PhD Saijaliisa Kangasjärvi - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Saijaliisa Kangasjärvi
PhD

- dosentti,
biologian laitos (matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta)

saijaliisa.kangasjarvi@utu.fi

+358 29 450 4204

+358 50 430 4639

Itäinen Pitkäkatu 4 C

Turku

ORCID-tunniste: https://orcid.org/orcid.org/0000-0002-7605-8546

Asiantuntijuusalueet

Kasvien stressivasteet; soluelinten biologia; valosäätely; säätelyverkostot; kasvien aineenvaihdunta

Biografia

Työskentelin yliopistonlehtorina Molekulaarisen kasvibiologian yksikössä Biokemian laitoksella 2014-2020. Syyskuussa 2020 siirryin Helsingin yliopistoon Translationaalisen kasvitieteen apulaisprofessuuriin. Opetustyöni ohessa johdin Turun yliopistossa tutkimusprojektia, joka selvittää kasvien valosopeutumisen ja taudinkestävyyden välisiä vuorovaikutuksia. Tutkimus sai alkunsa vuonna 2008 Suomen Kulttuurirahaston myöntämän tutkimusapurahan turvin ja vahvistui vuosina 2009-2014 Suomen Akatemian rahoittaman akatemiatutkijakauteni aikana. Tällä hetkellä toimin ryhmänjohtajana huippuyksikössä “Primäärituottajien molekyylibiologia, 2014-2019”. Tavoitteenani on selvittää kasvien taudinkestävyyden taustalla vaikuttavia aineenvaihdunnan muutoksia ja molekyylitason mekanismeja hankkeessa, joka on saanut Suomen Akatemian rahoituksen vuosille 2017-2021. Opetus- ja tutkimustyön ohella osallistun edelleen aktiivisesti tieteellisiin kokouksiin, kansainvälisiin arviointipaneeleihin ja ohjausryhmiin sekä tieteelliseen viestintään. Lisäksi pyrin vahvistamaan tutkimusyhteistyötä toimimalla Pohjoismaisen Kasvibiologiaseuran (SPPS) johtoryhmässä.

Tutkimus

Tutkimukseni keskittyy kasvien stressireaktioiden ymmärtämiseen.

Kaupungistuva yhteiskuntamme edellyttää uusia tapoja varmistaa tuoreiden, terveellisten ja laadukkaiden kasvipohjaisten elintarvikkeiden saatavuus. Kasveille on evolutiivisen kilpavarustelun kuluessa kehittynyt lajityypillisiä yhdisteitä, ns. sekundääriyhdisteitä, jotka voivat suojata kasveja liiallisen valon, taudinaiheuttajien tai kasvinsyöjien epäedullisilta vaikutuksilta. Nämä kasvien tuottamat luonnonyhdisteet vaikuttavat oleellisesti myös hyötykasvien makuun, terveellisyyteen ja säilyvyyteen sekä mahdollistavat erilaisia bioaktiivisia yhdisteitä tuottavien kasvilajien hyödyntämisen lääkeaineiden raaka-aineena. Tutkimukseni selvittää kasvien stressinsietokyvyn taustalla vaikuttavia molekyylitason mekanismeja ja keskittyy erityisesti kaalikasveissa kirpeältä maistuvien glukosinolaattien biosynteesin ymmärtämiseen. Lisäksi selvitämme miten hyötykasvien kemiallista koostumusta voidaan keinotekoisesti muokata kasvuvalon määrää ja spektriä muuntelemalla. Tutkimuksen tuottamaa uutta tietoa voidaan hyödyntää ravintoarvoltaan parempien viljelykasvien jalostuksessa sekä uusien korkea-arvoisten yhdisteiden tuotannossa.

Opetus

Tehtäviini kuului perus- ja jatko-opintoihin liittyviä opetus- ja ohjaustehtäviä. Perustutkintokoulutuksessa osallistuin molekulaarisen kasvibiologian alan luento-opetukseen sekä ohjaan molekyylibiologian ja proteomiikan osaamista kehittäviä käytännön laboratorioharjoituksia. Lisäksi toimin Biokemian koulutusohjelmaan valittujen uusien opiskelijoiden opettajatutorina. Tohtorikoulutuksessa osallistuin kasvibiologian alan erikoiskurssien lisäksi Turun yliopiston tutkijakoulun yleisiä työelämävalmiuksia edistävään koulutukseen. Lisäksi ohjasin suomalaisten ja kansainvälisten opiskelijoiden tutkimusharjoittelujaksoja, tutkielmia sekä väitöskirjoja.

Julkaisut

1/3

Catalase, glutathione, and protein phosphatase 2A-dependent organellar redox signalling regulate aphid fecundity under moderate and high irradiance (2020)
- Plant, Cell and Environment
Brwa Rasool, Barbara Karpinska, Jesús Pascual, Saijaliisa Kangasjärvi, Christine H. Foyer
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Evolutionary conservation and post-translational control of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase in land plants (2020)
- PLoS ONE
Alegre S, Pascual J, Trotta A, Angeleri M, Rahikainen M, Brosche M, Moffatt B, Kangasjärvi S
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
On the roots of nitrogen uptake (2020)
- New Phytologist
Moona Rahikainen, Saijaliisa Kangasjärvi
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
PROTEIN PHOSPHATASE 2A-B'γ controls Botrytis cinerea resistance and developmental leaf senescence (2020)
- Plant Physiology
Guido Durian, Verena Jeschke, Moona Rahikainen, Katariina Vuorinen, Peter J Gollan, Mikael Brosche, Jarkko Salojärvi, Erich Glawischnig, Zsófia Winter, Shengchun Li, Graham Noctor, Eva-Mari Aro, Jaakko Kangasjärvi, Kirk Overmyer, Meike Burow, Saijaliisa Kangasjärvi
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Interaction of methyl viologen-induced chloroplast and mitochondrial signalling in Arabidopsis (2019)
- Free Radical Biology and Medicine
Cui F., Brosché M., Shapiguzov A., He X., Vainonen J., Leppälä J.,Trotta A., Kangasjärvi S., Salojärvi J., Kangasjärvi J., Overmyer K.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Pic1, counteracting plant immunity signalling (2019)
- Biochemical Journal
Saijaliisa Kangasjärvi
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
70 Years of SPPS - outlook by Early-Career Principal Investigators (2018)
- Physiologia Plantarum
Kangasjärvi S
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
The impact of light intensity on metabolomic profile of Arabidopsis thaliana wild type and reticulata mutant by NMR spectroscopy (2018)
- Phytochemistry Letters
Tahereh Jafari, Moona Rahikainen, Elina Puljula, Jari Sinkkonen, Saijaliisa Kangasjärvi
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Trans-methylation reactions in plants: focus on the activated methyl cycle (2018)
- Physiologia Plantarum
Rahikainen Moona, Alegre Sara, Trotta Andrea, Pascual Jesús, Kangasjärvi Saijaliisa
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch. (2017)
- Nature Genetics
Salojärvi J, Smolander O-P, Nieminen K, Rajaraman S, Safronov O, Safdari P, Lamminmäki A, Immanen J, Lan T, Tanskanen J, Rastas P, Amiryousefi A, Jayaprakash B, Kammonen JI, Hagqvist R, Eswaran G, Ahonen VH, Serra JA, Asiegbu FO, de Dios Barajas-Lopez J, Blande D, Blokhina O, Blomster T, Broholm S, Brosché M, Cui F, Dardick C, Ehonen SE, Elomaa P, Escamez S, Fagerstedt KV, Fujii H, Gauthier A, Gollan PJ, Halimaa P, Heino PI, Himanen K, Hollender C, Kangasjärvi S, Kauppinen L, Kelleher CT, Kontunen-Soppela S, Koskinen JP, Kovalchuk A, Kärenlampi SO, Kärkönen AK, Lim K-J, Leppälä J, Macpherson L, Mikola J, Mouhu K, Mähönen AP, Niinemets Ü, Oksanen E, Overmyer K, Palva ET, Pazouki L, Pennanen V, Puhakainen T, Poczai P, Possen BJHM, Punkkinen M, Rahikainen MM, Rousi M, Ruonala R, van der Schoot C, Shapiguzov A, Sierla M, Sipilä TP, Sutela S, Teeri TH, Tervahauta AI, Vaattovaara A, Vahala J, Vetchinnikova L, Welling A, Wrzaczek M, Xu E, Paulin LG, Schulman AH, Lascoux M, Albert VA, Auvinen P, Helariutta Y, Kangasjärvi J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
NMR study of age dependent metabolic adjustments in wild type and pp2a-b’γ mutant Arabidopsis thaliana (2017)
- Phytochemistry Letters
Tahereh Jafaria, Guido Durian, Moona Rahikainen, Maaria Kortesniem, Saijaliisa Kangasjärvi, Jari Sinkkonen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Plant Light Stress (2017)
- Encyclopedia of Life Sciences
Pascual Jesus, Rahikainen Moona, Kangasjärvi Saijaliisa
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
PP2A-B'γ modulates foliar trans-methylation capacity and the formation of 4-methoxy-indol-3-yl-methyl glucosinolate in Arabidopsis leaves (2017)
- Plant Journal
Rahikainen Moona, Trotta Andrea, Alegre Garcia Sara, Pascual Jesus, Vuorinen Katariina, Overmyer Kirk, Moffatt Barbara, Ravanel Stephane, Glawischnig, Kangasjärvi Saijaliisa
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Natural Variation in Arabidopsis Cvi-0 Accession Reveals an Important Role of MPK12 in Guard Cell CO2 Signaling (2016)
- PLoS Biology
Jakobson L, Vaahtera L, Tõldsepp K, Nuhkat M, Wang C, Wang YS, Hõrak H, Valk E, Pechter P, Sindarovska Y, Tang J, Xiao C, Xu Y, Gerst Talas U, García-Sosa AT, Kangasjärvi S, Maran U, Remm M, Roelfsema MR, Hu H, Kangasjärvi J, Loog M, Schroeder JI, Kollist H, Brosché M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Photosystem II Repair and Plant Immunity: Lessons Learned from Arabidopsis Mutant Lacking the THYLAKOID LUMEN PROTEIN 18.3 (2016)
- Frontiers in Plant Science
Jarvi S, Isojarvi J, Kangasjarvi S, Salojarvi J, Mamedov F, Suorsa M, Aro EM
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
PP2A Phosphatase as a Regulator of ROS Signaling in Plants (2016)
- Antioxidants
Rahikainen Moona, Pascual Jesus, Alegre Sara, Durian Guido, Kangasjärvi Saijaliisa
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Protein Phosphatase 2A in the Regulatory Network Underlying Biotic Stress Resistance in Plants (2016)
- Frontiers in Plant Science
Guido Durian, Moona Rahikainen, Sara Alegre, Mikael Brosché, Saijaliisa Kangasjärvi
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Integration of photosynthesis, development and stress as an opportunity for plant biology. (2015)
- New Phytologist
Allahverdiyeva Y, Battchikova N, Brosché M, Fujii H, Kangasjärvi S, Mulo P, Mähönen AP, Nieminen K, Overmyer K, Salojärvi J, Wrzaczek M
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Protein phosphatase 2A (PP2A) regulatory subunit B'γ interacts with cytoplasmic ACONITASE 3 and modulates the abundance of AOX1A and AOX1D in Arabidopsis thaliana (2015)
- New Phytologist
Grzegorz Konert, Andrea Trotta, Petri Kouvonen, Moona Rahikainen, Guido Durian, Olga Blokhina, Kurt Fagerstedt, Dorota Muth, Garry L. Corthals, Saijaliisa Kangasjärvi
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Subunits B′γ and B′ζ of protein phosphatase 2A regulate photo-oxidative stress responses and growth in Arabidopsis thaliana (2015)
- Plant, Cell and Environment
Grzegorz Konert, Moona Rahikainen, Andrea Trotta, Guido Durian, Jarkko Salojärvi, Sergey Khorobrykh, Esa Tyystjärvi, Saijaliisa Kangasjärvi
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )