PhD Olli Pentikäinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Olli Pentikäinen
PhD

- ,
InFLAMES Lippulaiva (lääketieteellinen tiedekunta)
- professori,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

olli.pentikainen@utu.fi

+358 40 521 6913

Kiinamyllynkatu 10

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-7188-4016

MedChem.fi

Asiantuntijuusalueet

Tietokone-riippuvainen lääkeainekehitys; Molekyylimallinnus; Proteiinien rakenne-toiminta suhde; Proteiini-proteiini vuorovaikutus

Biografia

Koulutus:
FM (orgaaninen) kemia 1995 (Joensuun yliopisto)
FT Biokemia 2003 (Åbo Akademi)
Dosentti (Biokemia) 2005- (Turun yliopisto)

Vakanssit:
2017- Lääkeainekemian professori (Turun yliopisto) 8/2017
2006- Solu- ja molekyylibiologian Yliassistentti/Yliopistonlehtori (Jyväskylän yliopisto)
2015 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Innsbruck, Itävalta)
2005-2006 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Bristol, UK)
1999-2005 Tutkimuspäällikkö (FBD OY)

Tutkimus

Tutkimuksemme keskittyy uusien tehokkaiden lääkeaineiden etsimiseen sekä siihen liittyvien uusien menetelmien kehitykseen. Erityisesti aiemmin mahdottomina pidetyt syöpälääkekehityskohteet yhdessä lääkeaineiden riskiarvioinnin kanssa muodostavat tällä hetkellä tutkimuksemme pääpainoalueet.

Julkaisut

3/7

Case-specific performance of MM-PBSA, MM-GBSA, and SIE in virtual screening (2015)
- Journal of Molecular Graphics and Modelling
Virtanen SI, Niinivehmas SP, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Case-specific performance of MM-PBSA, MM-GBSA, and SIE in virtual screening (2015)
- Journal of Molecular Graphics and Modelling
Virtanen SI, Niinivehmas SP, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Modeling of interactions between xenobiotics and cytochrome P450 (CYP) enzymes (2015)
- Frontiers in Pharmacology
Raunio H, Kuusisto M, Juvonen RO, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Modeling of interactions between xenobiotics and cytochrome P450 (CYP) enzymes (2015)
- Frontiers in Pharmacology
Raunio H, Kuusisto M, Juvonen RO, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Modeling of interactions between xenobiotics and cytochrome P450 (CYP) enzymes (2015)
- Frontiers in Pharmacology
Raunio H, Kuusisto M, Juvonen RO, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Ultrafast protein structure-based virtual screening with Panther (2015)
- Journal of Computer-Aided Molecular Design
Niinivehmas SP, Salokas K, Latti S, Raunio H, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Ultrafast protein structure-based virtual screening with Panther (2015)
- Journal of Computer-Aided Molecular Design
Niinivehmas SP, Salokas K, Latti S, Raunio H, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Ultrafast protein structure-based virtual screening with Panther (2015)
- Journal of Computer-Aided Molecular Design
Niinivehmas SP, Salokas K, Latti S, Raunio H, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Novel Structural Unit in the N-terminal Region of Filamins (2014)
- Journal of Biological Chemistry
Sethi R, Seppala J, Tossavainen H, Ylilauri M, Ruskamo S, Pentikainen OT, Pentikainen U, Permi P, Ylanne J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Novel Structural Unit in the N-terminal Region of Filamins (2014)
- Journal of Biological Chemistry
Sethi R, Seppala J, Tossavainen H, Ylilauri M, Ruskamo S, Pentikainen OT, Pentikainen U, Permi P, Ylanne J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Novel Structural Unit in the N-terminal Region of Filamins (2014)
- Journal of Biological Chemistry
Sethi R, Seppala J, Tossavainen H, Ylilauri M, Ruskamo S, Pentikainen OT, Pentikainen U, Permi P, Ylanne J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Novel Structural Unit in the N-terminal Region of Filamins (2014)
- Journal of Biological Chemistry
Sethi R, Seppala J, Tossavainen H, Ylilauri M, Ruskamo S, Pentikainen OT, Pentikainen U, Permi P, Ylanne J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
L-Arabinose/D-galactose 1-dehydrogenase of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii characterised and applied for bioconversion of L-arabinose to L-arabonate with Saccharomyces cerevisiae (2014)
- Applied Microbiology and Biotechnology
Aro-Karkkainen N, Toivari M, Maaheimo H, Ylilauri M, Pentikainen OT, Andberg M, Oja M, Penttila M, Wiebe MG, Ruohonen L, Koivula A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular and ecological signs of mitochondrial adaptation: consequences for introgression? (2014)
- Heredity
Boratynski Z, Melo-Ferreira J, Alves PC, Berto S, Koskela E, Pentikainen OT, Tarroso P, Ylilauri M, Mappes T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular and ecological signs of mitochondrial adaptation: consequences for introgression? (2014)
- Heredity
Boratynski Z, Melo-Ferreira J, Alves PC, Berto S, Koskela E, Pentikainen OT, Tarroso P, Ylilauri M, Mappes T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular and ecological signs of mitochondrial adaptation: consequences for introgression? (2014)
- Heredity
Boratynski Z, Melo-Ferreira J, Alves PC, Berto S, Koskela E, Pentikainen OT, Tarroso P, Ylilauri M, Mappes T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
2NH and 3OH are crucial structural requirements in sphingomyelin for sticholysin II binding and pore formation in bilayer membranes (2013)
- BBA - Biomembranes
Maula T, Isaksson YJE, Garcia-Linares S, Niinivehmas S, Pentikainen OT, Kurita M, Yamaguchi S, Yamamoto T, Katsumura S, Gavilanes JG, Martinez-del-Pozo A, Slotte JP
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
MMGBSA As a Tool To Understand the Binding Affinities of Filamin-Peptide Interactions (2013)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Ylilauri M, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
MMGBSA As a Tool To Understand the Binding Affinities of Filamin-Peptide Interactions (2013)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Ylilauri M, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
MMGBSA As a Tool To Understand the Binding Affinities of Filamin-Peptide Interactions (2013)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Ylilauri M, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )