Irma Saloniemi
Ph.D., Docent
irma.saloniemi@utu.fi +358 29 450 4276 +358 46 923 0948 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 337 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9083-4313 |
evoluutiobiologia; kvantitatiivinen genetiikka; luonnonvalinta; tilastotieteen biologiset sovellukset, muuntogeeniset organismit, glyfosaatti, kestävä maatalous, metsänhoito ja kalastus; bioturva;
Aloitin opiskeluni Helsingissä kovista luonnontieteistä, mutta pian huomasin että sisäinen maailmanparantajani kaipasi myös mahdollisuutta oppien soveltamiseen. Onneksi löysin biologian, ja päädyin Chicagon ja Oregonin yliopistoihin, joissa biologiaa ei liiaksi lokeroitu osa-alueisiinsa.
Olen toiminut opettajana ja tutkijana Turun yliopiston biologian laitoksella lähes koko työurani; toimin ensin ekologian osastolla, josta siirryin myöhemmin genetiikalle. Olen opettanut biologiaa ekologiasta genetiikkaan ja bioinformatiikasta agroekologiaan. Onneksi jossain välissä on ollut mahdollisuus tehdä myös tutkimusta, jossa omimmaksi alueeksi koen niiden evolutiivisten systeemien tutkimisen, joissa ihmistoimintaan vaikuttamalla pyritään vähentämään ongelmia. Esimerkkejä ovat vaikkapa kestävä maatalous, biotekniikan riskeihin varautuminen ja viimeisimpänä ilmastonmuutokseen varautuminen.
Erilaisten biologisten
ilmiöiden tilastolliset analyysit ovat olleet keskeisiä tutkimuksissani
varhaisista epidemiologisista alkane. Olen
tutkinut koivun ja sitä hyödyntävien organismien suhteita Kevolla ja
akatemioprojektissani (50452) “Trophic-level and life-history consequences of
transgenic resistance in plants”.
Yhteistyössä Luken kanssa
(PI Irma Kallio-Nyberg), olen selvittänyt nousevien lämpötilojen, kalastuksen
ja kalanviljelyn vaikutuksia lohikaloihin (lohi, taimen, sika) Itämeren
alueella.
Pitkäaikainen yhteistyöni Kari Saikkosen ja Marjo Helanderin kanssa natojen ja
niiden mikrobi-interaktioiden tutkimisessa on innostanut perehtymään laajemminkin
maatalouden evolutiivisiin sovelluksiin.
Tällä hetkellä työskentelen
pääosin kahdessa projektissa. Tutkin glyfosaatin vaikutuksia ei-kohde-eliöihin osana
Marjo Helanderin johtamaa akatemiaprojektia. Huolellisesti suunnitellut ja
toteutetut koejärjestelyt useilla organismeilla vastaavat ajankohtaisiin
kysymyksiin ja auttavat faktojen tuomisessa usein löysänä vellovaan
glyfosaattikeskusteluun.
Tärkein työni on Kevon
metsänrajapuutarhan (MRP) pitkäaikaisaineistojen dokumentointi ja analysointi. MRP-kokeet
ovat viiteen eri paikkaan Utsjoella, Inarissa, Kittilässä ja Ruissalossa
suunniteltuja koejärjestelyjä vapaapölytteisten pohjoisten koivuyksilöiden jälkeläisten
kasvattamiseksi samoilla paikoilla (common garden). Uusien mittausten yhdistäminen
vuosikymmeniä vanhoihin elinkiertomittauksiin, molekyylimenetelmät ja
kvantitatiivisen genetiikan analyysit tuottavat uusia ennusteita ja tietoa ilmastonmuutoksen
vaikutuksista, ympäristöön sopeutumisen mekanismeista ja koivun evoluutiosta.
Opetukseeni on viime
vuosina kuulunut BIOL1301 Genetiikan perusteet, BIOL2121 Evoluutiobiologia ja BIOL3050
Bioinformatiikkaa biologeille. Olen opettanut tilastotieteen kursseja
perusteista syventäviin opintoihin sekä biologialla että myös vuoden ajan
statistikkona tilastotieteen laitoksella. Olen soveltanut erityyppisiä lineaarisia
malleja evolutiivisiin ja kvantitatiivisen genetiikan tilanteisiin käyttäen
SAS- tai R-ympäristöjä.
Toimiessani ekologialla,
opetin Evolutiivisten interaktioiden ja Evolutiivisen ekologian kursseja.
Genetiikalla olen opettanut Populaatiogenetiikkaa, Evolutiivisia sovelluksia,
ja Evoluution lukupiiriä. Olen myös opettanut useita kertoja kurssia
Agroekologia ja –evoluutio yhdessä dos. Marjo Helanderin ja Luken henkilökunnan
kanssa.
Koen mieluisiksi
tilanteet, joissa voin aidosti jakaa opetusvastuun muiden opettajien kanssa.
Aina kun ajan, talouden ja hallinnon kannalta on mahdollista, haluan antaa
opiskelijoiden perehtyä ilmiöihin ja faktoihin itsenäisesti tai pienryhmissä.
- Suomalaisten laktoosinsiedon alkuperä (2012)
- Duodecim
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Effect of hatchery rearing and environmental factors on the survival, growth and migration of Atlantic salmon in the Baltic Sea (2011)
- Fisheries Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of marine survival, precocity and other life history traits on the cost-benefit of stocking salmon in the Baltic Sea (2011)
- Fisheries Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gm-keskustelun aika on nyt (2011)
- Maaseudun Tulevaisuus
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - Lohissa on eroja (2011)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Muuntogeenisen maatalouden ympäristövaikutukset - ratkaisuja vai uusia ongelmia? (2011)
- Luonnon Tutkija
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Muuntogeeniset viljelykasvit ja tutkijoiden motiivit. (2011)
- Tieteessä tapahtuu
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Temporally stable population-specific differences in run timing of one-sea-winter Atlantic salmon returning to a large river system (2011)
- Evolutionary Applications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Can the lost migratory Salmo trutta stocks be compensated with resident trout stocks in coastal rivers? (2010)
- Fisheries Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Kan bäcköringen rädda havsöringsbeståndet? (2010) Kallio-Nyberg I, Jutila E, Koljonen M, Koskiniemi J, Saloniemi I
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Luomu- vai gm-tuotanto Suomi-brändiin? (2010)
- Helsingin Sanomat
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - Meritaimenkannan palauttaminen purotaimenen avulla (2010)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Marine Survival of reared Atlantic salmon in the Baltic Sea: The effect of smolt traits and annual factors (2009) Kallio-Nyberg, I (Kallio-Nyberg, Irma); Salminen, M (Salminen, Matti); Saloniemi, I (Saloniemi, Irma); Kannala-Fisk, L (Kannala-Fisk, Laura)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Variable effects of endophytic fungus on seedling establishment of fine fescues (2009) Wali, P (Wali, Piippa R.); Helander, M (Helander, Marjo); Saloniemi, I (Saloniemi, Irma); Ahlholm, J (Ahlholm, Jouni); Saikkonen, K (Saikkonen, Kari)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Genetic background affects genetically modified ethylene sensing in birch-insect interaction (2008)
- Botany
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Luonnonvalinta ja sen mittaaminen (2008) Evoluutio Nyt! Saloniemi I, Laine V, Pölkki M, Viitaniemi H.
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Diet-mediated effects of heavy metal pollution on growth and immune response in the geometrid moth Epirrita autumnata (2007)
- Environmental Pollution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of marine conditions, fishing, and smolt traits on the survival of tagged, hatchery-reared sea trout (Salmo trutta trutta) in the Baltic Sea (2007)
- Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of parental and smolt traits on the marine survival of released Atlantic salmon (Salmo salar) (2007)
- Aquaculture
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Additive genetic variation of secondary and primary metabolites in mountain birch (2006)
- Oikos
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )