PhD Tiina Sävilammi - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Tiina Sävilammi
PhD

- tutkijatohtori,
fysiologia ja genetiikka (biologian laitos)

tmsavi@utu.fi

Natura, yliopistonmäki

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9836-3843

Asiantuntijuusalueet

Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät, bioinformatiikka, genomiikka, epigenomiikka, mikrobiomit. Linux-käyttöjärjestelmä, ohjelmointikielet Java, Perl, R. Relaatiotiotokannat ja Spring Boot Hibernate.

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

FINEBIOME (Finnish eDNA/equine microbiome) -tutkimusryhmä tutkii hevosen suolistomikrobiomia. www.hevosenmikrobiomitutkimus.fi

Biografia

Tutkimus

Tällä hetkellä tutkin uuden faagiavusteisen sekvensointikirjastojen tekomenetelmän suorituskykyä ja sovellan sitä hevosen suolistomikrobiston tutkimukseen. Soveltavan tutkimuksen tarkoituksena on selvittää, miten suolistomikrobiston funktiot ja lajisto muuttuu kroonisen suolistotulehduksen (IBD) seurauksena.

Julkaisut

Gut Microbiota Profiling as a Promising Tool to Detect Equine Inflammatory Bowel Disease (IBD) (2024)
- Animals
Sävilammi, Tiina; Alakangas, Rinna-Riikka; Häyrynen, Tuomas; Uusi-Heikkilä, Silva
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The molecular mechanisms of rapid thermal adaptation in European grayling (2024) Sävilammi, Tiina
(G5 Artikkeliväitöskirja)
Whole-genome Analysis Reveals Contrasting Relationships Among Nuclear and Mitochondrial Genomes Between Three Sympatric Bat Species (2023)
- Genome Biology and Evolution
Laine Veronika N, Sävilammi Tiina, Wahlberg Niklas, Meramo Katarina, Ossa Gonzalo, Johnson Joseph S, Blomberg Anna S, Yeszhanov Aidyn B, Yung Veronica, Paterson Steve, Lilley Thomas M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genetic-based evaluation of management units for sustainable vendace (Coregonus albula) fisheries in a large lake system (2022)
- Fisheries Research
Karjalainen Juha, Sjövik Rosanna, Väänänen Tuula, Sävilammi Tiina, Sundberg Lotta-Riina, Uusi-Heikkilä Silva, Marjomäki Timo J.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Cytosine methylation patterns suggest a role of methylation in plastic and adaptive responses to temperature in European grayling (Thymallus thymallus) populations (2020)
- Epigenetics
Tiina Sävilammi , Spiros Papakostas , Erica H. Leder , L. Asbjørn Vøllestad, Paul V. Debes, Craig R. Primmer
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Population Connectivity Predicts Vulnerability to White-Nose Syndrome in the Chilean Myotis (Myotis chiloensis)-A Genomics Approach (2020)
- G3: genes, genomes, genetics
Thomas M. Lilley, Tiina Sävilammi, Gonzalo Ossa, Anna S. Blomberg, Anti Vasemägi, Veronica Yung, David L. J. Vendrami, Joseph S. Johnson
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The Chromosome-Level Genome Assembly of European Grayling Reveals Aspects of a Unique Genome Evolution Process Within Salmonids (2019)
- G3: genes, genomes, genetics
Sävilammi T, Primmer CR, Varadharajan S, Guyomard R, Guiguen Y, Sandve SR, Vollestad LA, Papakostas S, Lien S
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Rapid, broad-scale gene expression evolution in experimentally harvested fish populations (2017)
- Molecular Ecology
Silva Uusi-Heikkilä, Tiina Sävilammi, Erica Leder, Robert Arlinghaus, Craig R. Primmer
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )