Irma Saloniemi
Ph.D., Docent
irma.saloniemi@utu.fi +358 29 450 4276 +358 46 923 0948 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 337 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9083-4313 |
evoluutiobiologia; kvantitatiivinen genetiikka; luonnonvalinta; tilastotieteen biologiset sovellukset, muuntogeeniset organismit, glyfosaatti, kestävä maatalous, metsänhoito ja kalastus; bioturva;
Aloitin opiskeluni Helsingissä kovista luonnontieteistä, mutta pian huomasin että sisäinen maailmanparantajani kaipasi myös mahdollisuutta oppien soveltamiseen. Onneksi löysin biologian, ja päädyin Chicagon ja Oregonin yliopistoihin, joissa biologiaa ei liiaksi lokeroitu osa-alueisiinsa.
Olen toiminut opettajana ja tutkijana Turun yliopiston biologian laitoksella lähes koko työurani; toimin ensin ekologian osastolla, josta siirryin myöhemmin genetiikalle. Olen opettanut biologiaa ekologiasta genetiikkaan ja bioinformatiikasta agroekologiaan. Onneksi jossain välissä on ollut mahdollisuus tehdä myös tutkimusta, jossa omimmaksi alueeksi koen niiden evolutiivisten systeemien tutkimisen, joissa ihmistoimintaan vaikuttamalla pyritään vähentämään ongelmia. Esimerkkejä ovat vaikkapa kestävä maatalous, biotekniikan riskeihin varautuminen ja viimeisimpänä ilmastonmuutokseen varautuminen.
Erilaisten biologisten
ilmiöiden tilastolliset analyysit ovat olleet keskeisiä tutkimuksissani
varhaisista epidemiologisista alkane. Olen
tutkinut koivun ja sitä hyödyntävien organismien suhteita Kevolla ja
akatemioprojektissani (50452) “Trophic-level and life-history consequences of
transgenic resistance in plants”.
Yhteistyössä Luken kanssa
(PI Irma Kallio-Nyberg), olen selvittänyt nousevien lämpötilojen, kalastuksen
ja kalanviljelyn vaikutuksia lohikaloihin (lohi, taimen, sika) Itämeren
alueella.
Pitkäaikainen yhteistyöni Kari Saikkosen ja Marjo Helanderin kanssa natojen ja
niiden mikrobi-interaktioiden tutkimisessa on innostanut perehtymään laajemminkin
maatalouden evolutiivisiin sovelluksiin.
Tällä hetkellä työskentelen
pääosin kahdessa projektissa. Tutkin glyfosaatin vaikutuksia ei-kohde-eliöihin osana
Marjo Helanderin johtamaa akatemiaprojektia. Huolellisesti suunnitellut ja
toteutetut koejärjestelyt useilla organismeilla vastaavat ajankohtaisiin
kysymyksiin ja auttavat faktojen tuomisessa usein löysänä vellovaan
glyfosaattikeskusteluun.
Tärkein työni on Kevon
metsänrajapuutarhan (MRP) pitkäaikaisaineistojen dokumentointi ja analysointi. MRP-kokeet
ovat viiteen eri paikkaan Utsjoella, Inarissa, Kittilässä ja Ruissalossa
suunniteltuja koejärjestelyjä vapaapölytteisten pohjoisten koivuyksilöiden jälkeläisten
kasvattamiseksi samoilla paikoilla (common garden). Uusien mittausten yhdistäminen
vuosikymmeniä vanhoihin elinkiertomittauksiin, molekyylimenetelmät ja
kvantitatiivisen genetiikan analyysit tuottavat uusia ennusteita ja tietoa ilmastonmuutoksen
vaikutuksista, ympäristöön sopeutumisen mekanismeista ja koivun evoluutiosta.
Opetukseeni on viime
vuosina kuulunut BIOL1301 Genetiikan perusteet, BIOL2121 Evoluutiobiologia ja BIOL3050
Bioinformatiikkaa biologeille. Olen opettanut tilastotieteen kursseja
perusteista syventäviin opintoihin sekä biologialla että myös vuoden ajan
statistikkona tilastotieteen laitoksella. Olen soveltanut erityyppisiä lineaarisia
malleja evolutiivisiin ja kvantitatiivisen genetiikan tilanteisiin käyttäen
SAS- tai R-ympäristöjä.
Toimiessani ekologialla,
opetin Evolutiivisten interaktioiden ja Evolutiivisen ekologian kursseja.
Genetiikalla olen opettanut Populaatiogenetiikkaa, Evolutiivisia sovelluksia,
ja Evoluution lukupiiriä. Olen myös opettanut useita kertoja kurssia
Agroekologia ja –evoluutio yhdessä dos. Marjo Helanderin ja Luken henkilökunnan
kanssa.
Koen mieluisiksi
tilanteet, joissa voin aidosti jakaa opetusvastuun muiden opettajien kanssa.
Aina kun ajan, talouden ja hallinnon kannalta on mahdollista, haluan antaa
opiskelijoiden perehtyä ilmiöihin ja faktoihin itsenäisesti tai pienryhmissä.
- Effect of origin, sex and sea age of Atlantic salmon on their recapture rate after river ascent (2006)
- Journal of Applied Ichthyology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Survival of reared Atlantic salmon and sea trout in relation to marine conditions of smolt year in the Baltic Sea (2006) Kallio-Nyberg, I (Kallio-Nyberg, Irma); Jutila, E (Jutila, Eero); Jokikokko, E (Jokikokko, Erkki); Saloniemi, I (Saloniemi, Irma)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The survival of semi-wild, wild and hatchery-reared Atlantic salmon smolts of the Simojoki River in the Baltic Sea (2006)
- Journal of Fish Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A short-lived herbivore on a long-lived host: tree resistance to herbivory depends on leaf age (2005) Ruusila, V (Ruusila, V); Morin, JP (Morin, JP); van Ooik, T (van Ooik, T); Saloniemi, I (Saloniemi, I); Ossipov, V (Ossipov, V); Haukioja, E (Haukioja, E)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Distribution of fungal foliage and shoot pathogens in a natural Scots pine population in relation to environmental variables (2005)
- Canadian Journal of Forest Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Leaf surface traits: overlooked determinants of birch resistance to herbivores and foliar micro-fungi? (2005)
- Trees - Structure and Function
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Association between environmental factors, smolt size and the survival of wild and reared Atlantic salmon from the Simojoki River in the Baltic Sea (2004)
- Journal of Fish Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Dispersal of females and differentiation between populations of Epirrita autumnata (Lepidoptera : Geometridae) inferred from variation in mitochondrial DNA (2004) Snall, N (Snall, N); Huoponen, K (Huoponen, K); Saloniemi, I (Saloniemi, I); Savontaus, ML (Savontaus, ML); Ruohomaki, K (Ruohomaki, K)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of snuff extract on epithelial growth and differentiation in vitro (2004)
- Oral Oncology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Elohopeapäästöt kaatopaikoilta ympäristöön. Turun seutu: Isosuo, Topinoja, Peltola (2004) Sanna Pitkänen, Tuula Kohonen, Irma Saloniemi, Timo Vuorisalo
(D4 Julkaistu kehittämis- tai tutkimusraportti tai -selvitys ) - Impacts of chitinase-transformed silver birch on leaf decomposition and soil organisms (2004)
- European Journal of Soil Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Survival of reared and wild Atlantic salmon smolts: size matters more in bad years (2004)
- ICES Journal of Marine Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - CD44v6 in developing, dysplastic and malignant oral epithelia (2003)
- Oral Oncology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differences in sea migration between wild and reared Atlantic salmon (Salmo salar L.) in the Baltic Sea (2003)
- Fisheries Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Cell proliferation and chromosomal changes in human ameloblastoma (2002)
- Cancer Genetics and Cytogenetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Micro-fungi and invertebrate herbivores on birch trees: fungal mediated plant-herbivore interactions or responses to host quality? (2002) Ahlholm, J (Ahlholm, J); Helander, M (Helander, M); Elamo, P (Elamo, P); Saloniemi, I (Saloniemi, I); Neuvonen, S (Neuvonen, S); Hanhimaki, S (Hanhimaki, S); Saikkonen, K (Saikkonen, K)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Seasonally varying diet quality and the quantitative genetics of development time and body size in birch feeding insects (2001)
- Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effect of maternal and paternal line on spatial and temporal marine distribution in Atlantic salmon (2000)
- Animal Behaviour
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Genetic and environmental variation in rust frequency on mature mountain birch trees (2000)
- Scandinavian Journal of Forest Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Birch family and environmental conditions affect endophytic fungi in leaves (1999)
- Oecologia
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )