Senior Research Fellow, InFLAMES Flagship, Institute of Biomedicine / Turku Bioscience Centre Kalle Rytkönen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Kalle Rytkönen
Senior Research Fellow, InFLAMES Flagship, Institute of Biomedicine / Turku Bioscience Centre

- dosentti,
- erikoistutkija Sr.
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

katury@utu.fi

Tykistökatu 6

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-5138-0889

Asiantuntijuusalueet

Naisen lisääntyminen; lisääntymis-immunologia; kohdun limakalvo; endometrioosi; pre-eklampsia; happiriippuvainen säätely; geenien säätely; yksisolu-transkriptomiikka

Biografia

2011, FT, University of Turku

2012-2015 Post Doc, Prof. Gunter Wagnerin ryhmä, Yale Systems Biology Institute, Yale University

2016-2018 Marie Curie Fellow- tutkija, Biolääketieteen laitos / Turun Biotekniikan keskus

2019- Tutkija, yhteistyöryhminä Prof. Laura Elo and Prof. Matti Poutanen ryhmät, Biotiedekeskus / Biolääketieteen laitos

2022- Dosentti, Biolääketieteen laitos

Tutkimus

Tutkimukseni keskittyy kohdun limakalvon geenisäätelyyn ja siihen liittyviin häiriöihin kuten endometrioosiin, pre-eklampsiaan ja runsaisiin kuukautisvuotoihin. Kohdun solujen toiminnan ymmärtämiseksi tutkin kohdun hormoonisäätelyä ja geenien ilmentymistä sekä laboratoriokokeilla että laskennallisilla menetelmillä. Erityisesti yksisolusekvensointi mahdollistaa kohdun eri solutyyppien tarkan solutyyppispesifisen analyysin.

Opetus

Luentoja kursseilla: Modern biotechnologies and bioinformatics; Systems biology; Bioinformatics in Drug Discovery.

Julkaisut

2/2

Transcriptional responses to hypoxia are enhanced by recurrent hypoxia (hypoxic preconditioning) in the epaulette shark (2012)
- Physiological Genomics
Rytkonen KT, Renshaw GMC, Vainio PP, Ashton KJ, Williams-Pritchard G, Leder EH, Nikinmaa M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evolutionary origins of oxygen sensing in animals (2011)
- EMBO Reports
Rytkönen K T, Storz J F
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Functional genomics in aquatic toxicology-Do not forget the function (2011)
- Aquatic Toxicology
Nikinmaa M, Rytkonen KT
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Molecular Evolution of the Metazoan PHD-HIF Oxygen-Sensing System (2011)
- Molecular Biology and Evolution
Rytkonen KT, Williams TA, Renshaw GM, Primmer CR, Nikinmaa M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The transcription of l-gulono-gamma-lactone oxidase, a key enzyme for biosynthesis of ascorbate, during development of Persian sturgeon Acipenser persicus (2011)
- Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry and Molecular Biology
Akbarzadeh A, Farahmand H, Mahjoubi F, Nematollahi MA, Leskinen P, Rytkonen K, Nikinmaa M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Hapenpuute ajoi kalat maalle (2010)
- Helsingin Sanomat
Rytkönen K
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä)