Ph.D. (biometry, Helsinki University, 1999) Kari Auranen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Kari Auranen
Ph.D. (biometry, Helsinki University, 1999)

- professori,
tilastotiede (matematiikan ja tilastotieteen laitos)

Department of Mathematics and Statistics

kajuaur@utu.fi

+358 29 450 4320

+358 50 350 6920

Vesilinnantie 5

Turku

Asiantuntijuusalueet

epidemiologisten ja kohorttitutkimusten tilastollinen analyysi; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; infektioiden leviämisen mallintaminen

Tutkimusyhteisö tai tutkimusaihe

infektioiden ja niiden leviämisen tilastollinen mallintaminen; rokotusten vaikutusten arvioinnin menetelmät; rokotetutkimusten vastemuuttujien määrittely

Biografia

Toimin tilastotieteen professorina Turun yliopiston matematiikan ja tilastotieteen laitoksessa sekä lääketieteellisen tiedekunnan kliinisessä laitoksessa. Ennen siirtymistäni Turkuun olin lähes 20 vuotta tutkijana Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksessa (THL), jossa alaani olivat erilaiset rokotusten vaikutuksiin liittyvät kysymykset ja niihin liittyvä tilastomenetelmien kehitys. Vuosina 2006-2012 toimin THL:n ryhmän päätutkijana kansainvälisessä Grand Challenges in Global Health -osahankkeessa, jonka tavoitteena oli mahdollistaa pneumokokkibakteerin nenänielukantajuuden käyttö rokotekokeiden vastemuuttujana.

Tutkimus

Kiinnostukseni kohteita ovat mm. infektioiden leviämisen ja rokotusten vaikutusten tilastollinen mallintaminen sekä pneumokokkibakteerin epidemiologia. Bayes-päättelyä olen käyttänyt ongelmissa, joissa on paljon havaitsematta jääneitä muuttujia. Tämä on yleistä infektioiden leviämistä tai dynamiikkaa koskevissa aineistoissa. Opiskelijoideni kanssa olen viime aikoina siirtynyt tutkimaan myös elinaika- ja pitkittäisvasteiden yhteismalleja, erityisesti ns. mediaatioanalyysin kannalta.

Opetus

Opetan pääasiassa biometrian alan kursseja. Viimeaikaisia kurssejani ovat olleet mm. Elinaika-analyysi, Kokeiden suunnittelu ja analyysi sekä Epidemiologian tilastolliset menetelmät.

Julkaisut

1/3

Duration of ADHD medication treatment among Finnish children and adolescents - a nationwide register study (2025)
- European Child and Adolescent Psychiatry
Kolari, Terhi A.; Vuori, Miika; Rättö, Hanna; Varimo, Eveliina A.; Aronen, Eeva T.; Auranen, Kari; Saastamoinen, Leena K.; Ruokoniemi, Päivi T.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Elementary methods provide more replicable results in microbial differential abundance analysis (2025)
- Briefings in Bioinformatics
Pelto, Juho; Auranen, Kari; Kujala, Janne V.; Lahti, Leo
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Hospital Visits Associated With Oral Infections in Patients With Neurofibromatosis Type 1: A Register-Based Analysis (2025)
- American Journal of Medical Genetics Part A
Reinhold, Vivian; Kallionpää, Roope; Valtanen, Mikko; Auranen, Kari; Syrjänen, Stina; Peltonen, Sirkku; Peltonen, Juha
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Increasing trend of antimicrobial resistance among methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains in Southwest Finland, 2007–2016: An analysis of shifting strain dynamics and emerging risk factors (2025)
- Journal of Global Antimicrobial Resistance
Silvola, Jaakko; Gröndahl-Yli-Hannuksela, Kirsi; Hirvioja, Tiina; Rantakokko-Jalava, Kaisu; Kanerva, Mari; Auranen, Kari; Marttila, Harri; Junnila, Jenna; Vuopio, Jaana
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Quantifying the direct and indirect components of COVID-19 vaccine effectiveness during the Delta variant era (2025)
- Epidemiology and Infection
Suomenrinne-Nordvik, Anna; Leino, Tuija; Shubin, Mikhail; Auranen, Kari; Vänskä, Simopekka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Development of Real-Time Surveillance for Serious Adverse Events in a Pragmatic Clinical Trial Using National Registers in Finland (2024)
- Clinical Epidemiology
Nieminen, Tuomo A.; Palmu, Arto A.; Auvinen, Raija; Kulathinal, Sangita; Auranen, Kari; Syrjänen, Ritva K.; Nieminen, Heta; Moore, Tamala Mallett; Pepin, Stephanie; Jokinen, Jukka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Hypertension in NF1: A closer look at the primacy of essential hypertension versus secondary causes (2024)
- Molecular Genetics and Genomic Medicine
Loponen Niina, Yla-Outinen Heli, Kallionpää Roope A., Valtanen Mikko, Auranen Kari, Järveläinen Hannu, Peltonen Sirkku, Peltonen Juha
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Hypothesis-driven mediation analysis for compositional data: an application to gut microbiome (2024)
- Biostatistics & Epidemiology
Kartiosuo, Noora; Nevalainen Jaakko; Raitakari, Olli; Pahkala, Katja; Auranen, Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Non-COVID-19 hospitalisation as a negative control outcome in COVID-19 vaccine effectiveness studies (2024)
- Lancet Infectious Diseases
Poukka Eero, Auranen Kari, Baum Ulrike
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Relative effectiveness of bivalent boosters against severe COVID-19 outcomes among people aged ≥ 65 years in Finland, September 2022 to August 2023 (2024)
- Eurosurveillance
Poukka, Eero; Perälä, Jori; Nohynek, Hanna; Goebeler, Sirkka; Auranen, Kari; Leino, Tuija; Baum, Ulrike
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Efficacy and effectiveness of case isolation and quarantine during a growing phase of the COVID-19 epidemic in Finland (2023)
- Scientific Reports
Auranen Kari, Shubin Mikhail, Erra Elina, Isosomppi Sanna, Kontto Jukka, Leino Tuija, Lukkarinen Timo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Presence of Streptococcus pyogenes in the throat in invasive Group A Streptococcal disease: a prospective two-year study in two health districts, Finland (2023)
- Infectious Diseases
Kailankangas Ville, Vilhonen Johanna, Gröndahl-Yli-Hannuksela Kirsi, Rantakokko-Jalava Kaisu, Seiskari Tapio, Auranen Kari, Lönnqvist Emilia, Virolainen Mirva, Hyyryläinen Hanne-Leena, Oksi Jarmo, Syrjänen Jaana, Vuopio Jaana
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Underreporting of SARS-CoV-2 infections during the first wave of the 2020 COVID-19 epidemic in Finland-Bayesian inference based on a series of serological surveys (2023)
- PLoS ONE
Nieminen Tuomo A, Auranen Kari, Kulathinal Sangita, Härkänen Tommi, Melin Merit, Palmu Arto A, Jokinen Jukka
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Approximate likelihood-based estimation method of multiple-type pathogen interactions: An application to longitudinal pneumococcal carriage data (2022)
- Statistics in Medicine
Man Irene, Bogaards Johannes A., Makwana Kishan, Trzcinski Krzysztof, Auranen Kari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Effects of physical activity intervention on 24-h movement behaviors: a compositional data analysis (2022)
- Scientific Reports
Pasanen Jesse, Leskinen Tuija, Suorsa Kristin, Pulakka Anna, Virta Joni, Auranen Kari, Stenholm Sari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Impact of Selected Meteorological Factors on COVID-19 Incidence in Southern Finland during 2020-2021 (2022)
- International Journal of Environmental Research and Public Health
Haga Lisa, Ruuhela Reija, Auranen Kari, Lakkala Kaisa, Heikkilä Anu, Gregow Hilppa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Predictors of hospitalisation and death due to SARS-CoV-2 infection in Finland: A population-based register study with implications to vaccinations (2022)
- Vaccine
Salo Heini, Lehtonen Toni, Auranen Kari, Baum Ulrike, Leino Tuija
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Whole genome sequencing reveals new links between spa t172/CC59 methicillin-resistant Staphylococcus aureus cases in low-endemicity region of Southwest Finland, 2007‒2016 (2022)
- Scientific Reports
Silvola Jaakko, Gröndahl-Yli-Hannuksela Kirsi, Hirvioja Tiina, Rantakokko-Jalava Kaisu, Rintala Esa, Auranen Kari, Junnila Jenna, Marttila Harri, Lindholm Laura, Vuopio Jaana
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
COVID-19-tutkimuskatsaus 10/2021 (2021) Sironen Tarja, Pimenoff Ville, Auranen Kari, Leino Tuija, Karvonen Sakari, Toivanen Otto, Ylöstalo Hanna, Vainikainen Mari-Pauliina, Mäkinen Saku, Arponen Anni, Heinikoski Saila, Limnéll Jarno, Salo Ahti
(D4 Julkaistu kehittämis- tai tutkimusraportti tai -selvitys )
COVID-19 tutkimuskatsaus 1/2021 (2021) Pimenoff Ville, Harrikari Timo, Toivanen Otto, Ylöstalo Hanna, Vainikainen Mari-Pauliina, Mäkinen Saku, Arponen Anni, Heinikoski Saila, Limnell Jarno, Salo Ahti
(D4 Julkaistu kehittämis- tai tutkimusraportti tai -selvitys )