Johannes Cairns
Turku Collegium for Science, Medicine and Technology (TCSMT) johannes.cairns@utu.fi ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-1329-2025 |
ecology & evolution, resistance & resilience, bioinformatics, microbial model systems
I am a Collegium Researcher (Title of Docent in Evolutionary Genetics and Bioinformatics, 2023) at the University of Turku, where I lead the Microbial Evolutionary Genetics Lab (utu.fi/meg/). My research focuses on the eco-evolutionary dynamics of microbial communities, antibiotic resistance, and resilience, combining experimental evolution, molecular microbiology, and bioinformatics. I received my PhD in Microbiology from the University of Helsinki in 2018 and have since worked in Finland and the UK. I have authored more than 25 peer-reviewed articles and actively contribute to scientific collaboration, teaching, and science communication. In addition to the University of Turku, I am affiliated with the Department of Computer Science and Organismal and Evolutionary Biology Research Programme, University of Helsinki, and the Finnish Multidisciplinary Center of Excellence in Antimicrobial Resistance Research (FIMAR). Besides my science training, I also have academic training (PhD) and publications in environmental humanities, and am a founding and active member in One Health Finland (est. 2016), reflecting my broad interest in systemic approaches to global health and environmental challenges.
I study the eco-evolutionary dynamics of microbial communities, with a particular focus on how they adapt to environmental disturbances and antibiotic stress. By combining experimental evolution, genetic engineering, and bioinformatics, I aim to uncover the mechanisms that shape microbial resistance, resilience, and community interactions.
I have taught at bachelor’s, master’s, and doctoral levels, with experience ranging from lectures and seminars to workshops and curriculum development. My teaching has focused on microbiology, experimental evolution, molecular genetics, and bioinformatics, including international training initiatives. I have also co-designed course material and supervised students across degree levels.
- Jørn Borup: Decolonising the Study of Religion2025
- Temenos
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Pre-exposure of abundant species to disturbance improves resilience in microbial metacommunities (2025)
- Nature Ecology and Evolution
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Pre-exposure to disturbance enhances species resilience and protects from change (2025)
- Nature Ecology and Evolution
(B1 Vertaisarvioitu muu artikkeli (esim. pääkirjoitus, letter, comment) tieteellisessä lehdessä) - How Western Buddhist climate activists negotiate climate emotions (2024)
- Frontiers in Psychology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2024)
- Contemporary BuddhismNPJ Biodiversity
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Quantifying massively parallel microbial growth with spatially mediated interactions (2024)
- PLoS Computational Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - (2023)
- ISME Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Microbiological and Physicochemical Quality of Groundwater and Risk Factors for Its Pollution in Ouagadougou, Burkina Faso (2023)
- WaterEcology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Towards evolutionary predictions: Current promises and challenges (2023)
- Evolutionary Applications
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Understanding and applying biological resilience, from genes to ecosystems (2023)
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Understanding cellular growth strategies via optimal control2023)
- Journal of the Royal Society InterfaceLääkärilehti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Biological units of antimicrobial resistance and strategies for their containment in animal production (2022)
- FEMS Microbiology EcologyInocula : mikrobiologikillan julkaisu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Buddhalaisuus ja nykyinen ympäristökriisi: käytännön ympäristösuhteen historiallinen kehitys ja ympäristötoiminnan vaikuttavuus (2022) Cairns Johannes
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Effect of mutation supply on population dynamics and trait evolution in an experimental microbial community (2022)
- Ecology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of phenotypic variation on consumer coexistence and prey community structure (2022)
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Strong selective environments determine evolutionary outcome in time-dependent fitness seascapes (2022)
- Evolution letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Drug-induced resistance evolution necessitates less aggressive treatment (2021)
- PLoS Computational Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Antibioottiresistenssi haastaa monialaiseen yhteistyöhön (2020)
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - Evolution in interacting species alters predator life-history traits, behaviour and morphology in experimental microbial communities (2020)
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Mikrobit mediassa (2020)
(D1 Artikkeli ammattilehdessä)