, Keinänen-Kiukaanniemi Sirkka, Järvelin Marjo-Riitta, Koivunen Peppi
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The associations of oxidized lipoprotein lipids with lipoprotein subclass particle concentrations and their lipid compositions. The Cardiovascular Risk in Young Finns Study (2021)
- Free Radical Biology and Medicine
Kresanov Petri, Mykkänen Juha, Ahotupa Markku, Ala-Korpela Mika, Juonala Markus, Kaikkonen Jari, Kähönen Mika, Lehtimäki Terho, Vasankari Tommi, Viikari Jorma, Raitakari Olli T.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Serum 25-Hydroxyvitamin D Concentrations at Birth in Children Screened for HLA-DQB1 Conferred Risk for Type 1 Diabetes (2019)
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism
Marjaana Mäkinen, Eliisa Löyttyniemi, Maarit Koskinen, Mari Vähä-Mäkilä, Heli Siljander, Mirja Nurmio, Juha Mykkänen, Suvi M Virtanen, Olli Simell, Heikki Hyöty, Jorma Ilonen, Mikael Knip, Riitta Veijola, Jorma Toppari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )