PhD Tapio Lönnberg - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Tapio Lönnberg
PhD

- ,
InFLAMES Lippulaiva (lääketieteellinen tiedekunta)
- erikoistutkija Sr.,
Turun biotiedekeskus (erilliset laitokset)
- dosentti,
biotekniikka (bioteknologian laitos)

Turku Bioscience Centre

taplon@utu.fi

Tykistökatu 6

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/orcid.org/0000-0003-4484-5657

Lab website

Asiantuntijuusalueet

Single-cell genomics, immunology

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

Single-cell immunogenomics research group at Turku Bioscience Centre; InFLAMES Flagship

Biografia

Phd 2012, University of Turku, supervised by Prof. Riitta Lahesmaa and Prof. Matej Orešič
Postdoc 2023-2016, Teichmann lab, EMBL-EBI and Wellcome Trust Sanger Institute, UK
Academy of Finland postdoc 2017-2020, Turku Bioscience Centre, University of Turku
2021- Group Leader at InFLAMES Flagship
Secretary of the Finnish Society for Immunology

Tutkimus

Our research aims at gaining deeper understanding of cell fate decisions in the immune system. We leverage single-cell and spatial omics to explore phenotypic heterogeneity beyond the immune cell subsets defined by the expression of cell surface markers. Our current research encompasses arthritic, autoimmune and cardiovascular diseases, aiming to identify core gene modules that are associated with disease state and can be exploited for more efficient diagnosis, patient stratification, and therapies.

Opetus

Modern biotechnologies and bioinformatics
Medical biotechnology
Advanced Immunology

Julkaisut

3/3

From a gene-centric to whole-proteome view of differentiation of T helper cell subsets (2013)
- Briefings in Functional Genomics
Lonnberg T, Chen Z, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Global Chromatin State Analysis Reveals Lineage-Specific Enhancers during the Initiation of Human T helper 1 and T helper 2 Cell Polarization (2013)
- Immunity
Hawkins RD, Larjo A, Tripathi SK, Wagner U, Luu Y, Lönnberg T, Raghav SK, Lee LK, Lund R, Ren B, Lähdesmäki H, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Holistic Systems Biology Approaches to Molecular Mechanisms of Human Helper T Cell Differentiation to Functionally Distinct Subsets (2013)
- Scandinavian Journal of Immunology
Chen Z, Lonnberg T, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
An integrative computational systems biology approach identifies differentially regulated dynamic transcriptome signatures which drive the initiation of human T helper cell differentiation (2012)
- BMC Genomics
Äijö Tarmo, Edelman Sanna M, Lönnberg Tapio, Larjo Antti, Kallionpää Henna, Tuomela Soile, Engström Emilia, Lahesmaa Riitta, Lähdesmäki Harri
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Quantitative proteomics analysis of the nuclear fraction of human CD4+ cells in the early phases of IL-4-induced Th2 differentiation (2010)
- Molecular and Cellular Proteomics
Moulder R, Lönnberg T, Elo LL, Filen JJ, Rainio E, Corthals G, Oresic M, Nyman TA, Aittokallio T, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A human ImmunoChip cDNA microarray provides a comprehensive tool to study immune responses (2005) Nikula T, West A, Katajamaa M, Lonnberg T, Sara R, Aittokallio T, Nevalainen OS, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )