Vilja Siitonen
PhD (FT)
vksiit@utu.fi Tykistökatu 6 Turku Työhuone: 6108 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-1444-2622 |
Molekyylibiologia; Proteiinibiologia; Bioaktiiviset pienyhdisteet; Mikrobiologia, Biotransformaatio, HPLC, MS, NMR, GC
Photosynthetic Microbes group
Työskentelen tutkijana Photomicrobes-tutkimusryhmässä, jota johtaa professori Yagut Allahverdiyeva-Rinne (www.utu.fi/photo-microbes). Keskityn muunneltujen Chlamydomonas reinhardtii and Synechocystis sp. PCC 6803 tuottamiin yhdisteisiin tai kantojen käyttämiseen fotosynteettisinä solutehtaina. Aiemmassa postdoc-tutkimuksessani tutkin bioaktiivisia sekundaarimetaboliitteja, etenkin keskittyen niiden rakennetutkimukseen NMR:n avulla. Valmistuin tohtoriksi vuonna 2016 ja väitöskirjatutkimukseni keskittyi streptomykeettien sekundaarimetaboliaan, etenkin antrasykliiniantibiootti nogalamysiinin biosynteesiin. Maisteriksi valmistuin 2010, Pro gradu -tutkielmani keskittyi streptomykeettien rasva-aineenvaihduntaan. Ennen valmistumistani vietin vaihtovuoden 2005-2006 Itävallassa, Salzburgissa.
Tutkin viherleviä ja syanobakteereja. Niiden tuottamia yhdisteitä ja niiden tekemiä biotransformaatioita. Aiemmin olen tutkinut streptomykeettien tuottamia yhdisteitä.
Olen opettanut vedyntuotantoa ja sen mittausta sekä biotransformaatiota käyttäen mikroleviä osana fotosynteesikurssia (2022).
Olen opettanut biotransformaatio-kurssin osana fotosynteesilaboratoriokurssia (2022).
Olen pitänyt HPLC-kurssin pigmenttien tutkimiseen osana osana fotosynteesilaboratoriokurssia (2021).
Olen opettanut molekyylibiologian kurssin koskien streptomykeettien geneettistä muokkausta ja yhdisteiden erottamista (2011).
Lisäksi ohjaan yhtä maisterintutkielmaa ja olen ohjannut 2 maisterivaiheen erikoistyötä ja gradun, 3 luonnontieteen kandidaatin tutkielmaa ja olen suunnitellut ja ohjannut 12 projektityöntekijän laboratoriatyötä (1-6 kuukautta).
- Divergent non-heme iron enzymes in the nogalamycin biosynthetic pathway (2016)
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glycosylation and Glycodiversification in Polyketide Antibiotics: Unraveling Biosynthetic Steps in Nogalamycin Formation (2016) Siitonen Vilja
(G5 Artikkeliväitöskirja) - Laboratory course on Streptomyces genetics and secondary metabolism (2016)
- Biochemistry and Molecular Biology Education
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Crystal structure of the glycosyltransferase SnogD from the biosynthetic pathway of nogalamycin in Streptomyces nogalater (2012)
- FEBS Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Discovery of a Two-Component Monooxygenase SnoaW/SnoaL2 Involved in Nogalamycin Biosynthesis (2012)
- Chemistry and Biology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Identification of Late-Stage Glycosylation Steps in the Biosynthetic Pathway of the Anthracycline Nogalamycin (2012)
- ChemBioChem
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )