PhD, Docent Manu Tamminen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Manu Tamminen
PhD, Docent

- yliopistonlehtori,
fysiologia ja genetiikka (biologian laitos)
- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

manu.tamminen@utu.fi

Työhuone: 312

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5891-7653

Research pages

Researchgate

Google Scholar

Asiantuntijuusalueet

Molekyylibiologia, Bioinformatiikka, Mikrobigenetiikka, Mikrobiekologia

Biografia

FM, Turun yliopisto, 2002
FT, Helsingin yliopisto, 2011
Tutkijatohtori, MIT, 2011-2013
Tutkijatohtori, ETH Zürich, 2014-2017
Dosentti, Turun yliopisto, 2017
Yliopistonlehtori, Turun yliopisto, 2017-

Tutkimus

Bakteereiden ja pienten eukaryoottien yksisolugenomiikka
Antibioottiresistenssigeenien horisontaalinen siirtyminen
NGS:n kvantitatiiviset sovellukset

Opetus

Julkaisut

2/4

Molecular Characterisation of Faecal Bacterial Assemblages Among Four Species of Syntopic Odonates (2024)
- Microbial Ecology
Morrill, Andre; Forbes, Mark; Vesterinen, Eero; Tamminen, Manu; Sääksjärvi, Ilari; Kaunisto, Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The role of early life factors and green living environment in the development of gut microbiota in infancy : Population-based cohort study (2024)
- Environment International
Ovaska, Minka; Tamminen, Manu; Lahdenperä, Mirkka; Vahtera, Jussi; Rautava, Samuli; Gonzales-Inca, Carlos; Heiskanen, Marja A.; Lagström, Hanna
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glyphosate and a glyphosate-based herbicide affect bumblebee gut microbiota (2023)
- FEMS Microbiology Ecology
Helander Marjo, Jeevannavar Aditya, Kaakinen Kimmo, Mathew Suni A., Saikkonen Kari, Fuchs Benjamin, Puigbò Pere, Loukola Olli J., Tamminen Manu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Portable BLAST-like algorithm library and its implementations for command line, Python, and R (2023)
- PLoS ONE
Schmid Steven, Jeevannavar Aditya, Julian Timothy R., Tamminen Manu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Influence of Microplastics on Microbial Structure, Function, and Mechanical Properties of Stream Periphyton (2022)
- Frontiers in Environmental Science
Merbt Stephanie N, Kroll Alexandra, Tamminen Manu, Rühs Patrick A, Wagner Bettina, Sgier Linn, Sembalova Olga, Abel Bernd, Tlili Ahmed, Schirmer Kristin, Behra Renata
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Prider: multiplexed primer design using linearly scaling approximation of set coverage (2022)
- BMC Bioinformatics
Smolander Niina, Julian Timothy R, Tamminen Manu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Quantitative online survey of self-perceived knowledge and knowledge gaps of medicines research and development among Finnish general public (2022)
- BMJ Open
Tran Minh Mirjami, Tamminen Manu, Tamminen-Sirkiä Jenni, Majumder Mamun Majumder, Tabassum Rubina, Lahti Tuuli
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Wastewater constituents impact biofilm microbial community in receiving streams (2022)
- Science of the Total Environment
Tamminen Manu, Spaak Jenny, Tlili Ahmed, Eggen Rik, Stamm Christian, Räsänen Katja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Digital multiplex ligation assay for highly multiplexed screening of beta-lactamase-encoding genes in bacterial isolates (2020)
- Communications Biology
Tamminen M, Spaak J, Caduff L, Schiff H, Lang R, Schmid S, Montealegre MC, Julian TR
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Perinnöllinen sairastumisalttius kiinnostaa kansalaisia (2020)
- Duodecim
Mirjami Tran Minh, Manu Tamminen, Jenni Tamminen-Sirkiä, Muntasir Mamun Majumder, Rubina Tabassum, Minna Anttonen, Tuuli Lahti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )