Masi Valkonen
 


masi.f.valkonen@utu.fi

Julkaisut
  • The ACROBAT 2022 Challenge : Automatic Registration Of Breast Cancer Tissue  (2024)  
    • Medical Image Analysis
     Weitz, Philippe; Valkonen, Masi; Solorzano, Leslie; Carr, Circe; Kartasalo, Kimmo; Boissin, Constance; Koivukoski, Sonja; Kuusela, Aino; Rasic, Dusan; Feng, Yanbo; Pouplier, Sandra Sinius; Sharma, Abhinav; Eriksson, Kajsa Ledesma; Robertson, Stephanie; Marzahl, Christian; Gatenbee, Chandler D.; Anderson, Alexander R.A.; Wodzinski, Marek; Jurgas, Artur; Marini, Niccolò; Atzori, Manfredo; Müller, Henning; Budelmann, Daniel; Weiss, Nick; Heldmann, Stefan; Lotz, Johannes; Wolterink, Jelmer M.; De Santi, Bruno; Patil, Abhijeet; Sethi, Amit; Kondo, Satoshi; Kasai, Satoshi; Hirasawa, Kousuke; Farrokh, Mahtab; Kumar, Neeraj; Greiner, Russell; Latonen, Leena; Laenkholm, Anne-Vibeke; Hartman, Johan; Ruusuvuori, Pekka; Rantalainen, Mattias
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Volumetric analysis of the terminal ductal lobular unit architecture and cell phenotypes in the human breast  (2024)  
    • Cell Reports
     Paavolainen, Oona; Peurla, Markus; Koskinen, Leena M.; Pohjankukka, Jonna; Saberi, Kamyab; Tammelin, Ella; Sulander, Suvi-Riitta; Valkonen, Masi; Mourao, Larissa; Boström, Pia; Brück, Nina; Ruusuvuori, Pekka; Scheele, Colinda L.G.J.; Hartiala, Pauliina; Peuhu, Emilia
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • A Multi-Stain Breast Cancer Histological Whole-Slide-Image Data Set from Routine Diagnostics  (2023)  
    • Scientific Data
     Weitz P, Valkonen M, Solorzano L, Carr C, Kartasalo K, Boissin C, Koivukoski S, Kuusela A, Rasic D, Feng YB, Pouplier SS, Sharma A, Eriksson KL, Latonen L, Laenkholm AV, Hartman J, Ruusuvuori P, Rantalainen M
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting  (2023)  
    • Acta Neuropathologica Communications
     Rautajoki Kirsi, Jaatinen Serafiina, Hartewig Anja, Tiihonen Aliisa, Annala Matti, Salonen Iida, Valkonen Masi, Simola Vili, Vuorinen Elisa M., Kivinen Anni, Rauhala Minna, Nurminen Riikka, Maass Kendra, Lahtela Sirpa-Liisa, Jukkola Arja, Yli-Harja Olli, Helen Pauli, Pajtler Kristian, Ruusuvuori Pekka, Haapasalo Joonas, Zhang Wei, Haapasalo Hannu, Nykter Matti
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Interobserver reproducibility of cribriform cancer in prostate needle biopsies and validation of International Society of Urological Pathology criteria  (2023)  
    • Histopathology
     Egevad Lars, Delahunt Brett, Iczkowski Kenneth A, van der Kwast Theo, van Leenders Geert JLH, Leite Katia RM, Pan Chin-Chen, Samaratunga Hemamali, Tsuzuki Toyonori, Mulliqi Nita, Ji Xiaoyi, Olsson Henrik, Valkonen Masi, Ruusuvuori Pekka, Eklund Martin, Kartasalo Kimmo
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Artificial intelligence for diagnosis and Gleason grading of prostate cancer: the PANDA challenge  (2022)  
    • Nature Medicine
     Bulten Wouter, Kartasalo Kimmo, Chen Po-Hsuan Cameron, Ström Peter, Pinckaers Hans, Nagpal Kunal, Cai Yuannan, Steiner David F., van Boven Hester, Vink Robert, Hulsbergen-van de Kaa Christina, van der Laak Jeroen, Amin Mahul B., Evans Andrew J., van der Kwast Theodorus, Allan Robert, Humphrey Peter A., Grönberg Henrik, Samaratunga Hemamali, Delahunt Brett, Tsuzuki Toyonori, Häkkinen Tomi, Egevad Lars, Demkin Maggie, Dane Sohier, Tan Fraser, Valkonen Masi, Corrado Greg S., Peng Lily, Mermel Craig H., Ruusuvuori Pekka, Litjens Geert, Eklund Martin, the PANDA challenge consortium
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Spatial analysis of histology in 3D: quantification and visualization of organ and tumor level tissue environment  (2022)  
    • Heliyon
     Ruusuvuori Pekka, Valkonen Masi, Kartasalo Kimmo, Valkonen Mira, Visakorpi Tapio, Nykter Mira, Latonen Leena
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )


  • Predicting Molecular Phenotypes from Histopathology Images: A Transcriptome-Wide Expression-Morphology Analysis in Breast Cancer  (2021)  
    • Cancer Research
     Wang Yinxi, Kartasalo Kimmo, Weitz Philippe, Acs Balazs, Valkonen Masi, Larsson Christer, Ruusuvuori Pekka, Hartman Johan, Rantalainen Mattias
    (    A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )



Last updated on 2023-12-07 at 11:50