PhD, Docent Manu Tamminen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Manu Tamminen
PhD, Docent

- akatemiatutkija,
fysiologia ja genetiikka (biologian laitos)
- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

manu.tamminen@utu.fi

Työhuone: 312

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5891-7653

Research pages

Researchgate

Google Scholar

Asiantuntijuusalueet

Molekyylibiologia, Bioinformatiikka, Mikrobigenetiikka, Mikrobiekologia

Biografia

FM, Turun yliopisto, 2002
FT, Helsingin yliopisto, 2011
Tutkijatohtori, MIT, 2011-2013
Tutkijatohtori, ETH Zürich, 2014-2017
Dosentti, Turun yliopisto, 2017
Yliopistonlehtori, Turun yliopisto, 2017-

Tutkimus

Bakteereiden ja pienten eukaryoottien yksisolugenomiikka
Antibioottiresistenssigeenien horisontaalinen siirtyminen
NGS:n kvantitatiiviset sovellukset

Opetus

SOMO1021 - Genetiikan jatkoluennot (2018)
FYGE2242 - Mikrobigenetiikan laboratoriotyöt (2018)
BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2018)
FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2018)
BIOL3050 - Bioinformatiikkaa biologeille (2019)
BIOL3200 - Kandidaattiseminaarit (2019)
BIOL1301 - Genetiikan perusteet (2019)
FYGE 4031 - Genetiikan menetelmäopinnot II (2019)

Julkaisut

2/2

Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms (2018)
- Canadian Journal of Microbiology
Rinta-Kanto J., Pehkonen K., Sinkko H., Tamminen M., Timonen S.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Construction and Characterization of Synthetic Bacterial Community for Experimental Ecology and Evolution (2018)
- Frontiers in Genetics
Cairns J, Jokela R, Hultman J, Tamminen M, Virta M, Hiltunen T
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Ecology determines how low antibiotic concentration impacts community composition and horizontal transfer of resistance genes (2018)
- Communications Biology
Cairns Johannes, Ruokolainen Lasse, Hultman Jenni, Tamminen Manu, Virta Marko, Hiltunen Teppo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent (2018)
- FEMS Microbiology Ecology
Jenni Hultman, Manu Tamminen, Katariina Pärnänen, Johannes Cairns, Antti Karkman, Marko Virta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Proteome evolution under non-substitutable resource limitation (2018)
- Nature Communications
Tamminen M, Betz A, Pereira AL, Thali M, Matthews B, Suter MJ, Narwani A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Corrigendum: Mobile genes in the human microbiome are structured from global to individual scales (vol 535, pg 435, 2016) (2017)
- Nature
Brito IL, Yilmaz S, Huang K, Xu L, Jupiter SD, Jenkins AP, Naisilisili W, Tamminen M, Smillie CS, Wortman JR, Birren BW, Xavier RJ, Blainey PC, Singh AK, Gevers D, Alm EJ
(O2 Muu julkaisu )
Innovaatiota eurooppalaisittain ja amerikkalaisittain (2017)
- Tiedepolitiikka
Manu Tamminen
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Single-cell mass spectrometry reveals the importance of genetic diversity and plasticity for phenotypic variation in nitrogen-limited Chlamydomonas (2017)
- ISME Journal
Krismer J, Tamminen M, Fontana S, Zenobi R, Narwani A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evaluating the mobility potential of antibiotic resistance genes in environmental resistomes without metagenomics (2016)
- Scientific Reports
Parnanen K, Karkman A, Tamminen M, Lyra C, Hultman J, Paulin L, Virta M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )