Kalle Rytkönen
Senior Research Fellow, InFLAMES Flagship, Institute of Biomedicine / Turku Bioscience Centre
katury@utu.fi Tykistökatu 6 Turku ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-5138-0889 |
Naisen lisääntyminen; lisääntymis-immunologia; kohdun limakalvo; endometrioosi; pre-eklampsia; happiriippuvainen säätely; geenien säätely; yksisolu-transkriptomiikka
2011, FT, University of Turku
2012-2015 Post Doc, Prof. Gunter Wagnerin ryhmä, Yale Systems Biology Institute, Yale University
2016-2018 Marie Curie Fellow- tutkija, Biolääketieteen laitos / Turun Biotekniikan keskus
2019- Tutkija, yhteistyöryhminä Prof. Laura Elo and Prof. Matti Poutanen ryhmät, Biotiedekeskus / Biolääketieteen laitos
2022- Dosentti, Biolääketieteen laitos
Tutkimukseni keskittyy kohdun limakalvon geenisäätelyyn ja siihen liittyviin häiriöihin kuten endometrioosiin, pre-eklampsiaan ja runsaisiin kuukautisvuotoihin. Kohdun solujen toiminnan ymmärtämiseksi tutkin kohdun hormoonisäätelyä ja geenien ilmentymistä sekä laboratoriokokeilla että laskennallisilla menetelmillä. Erityisesti yksisolusekvensointi mahdollistaa kohdun eri solutyyppien tarkan solutyyppispesifisen analyysin.
Luentoja kursseilla: Modern biotechnologies and bioinformatics; Systems biology; Bioinformatics in Drug Discovery.
- REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research (2026)
- Bioinformatics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Testosterone Exposure During Fetal Masculinization Programming Window Determines the Kidney Size in Adult Mice (2026)
- FASEB Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Disruption of HSD17B12 in mouse hepatocytes leads to reduced body weight and defect in the lipid droplet expansion associated with microvesicular steatosis (2024)
- FASEB Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells (2024)
- Reproductive Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Integrative analysis of endometriosis and adenomyosis through single-cell transcriptomics (2024)
- Human Reproduction
(Abstrakti) - Serum Hydroxysteroid (17beta) dehydrogenase 1 concentration in pregnant women correlates with pregnancy-associated plasma protein a but does not serve as an independent marker for preeclampsia (2024)
- Biology of Reproduction
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Cell type markers indicate distinct contributions of decidual stromal cells and natural killer cells in preeclampsia (2022)
- Reproduction
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - COVID-19-specific transcriptomic signature detectable in blood across multiple cohorts (2022)
- Frontiers in Genetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Dirichlet process mixture models for single-cell RNA-seq clustering (2022)
- Biology Open
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glycolysis and Heavy Menstrual Bleeding (2022)
- Reproductive Sciences
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
