Irma Saloniemi
Ph.D., Docent
irma.saloniemi@utu.fi +358 29 450 4276 +358 46 923 0948 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 337 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9083-4313 |
evoluutiobiologia; kvantitatiivinen genetiikka; luonnonvalinta; tilastotieteen biologiset sovellukset, muuntogeeniset organismit, glyfosaatti, kestävä maatalous, metsänhoito ja kalastus; bioturva;
Aloitin opiskeluni Helsingissä kovista luonnontieteistä, mutta pian huomasin että sisäinen maailmanparantajani kaipasi myös mahdollisuutta oppien soveltamiseen. Onneksi löysin biologian, ja päädyin Chicagon ja Oregonin yliopistoihin, joissa biologiaa ei liiaksi lokeroitu osa-alueisiinsa.
Olen toiminut opettajana ja tutkijana Turun yliopiston biologian laitoksella lähes koko työurani; toimin ensin ekologian osastolla, josta siirryin myöhemmin genetiikalle. Olen opettanut biologiaa ekologiasta genetiikkaan ja bioinformatiikasta agroekologiaan. Onneksi jossain välissä on ollut mahdollisuus tehdä myös tutkimusta, jossa omimmaksi alueeksi koen niiden evolutiivisten systeemien tutkimisen, joissa ihmistoimintaan vaikuttamalla pyritään vähentämään ongelmia. Esimerkkejä ovat vaikkapa kestävä maatalous, biotekniikan riskeihin varautuminen ja viimeisimpänä ilmastonmuutokseen varautuminen.
Erilaisten biologisten
ilmiöiden tilastolliset analyysit ovat olleet keskeisiä tutkimuksissani
varhaisista epidemiologisista alkane. Olen
tutkinut koivun ja sitä hyödyntävien organismien suhteita Kevolla ja
akatemioprojektissani (50452) “Trophic-level and life-history consequences of
transgenic resistance in plants”.
Yhteistyössä Luken kanssa
(PI Irma Kallio-Nyberg), olen selvittänyt nousevien lämpötilojen, kalastuksen
ja kalanviljelyn vaikutuksia lohikaloihin (lohi, taimen, sika) Itämeren
alueella.
Pitkäaikainen yhteistyöni Kari Saikkosen ja Marjo Helanderin kanssa natojen ja
niiden mikrobi-interaktioiden tutkimisessa on innostanut perehtymään laajemminkin
maatalouden evolutiivisiin sovelluksiin.
Tällä hetkellä työskentelen
pääosin kahdessa projektissa. Tutkin glyfosaatin vaikutuksia ei-kohde-eliöihin osana
Marjo Helanderin johtamaa akatemiaprojektia. Huolellisesti suunnitellut ja
toteutetut koejärjestelyt useilla organismeilla vastaavat ajankohtaisiin
kysymyksiin ja auttavat faktojen tuomisessa usein löysänä vellovaan
glyfosaattikeskusteluun.
Tärkein työni on Kevon
metsänrajapuutarhan (MRP) pitkäaikaisaineistojen dokumentointi ja analysointi. MRP-kokeet
ovat viiteen eri paikkaan Utsjoella, Inarissa, Kittilässä ja Ruissalossa
suunniteltuja koejärjestelyjä vapaapölytteisten pohjoisten koivuyksilöiden jälkeläisten
kasvattamiseksi samoilla paikoilla (common garden). Uusien mittausten yhdistäminen
vuosikymmeniä vanhoihin elinkiertomittauksiin, molekyylimenetelmät ja
kvantitatiivisen genetiikan analyysit tuottavat uusia ennusteita ja tietoa ilmastonmuutoksen
vaikutuksista, ympäristöön sopeutumisen mekanismeista ja koivun evoluutiosta.
Opetukseeni on viime
vuosina kuulunut BIOL1301 Genetiikan perusteet, BIOL2121 Evoluutiobiologia ja BIOL3050
Bioinformatiikkaa biologeille. Olen opettanut tilastotieteen kursseja
perusteista syventäviin opintoihin sekä biologialla että myös vuoden ajan
statistikkona tilastotieteen laitoksella. Olen soveltanut erityyppisiä lineaarisia
malleja evolutiivisiin ja kvantitatiivisen genetiikan tilanteisiin käyttäen
SAS- tai R-ympäristöjä.
Toimiessani ekologialla,
opetin Evolutiivisten interaktioiden ja Evolutiivisen ekologian kursseja.
Genetiikalla olen opettanut Populaatiogenetiikkaa, Evolutiivisia sovelluksia,
ja Evoluution lukupiiriä. Olen myös opettanut useita kertoja kurssia
Agroekologia ja –evoluutio yhdessä dos. Marjo Helanderin ja Luken henkilökunnan
kanssa.
Koen mieluisiksi
tilanteet, joissa voin aidosti jakaa opetusvastuun muiden opettajien kanssa.
Aina kun ajan, talouden ja hallinnon kannalta on mahdollista, haluan antaa
opiskelijoiden perehtyä ilmiöihin ja faktoihin itsenäisesti tai pienryhmissä.
- Betula pendula Roth. survival and growth in treeline is affected by genotype and environment (2025)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Greenhouse study and interviews indicate glyphosate residue via feed-feces-fertilizer route is a risk for horticultural producers using manure-based fertilizer (2024)
- Environmental Sciences Europe
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Does Glyphosate Affect the Human Microbiota? (2022)
- Life
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Quantification of the Potential Impact of Glyphosate-Based Products on Microbiomes (2022)
- Journal of Visualized Experiments
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Adaptation of bacteria to glyphosate: a microevolutionary perspective of the enzyme 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (2021)
- Environmental Microbiology Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Changes in age and maturity of anadromous whitefish (Coregonus lavaretus) in the northern Baltic Sea from 1998 to 2014 (2021)
- Aquatic Living Resources
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Classification of the glyphosate target enzyme (5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase) for assessing sensitivity of organisms to the herbicide (2021)
- Journal of Hazardous Materials
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Large inter-stock differences in catch size-at-age of mature Atlantic salmon observed by using genetic individual origin assignment from catch data (2021)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Näkökulmaa bioturvallisuuteen ja biologisen riskin arviointiin (2021)
- Solubiologi
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Female Preference and Adverse Developmental Effects of Glyphosate-Based Herbicides on Ecologically Relevant Traits in Japanese Quails (2020)
- Environmental Science and Technology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glyphosate-based herbicides influence antioxidants, reproductive hormones and gut microbiome but not reproduction: A long-term experiment in an avian model (2020)
- Environmental Pollution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Increasing temperature associated with increasing grilse proportion and smaller grilse size of Atlantic salmon (2020)
- Journal of Applied Ichthyology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Different growth trends of whitefish (Coregonus lavaretus) forms in the northern Baltic Sea (2019)
- Journal of Applied Ichthyology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of a glyphosate-based herbicide on soil animal trophic groups and associated ecosystem functioning in a northern agricultural field (2019)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glyphosate residues in soil affect crop plant germination and growth (2019)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Phenotypic and genetic variation in natural populations of Festuca rubra s.l. in Europe (2019)
- Plant Ecology and Diversity
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Anadromous trout threatened by whitefish gill-net fisheries in the northern Baltic Sea (2018)
- Journal of Applied Ichthyology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Epichloë endophyte effects on leaf blotch pathogen (Rhynchosporium sp.) of tall fescue (Schedonorus phoenix) vary among grass origin and environmental conditions (2018)
- Plant Ecology and Diversity
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Factors affecting genetic and seed yield variability of Jatropha curcas (L.) across the globe: A review (2018)
- Energy for Sustainable Development
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Glyphosate decreases mycorrhizal colonization and affects plant-soil feedback (2018)
- Science of the Total Environment
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )