Tavallisimmat iskeemisen aivoverenkiertohäiriön (AVH) syyt ovat ateroskleroosi suurissa valtimoissa, pienten suonten tauti ja sydänperäiset syyt. Aivoinfarkteista ja ohimenevistä aivoverenkiertohäiriöistä (TIA) noin 15 - 40 % on sydänperäisiä. Tieto merkittävästä sydänsairaudesta herättää sydänperäisen embolian epäilyn, mutta sen diagnoosi edellyttää embolialähteen osoittamisen. Eteisvärinä on yleisin sydänperäisen embolisaation syy, ja sitä tulee etsiä aktiivisesti iskemisen aivoverenkiertohäiriön jälkeen. Eteisvärinärytmin toteaminen näillä potilailla edellyttää pysyvän antikoagulaatiohoidon aloitusta, samoin kuin sydämen sisäisen trombin havaitseminen. Ruokatorven kautta tehtävä sydämen kaikukuvaus (TEE) on osoittautunut rintakehän päältä tehtävää sydämen kaikukuvausta (TTE) herkemmäksi löytämään tiettyjä sydänperäisiä embolialähteitä. On myös tilanteita, jolloin sydämen kaikukuvauksen lisäksi tarvitaan muita kuvantamismenetelmiä.