Pekka Patrikainen
PhD
ptpatr@utu.fi Itäinen Pitkäkatu 4 C Turku Työhuone: 6049 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-4931-1817 |
Asiantuntijuusalueet
Synteettinen biologia, Synechocystis, Metaboliareittien muokkaus, Molekyylibiologia, Entsymologia, Luonnonyhdisteiden biosynteesi
Synteettinen biologia, Synechocystis, Metaboliareittien muokkaus, Molekyylibiologia, Entsymologia, Luonnonyhdisteiden biosynteesi
Tutkimus
Tutkimuksemme tarkoituksena on muokata syanobakteerien metaboliareittejä niin, että näitä fotosynteettisiä organismeja voitaisiin paremmin käyttää erilaisten kemikaalien tuottoisäntinä. Tavoitteena on lisäksi kehittää geneettisiä työkaluja, joilla syanobakteereja pystyttäisiin muokkaamaan entistä tehokkaammin. Tärkeitä tutkimuksessa käytettäviä välineitä ovat molekyylibiologiaa, mikrobiologia sekä erilaiset analyyttiset menetelmät.
Tarkempaa tietoa ryhmässämme tehtävästä tutkimuksesta löytyy "Synthetic biology of cyanobacteria" -tutkimusryhmän kotisivuilta osoitteesta http://utu.fi/sbc
Julkaisut
- CyanoConstruct: simple platform for cyanobacterial expression construct assembly and translational tuning (2026)
- BMC Biotechnology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Redirecting photosynthetic electron flux in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 by the deletion of flavodiiron protein Flv3 (2019)
- Microbial Cell Factories
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Comparison of orthologous cyanobacterial aldehyde deformylating oxygenases in the production of volatile C3-C7 alkanes in engineered E. coli (2017)
- Metabolic Engineering Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Engineering the cyanobacterium synechocystis Sp. PCC 6803 towards optimized solutions for future biotechnological applications (2017) Nagy C., Aro E., Kallio P., Patrikainen P., Thiel K., Dandapani H., Mulaku E., Kakko L.
(O2 Muu julkaisu ) - Structural and functional Studies of angucycline tailoring enzymes (2015) Patrikainen Pekka
(G5 Artikkeliväitöskirja) - Structure-Based Engineering of Angucyclinone 6-Ketoreductases. (2014)
- Chemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structural and Functional Analysis of Angucycline C-6 Ketoreductase LanV Involved in Landomycin Biosynthesis (2013)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE (2013)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Identification of Late-Stage Glycosylation Steps in the Biosynthetic Pathway of the Anthracycline Nogalamycin (2012)
- ChemBioChem
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Tailoring Enzymes Involved in the Biosynthesis of Angucyclines Contain Latent Context-Dependent Catalytic Activities (2012)
- Chemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Flavoprotein Hydroxylase PgaE Catalyzes Two Consecutive Oxygen-Dependent Tailoring Reactions in Angucycline Biosynthesis (2011)
- Biochemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Structure of Collagen Receptor Integrin alpha I-1 Domain Carrying the Activating Mutation E317A (2011)
- Journal of Biological Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali