Valtteri Nieminen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Valtteri Nieminen

- väitöskirjatutkija,
tietotekniikan laitos (teknillinen tiedekunta)
- projektitutkija,
terveysteknologia (tietotekniikan laitos)

valtteri.a.nieminen@utu.fi

Työhuone: 452B

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-3550-0561

Asiantuntijuusalueet

Machine Learning; Data Analysis; Life Sciences; Education; Medical Informatics

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

Currently I am working on the data-privacy related PRIVASA project and the HCT 2.0 project.

Biografia

Tutkimus

My research focus is on data privacy-preserving learning techniques in life sciences, machine learning methods and federated learning techniques. Additionally I work with data harmonization and federation in medicine, such as the OMOP Common data model.

Opetus

Data analytics courses teaching assistant.

Julkaisut

2318P FALCON: A novel high-quality cancer network for RWE (2025)
- Annals of Oncology
Golozar A.; Verbiest A.T.L.; Ryzhenkov A.; Nieminen V.; Hoffmann K.; Janssens A.; López Gómez C.; Kauko T.; Methot J.; Minne J.; Moesgaard Eschen A.; Morgan Stewart H.; Stone T.; Tajanen-Doumbouya P.; Theophanous S.; Van Schoor Z.; Enerly E.; Porkka K.; Reich C.; Fey E.
(O2 Muu julkaisu )
FinOMOP Swarm Learning – Distributed Deep Learning for Patient-Specific
Predictive Modelling of Acute Myeloid Leukemia (2025) Eric Fey, Valtteri Nieminen, Salma Rachidi, Hartmut Schultze, Vytis Vadoklis, Perre Gustafsson, Johansson Markus, Kauko Tommi, Anna Hammais, Kukkurainen Sampo, Niemelä Sami, Tuomas Hakala, Alexey Ryzhenkov, Tomi Mäkelä, Oscar Brück, Joachim Schultze, Tarja Laitinen, Arho Virkki, Kimmo Porkka
(O2 Muu julkaisu )
Large-Scale Network Study on the Impact of Immune Checkpoint Therapy in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer: The iCAN mNSCLC Study-a-Thon (2025) Valtteri Nieminen; Annelies Verbiest; Alexey Ryzhenkov; Stelios Theophanous; Geoff Hall; Thejas Bharadwaj; Jasmin Carus; Vagelis Chandakas; Eleanor Cheese; Wei Hai Deng; Dmytro Dymshyts; Espen Enerly; Otto Ettala; Michael Franz; Katja Hoffmann; Mikael Högerman; Annelies Janssens; Tommi Kauko; Martin Koch; Sampo Kukkurainen; Harri Rantala; Carlos López Gómez; Álvaro Martínez Pérez; John Methot; Agnes Moesgaard Eschen; Henry Morgan; María Eugenia Gas López; Parisa Movahedi; Tomi Mäkelä; Ghazaleh Niknam; Laura Perez; Christian Reich; Tom Stone; Ping Sun; Pia Tajanen-Doumbouya; Zarah Van Schoor; Åsa Öjlert; Ilkka Ilonen; Paula Kauppi; Elad Sharon; Daniel Smith; Georgina Kennedy; Åslaug Helland; Eric Fey; Asieh Golozar; Aija Knuuttila; Kimmo Porkka
(O2 Muu julkaisu )
P1.17.67 A Large-Scale Network Study on Impact of Immune Checkpoint Therapy in Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer: The iCan mNSCLC Study-A-Thon (2025)
- Journal of Thoracic Oncology
Ilonen I.; Verbiest A.; Theophanous S.; Ryzhenkov A.; Nieminen V.; Bharadwaj T.; Carus J.; Chandakas V.; Cheese E.; Deng W.H.; Dymshyts D.; Enerly E.; Ettala O.; Franz M.; Hoffmann K.; Högerman M.; Janssens A.; Kauko T.; Koch M.; Kukkurainen S.; López Gómez C.; Martìnez Pèrez À.; Methot J.; Moesgaard Eschen A.; Morgan Stewart H.; Gas López M.E.; Movahedi P.; Mäkelä T.; Ghazaleh N.; Nute A.; Perez L.; Reich C.; Stone T.; Sun P.; Tajanen-Doumbouya P.; Van Schoor Z.; Öjlert Å.; Kauppi P.; Sharon E.; Smith D.; Kennedy G.; Helland Å.; Fey E.; Golozar A.; Knuuttila A.; Porkka K.; Rantala H.
(O2 Muu julkaisu )
Response to Commentary by Dehaene et al. on Synthetic Discovery is not only a Problem of Differentially Private Synthetic Data (2025)
- Methods of Information in Medicine
Montoya Perez, Ileana; Movahedi, Parisa; Nieminen, Valtteri; Airola, Antti; Pahikkala, Tapio
