Jarmo Niemi
Ph.D.
jarnie@utu.fi +358 29 450 4701 +358 50 470 4758 Tykistökatu 6 Turku Työhuone: B6130 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-7447-8379 |
Antibioottien biosynteesi; Streptomyces'in biologia; proteiinitutkimus
Olen syntynyt Porissa 1958, valmistunut FK:ksi Turun yliopistosta 1983 ja suorittanut FT-tutkinnon 1998. Biokemian y.p. lehtoriksi minut nimitettiin 2005.
Olen naimisissa, ja minulla on 2 lasta.
Olen työskennellyt antibioottien biosynteesin parissa ensin lääketehdas Leiraksessa ja sittemmin Turun yliopistossa.
Väittelin 1995 aiheesta "Hybrid
Anthracycline Antibiotics: Analysis and
Application
of Rhodomycin Biosynthetic Genes from Streptomyces purpurascens"
Tutkimustyöni
on käsitellyt antibioottien biosynteesin molekyylibiologiaa,
entsyymitutkimusta ja entsyymien rakennebiologiaa. Osallistun nykyään
tutkimusryhmän "Antibiotic biosynthesis engineering".(http://abelab.utu.fi/) tutkimuksiin.
Opetan useita biokemian peruskursseja Turun yliopistossa: BKEM5030 Solu ja biomolekyylit-teoria ,
BKEM5010 Mikrobiologia-teoria, BKEM5011 Mikrobiologia-käytäntö ja osittain BKEM5160 Solu ja energia-teoria ja BKEM5161 Solu ja energia-käytäntö.
Lisäksi opetan kurssia BJ01A1060 Biokemian perusteet Lappeenrannan teknillisessä yliopistossa.
- Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of aclacinomycin-10-methyl esterase and aclacinomycin-10-hydroxylase from Streptomyces purpurascens (2003)
- Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Crystal structure of aclacinomycin-10-hydroxylase, a S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase homolog involved in anthracycline biosynthesis in Streptomyces purpurascens (2003) Jansson A, Niemi J, Lindqvist Y, Mantsala P, Schneider G
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Crystal structure of aclacinomycin methylesterase with bound product analogues - Implications for anthracycline recognition and mechanism (2003)
- Journal of Biological Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Anthracycline biosynthesis: Steps, enzymes and genes (2002) Microbial Secondary Metabolites: Biosynthesis, Genetics and Regulation Niemi Jarmo, Kantola Jaana, Ylihonko Kristiina, Mäntsälä Pekka
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Modification of aklavinone and aclacinomycins in vitro and in vivo by rhodomycin biosynthesis gene products (2002)
- FEMS Microbiology Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Modifications of aclacinomycin T by aclacinomycin methyl esterase (RdmC) and aclacinomycin-10-hydroxylase (RdmB) from Streptomyces purpurascens (2000)
- Biochimica et Biophysica Acta: Protein Structure and Molecular Enzymology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Characterization of aklavinone-11-hydroxylase from Streptomyces purpurascens (1999)
- Biochimica et Biophysica Acta: Protein Structure and Molecular Enzymology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Hybrid anthracyclines by a genetically engineered Streptomyces galilaeus mutant (1997)
- Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - NUCLEOTIDE-SEQUENCES AND EXPRESSION OF GENES FROM STREPTOMYCES-PURPURASCENS THAT CAUSE THE PRODUCTION OF NEW ANTHRACYCLINES IN STREPTOMYCES-GALILAEUS (1995)
- Journal of Bacteriology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - HYBRID ANTHRACYCLINE ANTIBIOTICS - PRODUCTION OF NEW ANTHRACYCLINES BY CLONED GENES FROM STREPTOMYCES-PURPURASCENS IN STREPTOMYCES-GALILAEUS (1994)
- Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF ACLACINOMYCIN-A-NON-PRODUCING STREPTOMYCES-GALILAEUS (ATCC-31615) MUTANTS (1994)
- Microbiology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - TRACTOR, a program to locate subclones in a nucleotide sequence using only one sequencing reaction (1994)
- Computer Applications in the Biosciences
Mäntsälä P
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - ABAA, A NEW PLEIOTROPIC REGULATORY LOCUS FOR ANTIBIOTIC PRODUCTION IN STREPTOMYCES-COELICOLOR (1992)
- Journal of Bacteriology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - CLONING AND EXPRESSION IN A HETEROLOGOUS HOST OF THE COMPLETE SET OF GENES FOR BIOSYNTHESIS OF THE STREPTOMYCES-COELICOLOR ANTIBIOTIC UNDECYLPRODIGIOSIN (1990)
- Gene
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - EXPRESSION OF HETEROLOGOUS GENE AND SECRETION OF ITS PRODUCT IN ESCHERICHIA-COLI (1987)
- Protein Engineering
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - A NEW APPROACH TO HIGH-SENSITIVITY DIFFERENTIAL HYBRIDIZATION (1986)
- Gene
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )



