Kari Auranen
Ph.D. (biometry, Helsinki University, 1999)
Department of Mathematics and Statistics kajuaur@utu.fi +358 29 450 4320 +358 50 350 6920 Vesilinnantie 5 Turku |
Asiantuntijuusalueet
epidemiologisten ja kohorttitutkimusten tilastollinen analyysi; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; infektioiden leviämisen mallintaminen
epidemiologisten ja kohorttitutkimusten tilastollinen analyysi; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; infektioiden leviämisen mallintaminen
Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe
infektioiden ja niiden leviämisen tilastollinen mallintaminen; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; rokotetutkimusten vastemuuttujien määrittely
infektioiden ja niiden leviämisen tilastollinen mallintaminen; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; rokotetutkimusten vastemuuttujien määrittely
Biografia
Toimin tilastotieteen professorina Turun yliopiston matematiikan ja tilastotieteen laitoksessa sekä lääketieteellisen tiedekunnan kliinisessä laitoksessa. Ennen siirtymistäni Turkuun olin lähes 20 vuotta tutkijana Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksessa (THL), jossa alaani olivat erilaiset rokotusten vaikutuksiin liittyvät kysymykset ja niihin liittyvä tilastomenetelmien kehitys. Vuosina 2006-2012 toimin THL:n ryhmän päätutkijana kansainvälisessä Grand Challenges in Global Health -osahankkeessa, jonka tavoitteena oli mahdollistaa pneumokokkibakteerin nenänielukantajuuden käyttö rokotekokeiden vastemuuttujana.
Tutkimus
Kiinnostukseni kohteita ovat mm. infektioiden leviämisen ja rokotusten vaikutusten tilastollinen mallintaminen sekä pneumokokkibakteerin epidemiologia. Bayes-päättelyä olen käyttänyt ongelmissa, joissa on paljon havaitsematta jääneitä muuttujia. Tämä on yleistä infektioiden leviämistä tai dynamiikkaa koskevissa aineistoissa. Opiskelijoideni kanssa olen viime aikoina siirtynyt tutkimaan myös elinaika- ja pitkittäisvasteiden yhteismalleja, erityisesti ns. mediaatioanalyysin kannalta.
Opetus
Opetan pääasiassa biometrian alan kursseja. Viimeaikaisia kurssejani ovat olleet mm. Elinaika-analyysi, Kokeiden suunnittelu ja analyysi sekä Epidemiologian tilastolliset menetelmät.
Julkaisut 
3/3
- Effectiveness of 10-valent pneumococcal conjugate vaccine estimated with three parallel study designs among vaccine-eligible children in Finland (2020)
- Vaccine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effectiveness of 2 Influenza Vaccines in Nationwide Cohorts of Finnish 2-Year-Old Children in the Seasons 2015-2016 Through 2017-2018 (2020)
- Clinical Infectious Diseases
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Impact and effectiveness of a conjugate vaccine against invasive pneumococcal disease in Finland-a modelling approach (2020)
- Human Vaccines and Immunotherapeutics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Koronaepidemian mallinnuksen lähtökohdat, tavoitteet ja ongelmat (2020)
- Duodecim
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä) - Capturing multiple-type interactions into practical predictors of type replacement following human papillomavirus vaccination (2019)
- Philosophical Transactions B: Biological Sciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effectiveness of the ten-valent pneumococcal Haemophilus influenzae protein D conjugate vaccine (PHiD-CV10) against all respiratory tract infections in children under two years of age (2019)
- Vaccine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Fast approximate computation of cervical cancer screening outcomes by a deterministic multiple-type HPV progression model (2019)
- Mathematical Biosciences
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Changing molecular epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Southwest Finland, 2007 - 2016 (2018) Jenna Junnila, Tiina Hirvioja, Kaisu Rantakokko-Jalava, Kari Auranen, Esa Rintala, Laura Lindholm, Jaakko Silvola, Harri Marttila, Anu Harttio-Nohteri, Kirsi Gröndahl-Yli-Hannuksela, Jaana Vuopio
(O2 Muu julkaisu ) - F-18-FDG-PET/CT based total metabolic tumor volume change during neoadjuvant chemotherapy predicts outcome in advanced epithelial ovarian cancer (2018)
- European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Long-term impact of 10-valent pneumococcal conjugate vaccination on invasive pneumococcal disease among children in Finland (2018)
- Vaccine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Surveillance of Circulating Bordetella pertussis Strains in Europe during 1998 to 2015 (2018)
- Journal of Clinical Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Acquisition and Transmission of Streptococcus pneumoniae Are Facilitated during Rhinovirus Infection in Families with Children (2017)
- American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Epidemiology of hepatitis B infection in Finland: Implications for immunisation policy (2017)
- Vaccine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Obesity, Underweight, and Smoking are Associated with Worse Cardiorespiratory Fitness in Finnish Healthy Young Men: a Population-Based Study (2017)
- Frontiers in Public Health
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Simulations for designing and interpreting intervention trials in infectious diseases (2017)
- BMC Medicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Sustained reduction in vaccine-type invasive pneumococcal disease despite waning effects of a catch-up campaign in Kilifi, Kenya: A mathematical model based on pre-vaccination data (2017)
- Vaccine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - New Pneumococcal Carriage Acquired in Association with Acute Respiratory Infection Is Prone to Cause Otitis Media (2016)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Revealing the True Incidence of Pandemic A (H1N1)pdm09 Influenza in Finland during the First Two Seasons - An Analysis Based on a Dynamic Transmission Model (2016)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Optimal observation times for multi-state Markov models - applications to pneumococcal colonisation studies (2015)
- Journal of the Royal Statistical Society: Series C
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Turun yliopiston Tutkimustietojärjestelmän portaali