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Adopting the OMOP Oncology CDM at the Helsinki University Hospital (2024) Valtteri Nieminen, Alexey Ryzhenkov, Johanna Sanoja, Salma Rachidi, Juho Lähteenmaa, Joonas Laitinen, Samu
Eränen, Johanna Niklander, Anna Kuosmanen, Oscar Brück, Pasi Rikala, Anna Virtanen, Marianna Niemi, Tomi
Mäkelä, Eric Fey, Kimmo Porkka
(Konferenssiposteri)
Benchmarking Evaluation Protocols for Classifiers Trained on Differentially Private Synthetic Data (2024)
- IEEE Access
Movahedi, Parisa; Nieminen, Valtteri; Perez, Ileana Montoya; Daafane, Hiba; Sukhwal, Dishant; Pahikkala, Tapio; Airola, Antti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Deep Learning Models for Predicting Overall Survival of Acute Myeloid Leukemia Using Short-Term Longitudinal Blood Measurements and the Omop Common Data Model (2024)
- Blood
Rachidi, Salma; Ryzhenkov, Alexey; Nieminen, Valtteri; Mäkelä, Tomi P.; Brück, Oscar; Porkka, Kimmo; Fey, Eric
(Abstrakti)
Does Differentially Private Synthetic Data Lead to Synthetic Discoveries? (2024)
- Methods of Information in Medicine
Montoya Perez, Ileana; Movahedi, Parisa; Nieminen, Valtteri; Airola, Antti; Pahikkala, Tapio
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Finnish perspective on using synthetic health data to protect privacy: the PRIVASA project (2024)
- Applied Computing and Intelligence
Pitkämäki, Tinja; Pahikkala, Tapio; Montoya Perez, Ileana; Movahedi, Parisa; Nieminen, Valtteri; Southerington, Tom; Vaiste, Juho; Jafaritadi, Mojtaba; Khan, Muhammad Irfan; Kontio, Elina; Ranttila, Pertti; Pajula, Juha; Pölönen, Harri; Degerli, Aysen; Plomp, Johan; Airola, Antti
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Relationships between self-efficacy and learning approaches as perceived by computer science students (2024)
- Frontiers in Education
Laitinen, Satu; Christopoulos, Athanasios; Laitinen, Petteri; Nieminen, Valtteri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Empirical evaluation of amplifying privacy by subsampling for GANs to create differentially private synthetic tabular data (2023)
- CEUR Workshop Proceedings
TKTP 2023: Annual Symposium for Computer Science 2023: Proceedings of the 40th Anniversary Symposium of the Finnish Society for Computer Science Nieminen Valtteri A., Pahikkala Tapio, Airola Antti
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
Evaluating Classifiers Trained on Differentially Private Synthetic Health Data (2023)
- Proceedings (IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems)
2023 IEEE 36th International Symposium on Computer-Based Medical Systems Movahedi Parisa, Nieminen Valtteri, Montoya Perez Ileana, Pahikkala Tapio, Airola Antti
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa)
Aging and sleep deprivation affect different neurocognitive stages of spatial information processing during a virtual driving task – An ERP study (2022)
- Transportation Research Part F: Traffic Psychology and Behaviour
Rashid Izullah Faramosh, Koivisto Mika, Nieminen Valtteri, Luimula Mika, Hämäläinen Heikki
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Differential interactions of age and sleep deprivation in driving and spatial perception by male drivers in a virtual reality environment (2021)
- Scandinavian Journal of Psychology
Izullah Faramosh Rashid, af Schulten Anna, Koivisto Mika, Nieminen Valtteri, Luimula Mika, Hämäläinen Heikki
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
ProMot-menetelmä opiskelumotivaatiotaidon kehittämiseksi (2020) OHO-opas - opiskelukykyä, hyvinvointia ja osallisuutta korkeakouluihin Ari Kaukiainen, Tiina Tuominen, Satu Laitinen, Janne Rantasaari, Valtteri Nieminen
(D2 Artikkeli ammatillisessa kokoomateoksessa)