Manu Tamminen
PhD, Docent
manu.tamminen@utu.fi Työhuone: 312 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5891-7653 |
Asiantuntijuusalueet
Molekyylibiologia, Bioinformatiikka, Mikrobigenetiikka, Mikrobiekologia
Molekyylibiologia, Bioinformatiikka, Mikrobigenetiikka, Mikrobiekologia
Biografia
- FM, Turun yliopisto, 2002
- FT, Helsingin yliopisto, 2011
- Tutkijatohtori, MIT, 2011-2013
- Tutkijatohtori, ETH Zürich, 2014-2017
- Dosentti, Turun yliopisto, 2017
- Yliopistonlehtori, Turun yliopisto, 2017-
Tutkimus
- Bakteereiden ja pienten eukaryoottien yksisolugenomiikka
- Antibioottiresistenssigeenien horisontaalinen siirtyminen
- NGS:n kvantitatiiviset sovellukset
Opetus
- SOMO1021 - Genetiikan jatkoluennot (2018)
- FYGE2242 - Mikrobigenetiikan laboratoriotyöt (2018)
- BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2018)
- FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2018)
- BIOL3050 - Bioinformatiikkaa biologeille (2019)
- BIOL3200 - Kandidaattiseminaarit (2019)
- BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2019)
- FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2019)
Julkaisut
- Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms (2018)
- Canadian Journal of Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Construction and Characterization of Synthetic Bacterial Community for Experimental Ecology and Evolution (2018)
- Frontiers in Genetics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Ecology determines how low antibiotic concentration impacts community composition and horizontal transfer of resistance genes (2018)
- Communications Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent (2018)
- FEMS Microbiology Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Proteome evolution under non-substitutable resource limitation (2018)
- Nature Communications
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Corrigendum: Mobile genes in the human microbiome are structured from global to individual scales (vol 535, pg 435, 2016) (2017)
- Nature
(O2 Muu julkaisu ) - Innovaatiota eurooppalaisittain ja amerikkalaisittain (2017)
- Tiedepolitiikka
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - Single-cell mass spectrometry reveals the importance of genetic diversity and plasticity for phenotypic variation in nitrogen-limited Chlamydomonas (2017)
- ISME Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Evaluating the mobility potential of antibiotic resistance genes in environmental resistomes without metagenomics (2016)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )