PhD Olli Pentikäinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Olli Pentikäinen
PhD

- ,
InFLAMES Lippulaiva (lääketieteellinen tiedekunta)
- professori,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

olli.pentikainen@utu.fi

+358 40 521 6913

Kiinamyllynkatu 10

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-7188-4016

MedChem.fi

Asiantuntijuusalueet

Tietokone-riippuvainen lääkeainekehitys; Molekyylimallinnus; Proteiinien rakenne-toiminta suhde; Proteiini-proteiini vuorovaikutus

Biografia

Koulutus:
FM (orgaaninen) kemia 1995 (Joensuun yliopisto)
FT Biokemia 2003 (Åbo Akademi)
Dosentti (Biokemia) 2005- (Turun yliopisto)

Vakanssit:
2017- Lääkeainekemian professori (Turun yliopisto) 8/2017
2006- Solu- ja molekyylibiologian Yliassistentti/Yliopistonlehtori (Jyväskylän yliopisto)
2015 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Innsbruck, Itävalta)
2005-2006 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Bristol, UK)
1999-2005 Tutkimuspäällikkö (FBD OY)

Tutkimus

Tutkimuksemme keskittyy uusien tehokkaiden lääkeaineiden etsimiseen sekä siihen liittyvien uusien menetelmien kehitykseen. Erityisesti aiemmin mahdottomina pidetyt syöpälääkekehityskohteet yhdessä lääkeaineiden riskiarvioinnin kanssa muodostavat tällä hetkellä tutkimuksemme pääpainoalueet.

Julkaisut

6/7

Cooperative symmetric to asymmetric conformational transition of the apo-form of scavenger decapping enzyme revealed by simulationsVascular amine oxidases are needed for leukocyte extravasation into inflamed joints in vivo (2008)
- ProteinsArthritis and Rheumatism
Pentikainen U, Pentikainen OT, Mulholland AJ
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Novel analogs and stereoisomers of the marine toxin neodysiherbaine with specificity for kainate receptors (2008)
- Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics
Lash LL, Sanders JM, Akiyama N, Shoji M, Postila P, Pentikainen OT, Sasaki M, Sakai R, Swanson GT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Development and characterization of GluR5 kainate receptor antagonists (2007)
- Journal of Neurochemistry
Mayo-Martin MB, Dolman NP, More JCA, Alt A, Knauss JL, Pentikainen OT, Glasser CR, Bleakman D, Mayer ML, Collingridge GL, Jane DE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Small molecule designed to target metal binding site in the alpha 2I domain inhibits integrin function (2007)
- Journal of Medicinal Chemistry
Kapyla J, Pentikainen OT, Nyronen T, Nissinen L, Lassander S, Jokinen J, Lahti M, Marjamaki A, Johnson MS, Heino J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Structure of three tandem filamin domains reveals auto-inhibition of ligand binding (2007)
- EMBO Journal
Lad Y, Kiema T, Jiang PJ, Pentikainen OT, Coles CH, Campbell ID, Calderwood DA, Ylaenne J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Synthesis and pharmacological characterization of N-3-substituted willardiine derivatives: Role of the substituent at the 5-position of the uracil ring in the development of highly potent and selective GLU(K5) kainate receptor antagonists (2007)
- Journal of Medicinal Chemistry
Dolman NP, More JCA, Alt A, Knauss JL, Pentikainen OT, Glasser CR, Bleakman D, Mayer ML, Collingridge GL, Jane DE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Binding properties of HABA-type azo derivatives to avidin and avidin-related protein 4 (2006)
- Chemistry and Biology
Repo S, Paidanius TA, Hytonen VP, Nyholm TKM, Hailing KK, Huuskonen J, Pentikainen T, Rissanen K, Slotte JP, Airenne TT, Salminen TA, Kulomaa MS, Johnson MS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Determination of binding site residues responsible for the subunit selectivity of novel marine-derived compounds on kainate receptors (2006)
- Molecular Pharmacology
Sanders JM, Pentikainen OT, Settimo L, Pentikainen U, Shoji M, Sasaki M, Sakai R, Johnson MS, Swanson GT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Determination of binding site residues responsible for the subunit selectivity of novel marine-derived compounds on kainate receptors (2006)
- Molecular PharmacologyJournal of Biological Chemistry
Sanders JM, Pentikainen OT, Settimo L, Pentikainen U, Shoji M, Sasaki M, Sakai R, Johnson MS, Swanson GT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
New inhibitors of 17 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 1 (2006) Messinger J, Hirvela L, Husen B, Kangas L, Koskimies P, Pentikainen O, Saarenketo P, Thole H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Subtype selectivity and flexibility of ionotropic glutamate receptors upon antagonist ligand binding (2006)
- Organic and Biomolecular Chemistry
Pentikainen U, Settimo L, Johnson MS, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
2006
Marttila-Ichihara F, Smith DJ, Stolen C, Yegutkin GG, Elima K, Mercier N, Kiviranta R, Pihlavisto M, Alaranta S, Pentikainen U, Pentikainen O, Fulop F, Jalkanen S, Salmi M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Divergent pharmacological activity of novel marine-derived excitatory amino acids on glutamate receptorsBODIL: a molecular modeling environment for structure-function analysis and drug design (2005)
- Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics
Sanders JM, Ito K, Settimo L, Pentikainen OT, Shoji M, Sasaki M, Johnson MS, Sakai R, Swanson GT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2004)
- Journal of Computer-Aided Molecular Design
Lehtonen JV, Still DJ, Rantanen VV, Ekholm J, Bjorkland D, Iftikhar Z, Huhtala M, Repo S, Jussila A, Jaakkola J, Pentikainen O, Nyronen T, Salminen T, Gyllenberg M, Johnson MS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Chicken avidin-related protein 4/5 shows superior thermal stability when compared to avidin while retaining high affinity to biotin (2004)
- Biophysical Journal
Hytonen VP, Nyholm TKM, Pentikainen OT, Vaarno J, Porkka EJ, Nordlund HR, Johnson MS, Slotte JP, Laitinen OH, Kulomaa MS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Chicken avidin-related protein 4/5 shows superior thermal stability when compared with avidin while retaining high affinity to biotin (2004)
- Journal of Biological Chemistry
Hytonen VP, Nyholm TKM, Pentikainen OT, Vaarno J, Porkka EJ, Nordlund HR, Johnson MS, Slotte JP, Laitinen OH, Kulomaa MS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Construction of hevein (Hev b 6.02) with reduced allergenicity for immunotherapy of latex allergy by comutation of six amino acid residues on the conformational IgE epitopesJararhagin-derived RKKH peptides induce structural changes in alpha I-1 domain of human integrin alpha(1)beta(1) (2004) Karisola P, Mikkola J, Kalkkinen N, Airenne KJ, Laitinen OH, Repo S, Pentikainen OT, Reunala T, Turjanmaa K, Johnson MS, Palosuo T, Kulomaa MS, Alenius H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2004)
- Journal of Biological Chemistry
Nymalm Y, Puranen JS, Nyholm TKM, Kapyla J, Kidron H, Pentikainen OT, Airenne TT, Heino J, Slotte JP, Johnson MS, Salminen TA
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Model structures of the N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR1 explain the molecular recognition of agonist and antagonist ligands (2004)
- Journal of Structural Biology
Moretti L, Pentikainen OT, Settimo L, Johnson MS
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
alpha(11)beta(1) integrin recognizes the GFOGER sequence in interstitial collagens (2003)
Zhang WM, Kapyla J, Puranen JS, Knight CG, Tiger CF, Pentikainen OT, Johnson MS, Farndale RW, Heino J, Gullberg D
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )