PhD Olli Pentikäinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Olli Pentikäinen
PhD

- ,
InFLAMES Lippulaiva (lääketieteellinen tiedekunta)
- professori,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

olli.pentikainen@utu.fi

+358 40 521 6913

Kiinamyllynkatu 10

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-7188-4016

MedChem.fi

Asiantuntijuusalueet

Tietokone-riippuvainen lääkeainekehitys; Molekyylimallinnus; Proteiinien rakenne-toiminta suhde; Proteiini-proteiini vuorovaikutus

Biografia

Koulutus:
FM (orgaaninen) kemia 1995 (Joensuun yliopisto)
FT Biokemia 2003 (Åbo Akademi)
Dosentti (Biokemia) 2005- (Turun yliopisto)

Vakanssit:
2017- Lääkeainekemian professori (Turun yliopisto) 8/2017
2006- Solu- ja molekyylibiologian Yliassistentti/Yliopistonlehtori (Jyväskylän yliopisto)
2015 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Innsbruck, Itävalta)
2005-2006 Vieraileva vanhempi tutkija (University of Bristol, UK)
1999-2005 Tutkimuspäällikkö (FBD OY)

Tutkimus

Tutkimuksemme keskittyy uusien tehokkaiden lääkeaineiden etsimiseen sekä siihen liittyvien uusien menetelmien kehitykseen. Erityisesti aiemmin mahdottomina pidetyt syöpälääkekehityskohteet yhdessä lääkeaineiden riskiarvioinnin kanssa muodostavat tällä hetkellä tutkimuksemme pääpainoalueet.

Julkaisut

2/7

In vitro glucuronidation of 7-hydroxycoumarin derivatives in intestine and liver microsomes of Beagle dogsScreening of Natural Products Targeting SARS-CoV-2-ACE2 Receptor Interface - A MixMD Based HTVS Pipeline (2020)
- European Journal of Pharmaceutical SciencesFrontiers in Chemistry
Risto O. Juvonen, Aki T. Heikkinen, Olli Kärkkäinen, Rabia Jehangir, Juhani Huuskonen, Johanna Troberg, Hannu Raunio, Olli T. Pentikäinen, Moshe Finel
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
In vitro sulfonation of 7-hydroxycoumarin derivatives in liver cytosol of human and six animal species (2020)
- Xenobiotica
Juvonen RO, Pentikäinen O, Huuskonen J, Timonen J, Kärkkäinen O, Heikkinen A, Fashe M, Raunio H
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2020)
Krishnasamy Gopinath, Elmeri M. Jokinen, Sami T. Kurkinen, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Practical Perspective: The Effect of Ligand Conformers on the Negative Image-Based Screening (2019)
- International Journal of Molecular SciencesXenobiotica
Ahinko M, Kurkinen ST, Niinivehmas SP, Pentikäinen OT, Postila PA
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Development of new Coumarin-based profluorescent substrates for human cytochrome P450 enzymesFragment- and negative image-based screening of phosphodiesterase 10A inhibitors (2019)
Juvonen R., Ahinko M., Huuskonen J., Raunio H., Pentikäinen O.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2019)
- Chemical Biology and Drug Design
Jokinen E.M., Postila P.A., Ahinko M., Niinivehmas S., Pentikäinen O.T.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Getting Docking into Shape Using Negative Image-Based Restoring (2019)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Sami T. Kurkinen, Sakari Lätti, Olli T. Pentikäinen, Pekka A. Postila
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Suitability of MMGBSA for the selection of correct ligand binding modes from docking results (2019)
- Chemical Biology and Drug Design
Mira Ahinko, Sanna Niinivehmas, Elmeri Jokinen, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Blocking oestradiol synthesis pathways with potent and selective coumarin derivatives (2018)
- Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal ChemistryACS Omega
Niinivehmas S, Postila PA, Rauhamaki S, Manivannan E, Kortet S, Ahinko M, Huuskonen P, Nyberg N, Koskimies P, Latti S, Multamaki E, Juvonen RO, Raunio H, Pasanen M, Huuskonen J, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Discovery of Retinoic Acid-Related Orphan Receptor gamma t Inverse Agonists via Docking and Negative Image-Based Screening (2018)
Sanna Rauhamäki, Pekka A. Postila, Sakari Lätti, Sanna Niinivehmas, Elina Multamäki, Klaus R. Liedl, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Effects of cold acclimation and dsRNA injections on Gs1l gene splicing in Drosophila montana (2018)
- Scientific Reports
Hopkins D, Envall T, Poikela N, Pentikäinen OT, Kankare M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Improving Docking Performance Using Negative Image-Based (2018)
- Frontiers in Pharmacology
Sami T. Kurkinen, Sanna Niinivehmas, Mira Ahinko, Sakari Lätti, Olli T. Pentikäinen, Pekka A. Postila
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Molecular Docking-Based Design and Development of a Highly Selective Probe Substrate for UDP-glucuronosyltransferase 1A10 (2018)
- Molecular Pharmaceutics
Risto O. Juvonen , Sanna Rauhamäki, Sami Kortet, Sanna Niinivehmas, Johanna Troberg, Aleksanteri Petsalo, Juhani Huuskonen, Hannu Raunio, Moshe Finel, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Structure-Activity Relationship Analysis of 3-Phenylcoumarin-Based Monoamine Oxidase B Inhibitors (2018)
- Frontiers in Chemistry
Sanna Rauhamäki, Pekka A. Postila, Sanna Niinivehmas, Sami Kortet, Emmi Schildt, Mira Pasanen, Elangovan Manivannan, Mira Ahinko, Pasi Koskimies, Niina Nyberg, Pasi Huuskonen, Elina Multamäki, Markku Pasanen, Risto O. Juvonen, Hannu Raunio, Juhani Huuskonen, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2017)
- Journal of Medicinal Chemistry
Kaźmierczak Aleksandra, Kusy Damian, Niinivehmas Sanna, Gmach Joanna, Joachimiak Łukasz, Pentikäinen Olli, Gendaszewska-Darmach Edyta, Blazewska Katarzyna
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
(2017) Seppala J, Bernardi RC, Haataja TJK, Hellman M, Pentikainen OT, Schulten K, Permi P, Ylanne J, Pentikainen U
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Inhibitory effects and oxidation of 6-methylcoumarin, 7-methylcoumarin and 7-formylcoumarin via human CYP2A6 and its mouse and pig orthologous enzymes (2016)
- Xenobiotica
Juvonen RO, Kuusisto M, Fohrgrup C, Pitkanen MH, Nevalainen TJ, Auriola S, Raunio H, Pasanen M, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The Influence of Hydrogen Bonding on Sphingomyelin/Colipid Interactions in Bilayer Membranes (2016)
- Biophysical Journal
Yasuda T, Al Sazzad MA, Jantti NZ, Pentikainen OT, Slotte JP
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Case-specific performance of MM-PBSA, MM-GBSA, and SIE in virtual screening (2015)
- Journal of Molecular Graphics and Modelling
Virtanen SI, Niinivehmas SP, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Case-specific performance of MM-PBSA, MM-GBSA, and SIE in virtual screening (2015)
- Journal of Molecular Graphics and Modelling
Virtanen SI, Niinivehmas SP, Pentikainen OT
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )