PhD, Docent Manu Tamminen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Manu Tamminen
PhD, Docent

- yliopistonlehtori,
fysiologia ja genetiikka (biologian laitos)
- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

manu.tamminen@utu.fi

Työhuone: 312

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5891-7653

Research pages

Researchgate

Google Scholar

Asiantuntijuusalueet

Molekyylibiologia, Bioinformatiikka, Mikrobigenetiikka, Mikrobiekologia

Biografia

FM, Turun yliopisto, 2002
FT, Helsingin yliopisto, 2011
Tutkijatohtori, MIT, 2011-2013
Tutkijatohtori, ETH Zürich, 2014-2017
Dosentti, Turun yliopisto, 2017
Yliopistonlehtori, Turun yliopisto, 2017-

Tutkimus

Bakteereiden ja pienten eukaryoottien yksisolugenomiikka
Antibioottiresistenssigeenien horisontaalinen siirtyminen
NGS:n kvantitatiiviset sovellukset

Opetus

Julkaisut

1/4

Bridge Capture permits cost-efficient, rapid and sensitive molecular precision diagnostics (2026)
- Journal of Molecular Diagnostics
Adamusová, Simona; Korkiakoski, Anttoni; Laine, Nea; Musku, Anna; Rantasalo, Tuula; Kim, Jorma; Blomster, Juuso; Laine, Jukka; Hirvonen, Tatu; Pursiheimo, Juha-Pekka; Tamminen, Manu
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The role of human milk oligosaccharides in shaping and restoring infant gut microbiota: Population-based cohort study (2026)
- American Journal of Clinical Nutrition
Ovaska, Minka; Tamminen, Manu; Lahdenperä, Mirkka; Rautava, Samuli; Jeevannavar, Aditya; Isokääntä, Heidi; Bode, Lars; Lagström, Hanna
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Cellular heterogeneity in metabolism and associated microbiome of a non-model phytoflagellate (2025)
- ISME Journal
Jeevannavar, Aditya; Florenza, Javier; Divne, Anna-Maria; Tamminen, Manu; Bertilsson, Stefan
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evaluation of Bridge Capture technology for mutation profiling in liquid biopsies of metastatic colorectal cancer patients (2025)
- Scientific Reports
Ganesan, Aparna; Korkiakoski, Anttoni; Adamusová, Simona; Musku, Anna; Rantasalo, Tuula; Laine, Nea; Andersson, Emma; Osterlund, Emerik; Ovissi, Ali; Halonen, Päivi; Hirvonen, Tatu; Kim, Jorma; Laine, Jukka; Silvoniemi, Antti; Minn, Heikki; Blomster, Juuso; Anttonen, Anna-Kaisa; Kytölä, Soili; Osterlund, Pia; Pursiheimo, Juha-Pekka; Nummela, Pirjo; Tamminen, Manu; Ristimäki, Ari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glyphosate and phosphate treatments in soil differentially affect crop microbiomes depending on species, tissue and growth stage (2025)
- Scientific Reports
Smolander, Niina; Fuchs, Benjamin; Helander, Marjo; Puigbo, Pere; Tamminen, Manu; Saikkonen, Kari; Mathew, Suni Anie
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
High-Throughput Multiplex Detection of Antibiotic-Resistant Genes and Virulence Factors in Escherichia coli Using Digital Multiplex Ligation Assay (2025)
- Journal of Molecular Diagnostics
Conforti, Sheena; Orts, Pablo Rossi; Tamminen, Manu; Julian, Timothy R.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Polyacrylamide bead split-pool method for microbial community analysis (2025)
- bioRxiv
Smolander, Niina; Talvitie, Jasmin; Tamminen, Manu
(O2 Muu julkaisu )
Complete genome sequences of 30 bacterial species from a synthetic community (2024)
- Microbiology resource announcements
Hogle, Shane L; Tamminen, Manu; Hiltunen, Teppo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Foundation species stabilize an alternative eutrophic state in nutrient disturbed ponds via selection on microbial community (2024)
- Frontiers in microbiology
Jeevannavar, Aditya; Narwani, Anita J.; Matthews, Blake; Spaak, Piet; Brantschen, Jeanine; Mächler, Elvira; Altermatt, Florian; Tamminen, Manu V.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Glyphosate residues in soil and phosphate fertilizer affect foliar endophytic microbial community composition and phytohormone levels in potato (2024)
- Phytobiomes journal
Mathew, Suni Anie; Jeevannavar, Aditya; Helander, Marjo; Tamminen, Manu; Puigbò, Pere; Rainio, Miia; Saikkonen, Kari; Fuchs, Benjamin
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )