Sami Kurkinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Sami Kurkinen

biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

sami.t.kurkinen@utu.fi

Julkaisut

Virtual Screening Strategy to Identify Retinoic Acid-Related Orphan Receptor γt Modulators (2023)
- Molecules
Jokinen Elmeri M, Niemeläinen Miika, Kurkinen Sami T, Lehtonen Jukka V, Lätti Sakari, Postila Pekka A, Pentikäinen Olli T, Niinivehmas Sanna P
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome (2022)
- Photochemical and Photobiological Sciences
Lehtivuori Heli, Rumfeldt Jessica, Mustalahti Satu, Kurkinen Sami, Takala Heikki
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Ligand-Enhanced Negative Images Optimized for Docking Rescoring (2022)
- International Journal of Molecular Sciences
Kurkinen Sami T, Lehtonen Jukka V, Pentikäinen Olli T, Postila Pekka A
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Optimization of Cavity-Based Negative Images to Boost Docking Enrichment in Virtual Screening (2022)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Kurkinen Sami T., Lehtonen Jukka V., Pentikäinen Olli T., Postila Pekka A.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Cavity-based negative images in molecular docking (2021) Kurkinen Sami
(G5 Artikkeliväitöskirja)
Detection of binding sites on SARS-CoV-2 Spike protein receptor-binding domain by molecular dynamics simulations in mixed solvents (2021)
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
Jokinen Elmeri M., Gopinath Krishnasamy, Kurkinen Sami T., Pentikäinen Olli T.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Negative Image-Based Screening: Rigid Docking Using Cavity Information (2021) Protein-Ligand Interactions and Drug Design Postila Pekka A., Kurkinen Sami T., Pentikäinen Olli T.
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa)
Inhibition of Pneumolysin Cytotoxicity by Hydrolysable Tannins (2020)
- Antibiotics
Santeri Maatsola, Sami Kurkinen, Marica T. Engström, Thomas K. M. Nyholm, Olli Pentikäinen, Juha-Pekka Salminen, Sauli Haataja
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Screening of Natural Products Targeting SARS-CoV-2-ACE2 Receptor Interface - A MixMD Based HTVS Pipeline (2020)
- Frontiers in Chemistry
Krishnasamy Gopinath, Elmeri M. Jokinen, Sami T. Kurkinen, Olli T. Pentikäinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
A Practical Perspective: The Effect of Ligand Conformers on the Negative Image-Based Screening (2019)
- International Journal of Molecular Sciences
Ahinko M, Kurkinen ST, Niinivehmas SP, Pentikäinen OT, Postila PA
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Getting Docking into Shape Using Negative Image-Based Restoring (2019)
- Journal of Chemical Information and Modeling
Sami T. Kurkinen, Sakari Lätti, Olli T. Pentikäinen, Pekka A. Postila
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )