PhD Eeva-Liisa Eskelinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Eeva-Liisa Eskelinen
PhD

- professori,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

eeva-liisa.eskelinen@utu.fi

+358 29 450 3996

+358 50 511 5631

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Työhuone: C341

Kiinamyllynkatu 10, 20520 Turku, Finland
Medisiina C341

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-0006-7785

Website of research group

Research Gate

Full list of publications

Asiantuntijuusalueet

Solubiolgia, autofagia, lysosomit, elektronimikroskopia, solujen kuvantaminen

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

Autofagian kalvodynamiikka

Biografia

Eeva-Liisa Eskelisellä on pitkä kokemus autofagiatutkimuksessa, erityisesti autofagosomien biogeneesin ja kalvodynamiikan tutkimuksessa elektronimikroskopian avulla. Hän valmistui filosofian tohtoriksi Jyväskylän yliopistossa ja toimi sen jälkeen tutkijatohtorina ensin Göttingenin yliopistossa Saksassa ja sen jälkeen Helsingin yliopistossa. 1999-2002 hän toimi tutkijana Dundeen yliopistossa Skotlannissa ja 2002-2005 ryhmänjohtajana Kielin yliopistossa Saksassa. 2005-2017 hän toimi yliopistonlehtorina Helsingin yliopistossa biotieteiden laitoksella. Marraskuussa 2017 hän aloitti lääketieteellisen solubiologian professorina biolääketieteen laitoksella Turun yliopistossa.

Tutkimus

Autofagosomien
kalvodynamiikka

Autofagia on
lysosomaalinen hajotusreitti, joka kierrättää sytoplasmista materiaalia ja
organelleja. Sen tehtävä on ylläpitää solujen energiatasapainoa ravintoaineiden
puutteen ja stressin aikana. Lisäksi autofagia hajottaa ja kierrättää
vahingoittuneita soluorganelleja sekä paakkuuntuneita proteiineja, suojelee
soluja metaboliselta stressiltä ja DNA vaurioilta, ja jopa pidentää solujen ja
organismien elinikää. Puutteellisesti toimiva autofagia on yhdistetty moniin
sairauksiin kuten syöpä, myopatiat, metaboliset sairaudet ja hermoston
rappeumataudit.

Autofagosomit ovat kalvon ympäröimiä rakkuloita, jotka
eristävät hajotettavan materiaalin muusta solulimasta ja toimittavat sen sitten
lysosomeihin hajotettavaksi. Ne muodostuvat solulimakalvoston yhteydessä. Ensin ilmaantuu
litteä kalvopussi, fagofori, joka sitten laajenee ja muodostaa autofagosomin.
Autofagosomi yhtyy endosomien ja lysosomien kanssa, ja näin sen sisään jäänyt
materiaali päätyy lysosomaaliseen hajotukseen. Fagoforien ja autofagosomien
kalvojen alkuperää on yritetty selvittä jo vuosikymmenien ajan. Me etsimme
vastausta tähän kysymykseen käyttämällä kolmiulotteista elektronimikroskopiaa, elävien
solujen kuvantamista ja korrelatiivista valo-elektronimikroskopiaa. Lisäksi
selvitämme autofagiareitin loppuvaiheessa toimivan GTPaasin, RAB24:n,
molekyylitason mekanismeja.

Opetus

Opetan solubiologiaa biolääketieteen laitoksen tarjoamilla kursseilla sekä elektronimikroskopiaa Biomedical Imaging -maisteriohjelman kurssilla.

Julkaisut

1/7

Trafficking of K63-polyubiquitin-modified membrane proteins in a macroautophagy-independent pathway is linked to ATG9A (2025)
- Molecular Biology of the Cell
Scavone, Francesco; Lian, Sharon; Eskelinen, Eeva-Liisa; Cohen, Robet E; Yao, Tingting
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Accumulation of APP C-terminal fragments causes endolysosomal dysfunction through the dysregulation of late endosome to lysosome-ER contact sites (2024)
- Developmental Cell
Bretou Marine, Sannerud Ragna, Escamilla-Ayala Abril, Leroy Tom, Vrancx Céline, Van Acker Zoë P., Perdok Anika, Vermeire Wendy, Vorsters Inge, Van Keymolen Sophie, Maxson Michelle, Pavie Benjamin, Wierda Keimpe, Eskelinen Eeva-Liisa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Women in Autophagy: an initiative to promote gender parity in science (2024)
- Nature Cell Biology
McCabe, Mericka; Boya, Patricia; Chen, Ruey-Hwa; Chu, Charleen T.; Colombo, Maria Isabel; Delgui, Laura; Eskelinen, Eeva-Liisa; Hamasaki, Maho; Hansen, Malene; He, Congcong; Jäättelä, Marja; Kimchi, Adi; Kraft, Claudine; Kundu, Mondira; Melendez, Alicia; Pattingre, Sophie; Proikas-Cezanne, Tassula; Sebti, Salwa; Simon, Anna Katharina; Simonsen, Anne; Tooze, Sharon A.; Vaccaro, Maria Ines; Wang, Xiaochen; White, Eileen; Zhao, Yan; Cuervo, Ana Maria
(B1 Vertaisarvioitu muu artikkeli (esim. pääkirjoitus, letter, comment) tieteellisessä lehdessä)
A TRAFFIC themed series - Host membrane trafficking subversion by pathogens (2023)
- Traffic
Chevet Eric, De Matteis Maria Antonietta, Eskelinen Eeva-Liisa, Farhan Hesso
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Dynamic tandem proximity-based proteomics-Protein trafficking at the proteome-scale (2023)
- Traffic
Chevet Eric, De Matteis Maria Antonietta, Eskelinen Eeva-Liisa, Farhan Hesso
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Mammalian ATG8 proteins maintain autophagosomal membrane integrity through ESCRTs (2023)
- EMBO Journal
Javed Ruheena, Jain Ashish, Duque Thabata, Hendrix Emily, Paddar Masroor Ahmad, Khan Sajjad, Claude-Taupin Aurore, Jia Jingyue, Allers Lee, Wang Fulong, Mudd Michal, Timmins Graham, Lidke Keith, Rusten Tor Erik, Akepati Prithvi Reddy, He Yi, Reggiori Fulvio, Eskelinen Eeva-Liisa, Deretic Vojo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Mammalian hybrid prophagophore is a precursor to autophagosomes (2023)
- Autophagy
Kumar Suresh, Javed Ruheena, Paddar Masroor A, Eskelinen Eeva-Liisa, Timmins Graham S, Deretic Vojo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Novel insights into autophagosome biogenesis revealed by cryo-electron tomography (2023)
- FEBS Letters
Eskelinen Eeva-Liisa
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
The ABL-MYC axis controls WIPI1-enhanced autophagy in lifespan extension (2023)
- Communications Biology
Sporbeck K, Haas ML, Pastor-Maldonado CJ, Schüssele DS, Hunter C, Takacs Z, Diogo de Oliveira AL, Franz-Wachtel M, Charsou C, Pfisterer SG, Gubas A, Haller PK, Knorr RL, Kaulich M, Macek B, Eskelinen EL, Simonsen A, Proikas-Cezanne T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Upregulation of the ESCRT pathway and multivesicular bodies accelerates degradation of proteins associated with neurodegeneration (2023)
- Autophagy Reports
Benyair R, Giridharan SSP, Rivero-Ríos P, Hasegawa J, Bristow E, Eskelinen EL, Shmueli MD, Fishbain-Yoskovitz V, Merbl Y, Sharkey LM, Paulson HL, Hanson PI, Patnaik S, Al-Ramahi I, Botas J, Marugan J, Weisman LS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Design and Evaluation of Autophagy-Inducing Particles for the Treatment of Abnormal Lipid Accumulation (2022)
- Pharmaceutics
Zagkou Stavroula, Marais Valentine, Zeghoudi Narimane, Guillou Edouard Le, Eskelinen EL, Panasyuk Ganna, Verrier Bernard, Primard Charlotte
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Follicular lymphoma-associated mutations in the V-ATPase chaperone VMA21 activate autophagy creating a targetable dependency (2022)
- Autophagy
Wang Fangyang, Yang Ying, Boudagh Gabriel, Eskelinen Eeva-Liisa, Klionsky Daniel J, Malek Sami N
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Mitochondrial hyperfusion via metabolic sensing of regulatory amino acids (2022)
- Cell Reports
Abdullah Mahmud O, Zeng Run X, Margerum Chelsea L, Papadopoli David, Monnin Cian, Punter Kaylee B, Chu Charles, Al-Rofaidi Mohammed, Al-Tannak Naser F, Berardi Domenica, Rattray Zahra, Rattray Nicholas JW, Abraham Sheela A, Eskelinen Eeva-Liisa, Watson David G, Avizonis Daina, Topisirovic Ivan, Chan Edmond YW
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Modified LC3 Dot Quantification Method (2022) Autophagy and Cancer Anwar Tahira, Eskelinen Eeva-Liisa
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Morphology of Phagophore Precursors by Correlative Light-Electron Microscopy (2022)
- Cells
Gudmundsson Sigurdur Runar, Kallio Katri A, Vihinen Helena, Jokitalo Eija, Ktistakis Nicholas, Eskelinen Eeva-Liisa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Persistent coxsackievirus B1 infection triggers extensive changes in the transcriptome of human pancreatic ductal cells (2022)
- iScience
Buchacher Tanja, Honkimaa Anni, Välikangas Ttommi, Lietzén Niina, Hirvonen M Karolina, Laiho Jutta E, Sioofy-Khojine Amir-Babak, Eskelinen Eeva-Liisa, Hyöty Heikki, Elo Laura L, Lahesmaa Riitta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Synergistic combination of cytotoxic chemotherapy and cyclin-dependent kinase 4/6 inhibitors in biliary tract cancers (2022)
- Hepatology
Arora Mansi, Bogenberger James M, Abdelrahman Amro M, Yonkus Jennifer, Alva-Ruiz Roberto, Leiting Jennifer L, Chen Xianfeng, Serrano Uson Junior Pedro Luiz, Dumbauld Chelsae R, Baker Alexander T, Gamb Scott I, Egan Jan B, Zhou Yumei, Nagalo Bolni Marius, Meurice Nathalie, Eskelinen Eeva-Liisa, Salomao Marcela A, Kosiorek Heidi E, Braggio Esteban, Barrett Michael T, Buetow Kenneth H, Sonbol Mohamad B, Mansfield Aaron S, Roberts Lewis R, Bekaii-Saab Tanios S, Ahn Daniel H, Truty Mark J, Borad Mitesh J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The mechanism of macroautophagy: The movie (2022)
- Autophagy Reports
Reggiori Fulvio, Boya Patricia, da Costa David, Elazar Zvulun, Eskelinen Eeva-Liisa, Farrés Judith, Guettler Sebastian, Kraft Claudine, Jungbluth Heinz, Martinez Ana, Morel Etienne, Pless Ole, Proikas-Cezanne Tassula, Simonsen Anne
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
The Novel Inducer of Innate Immunity HO53 Stimulates Autophagy in Human Airway Epithelial Cells (2022)
- Journal of Innate Immunity
Myszor Iwona T, Sigurdsson Snaevar, Viktorsdottir Alexia Ros, Agerberth Birgitta, Eskelinen Eeva-Liisa, Ogmundsdottir Margret Helga, Gudmundsson Gudmundur H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The spectrum of neurodevelopmental, neuromuscular and neurodegenerative disorders due to defective autophagy (2022)
- Autophagy
Deneubourg Celine, Ramm Mauricio, Smith Luke J, Baron Olga, Singh Kritarth, Byrne Susan C, Duchen Michael R, Gautel Mathias, Eskelinen Eeva-Liisa, Fanto Manolis, Jungbluth Heinz
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)