Leo Lahti
Professor
leo.lahti@utu.fi +358 29 450 2390 +358 50 436 4626 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 452E ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-5537-637X |
Data science; AI; Machine Learning; Applied statistics; Statistical programming; Probabilistic models; Complex natural and social systems; Microbial ecology; Computational humanities; Open knowledge
Leo Lahti is professor in Data Science in University of Turku, Finland. His research team focuses on computational analysis and modeling of complex natural and social systems. Lahti obtained doctoral degree (DSc) from Aalto University in Finland (2010), developing probabilistic machine learning methods for high-throughput life science data integration. This was followed by subsequent postdoctoral research at EBI/Hinxton (UK), Wageningen University (NL), and VIB/KU Leuven (BE). Lahti has coordinated international networks in data science methods and applications and organizes international data science training events on a regular basis. He is vice chair for the national coordination on open science Finland, executive committee member for the International Science Council Committee on Data (2023-2025), member of the global Bioconductor Community Advisory Board, and founder of the open science work group of Open Knowledge Finland ry. For more information, see the research homepage iki.fi/Leo.Lahti
Computational scientist focusing on change in complex natural and social systems, and how they can be understood through a computational lens.
Computational and data science, statistical and probabilistic programming, machine learning, AI, applied statistics, ecological models, open science
- Distinct Diet-Microbiota-Metabolism Interactions in Overweight and Obese Pregnant Women: a Metagenomics Approach (2022)
- Microbiology spectrum
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Early prediction of incident liver disease using conventional risk factors and gut-microbiome-augmented gradient boosting (2022)
- Cell Metabolism
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Enhancing biomarkers with co-abundance (2022)
- Nature Computational Science
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä ) - FdeSolver: A Julia Package for Solving Fractional Differential Equations (2022)
- arXiv.org
(O2 Muu julkaisu ) - Gut Microbiome Composition Is Predictive of Incident Type 2 Diabetes in a Population Cohort of 5,572 Finnish Adults (2022)
- Diabetes Care
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Infant fecal microbiota composition and attention to emotional faces (2022)
- Emotion
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Multi-Trait Genetic Analysis Reveals Clinically Interpretable Hypertension Subtypes (2022)
- Circulation: Genomic and Precision Medicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Phylogeny-Aware Analysis of Metagenome Community Ecology Based on Matched Reference Genomes while Bypassing Taxonomy (2022)
- MSystems
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Potential pathobionts in vaginal microbiota are affected by fish oil and/or probiotics intervention in overweight and obese pregnant women (2022)
- Biomedicine and Pharmacotherapy
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Probabilistic Multivariate Early Warning Signals (2022)
- Lecture Notes in Computer Science
(A4 Vertaisarvioitu artikkeli konferenssijulkaisussa) - Quantifying the impact of ecological memory on the dynamics of interacting communities (2022)
- PLoS Computational Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Skin microbiota diversity among genetically unrelated individuals of Indian origin (2022)
- PeerJ
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The Anatomy of eighteenth Century Collections online (eCCO)1 (2022)
- Eighteenth Century Studies
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Towards standardized and reproducible research in skin microbiomes (2022)
- Environmental Microbiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Applications of Machine Learning in Human Microbiome Studies: A Review on Feature Selection, Biomarker Identification, Disease Prediction and Treatment (2021)
- Frontiers in Microbiology
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Corpus Linguistics and Eighteenth Century Collections Online (ECCO) (2021)
- Research in Corpus Linguistics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Efficient computation of Faith's phylogenetic diversity with applications in characterizing microbiomes (2021)
- Genome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Examining the Early Modern Canon: The English Short Title Catalogue and Large-Scale Patterns of Cultural Production (2021) Data Visualization in Enlightenment Literature and Culture Tolonen Mikko, Hill Mark J., Ijaz Ali Z., Vaara Ville, Lahti Leo
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Exit time as a measure of ecological resilience (2021)
- Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbiota diversity but not composition is related to saliva cortisol stress response at the age of 2.5 months (2021)
- Stress
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )