Dosentti (Adjunct professor) Juha Mykkänen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Juha Mykkänen
Dosentti (Adjunct professor)

- erikoistutkija,
sydäntutkimuskeskus (väestötutkimuskeskus)
- dosentti,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

juha.mykkanen@utu.fi

+358 29 450 4364

+358 50 406 3612

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Työhuone: B503

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9898-2660

Selected 20 Publications.pdf

The Cardiovascular Risk in Young Finns Study (YFS)

Asiantuntijuusalueet

sydän- ja verisuonitautien riskitekijät; obesiteetti; metaboliset taudit; molekyyligenetiikka; genomiikka; metabolomiikka; transkriptomiikka; lipidomiikka; data-analyysi; statistiikka; tyypin 1 diabetes; lysinuurinen proteiini-intoleranssi; tutkimusprojektisuunnittelu

Biografia

KOULUTUS JA OPPIARVO

2015 Dosentti (Molekyyligenetiikka), Turun yliopisto
2003 FT, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1998 FM, Perinnöllisyystiede, Turun yliopisto

TÄMÄNHETKINEN ASEMA

Erikoistutkija, Sydäntutkimuskeskus, Lääketieteellinen tiedekunta, Turun yliopisto

AIKAISEMPI TYÖKOKEMUS

2009 – 2015 Erikoistutkija, Type 1 Diabetes Prediction and Prevention (DIPP) -tutkimus, Lasten ja nuorten klinikka, Turun yliopistollinen keskussairaala (Tyks)
2005 – 2008 Suomen Akatemian Tutkijatohtori, Turun Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
2003 – 2008 Post-doc -tutkija, Turku Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
1998 – 2003 Tohtoriopiskelija, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
2000 – 2002 Tuntiopettaja (osa-aikainen), Biologian laitos, Turun yliopisto
1998 – 1999 Assistentti (8 kk), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1995 – 1997 Tutkimusavustaja (osa-aikainen), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto

Tutkimus

Olen koko tutkimusurani ajan tehnyt ihmisen terveyteen liittyvää tutkimusta. Tämä alkoi jo perusopintojeni aikana pro-gradu –vaiheessa työskennellessäni Turun yliopiston Lääketieteellisen genetiikan osastolla dos. Jaana Lähdetien tutkimusryhmässä aiheenani sädehoitoa saaneiden kivessyöpäpotilaiden siittiöiden aneuploidia. Tämän jälkeen olen perehtynyt lastentautien molekyyligenetiikkaan. Väitöskirjatyössäni tutkin perinnöllisen LPI-taudin molekyyligenetiikkaa emeritusprofessori Pertti Aulan ohjauksessa. Tänä aikana perehdyin lääketieteellisen genetiikan tutkimusalaan, erilaisiin ihmisgenomiikan menetelmiin ja nk. suomalaiseen tautiperintöön.

Tutkimusurani post-doc –vaiheessa siirryin Turun Biotekniikan Keskukseen tutkimaan tyypin 1 diabetesta osana suomalaista Tyypin 1 diabeteksen ennustaminen ja ehkäisy (DIPP) –tutkimusta, mentoreinani ja esimiehinäni emeritusprofessori Olli Simell ja professori Riitta Lahesmaa. Tänä aikana perehdyin tyypin 1 diabetekseen, molekyyli-immunologiaan ja erilaisiin genominlaajuisiin biolääketieteen tutkimusmenetelmiin, kuten cDNA- ja DNA-mikrosirut. Post-doc –kaudella toimin 2005-2008 Suomen Akatemian tutkijatohtorina, aiheena Tyypin 1 diabeteksen molekylaariset markkerit, missä DIPP-tutkimuslasten näytteitä tutkittiin eri mikrosirumenetelmin (Affymetrix ja Illumina) tarkoituksena löytää geenejä tai geeniverkkoja, joiden toiminta muuttuu varhaisessa vaiheessa tyypin 1 diabeteksen taudinkehityksen aikana.

Tutkimusurani kolmas vaihe alkoi vuoden 2009 alusta siirtyessäni tutkijaksi DIPP-tutkimusklinikalle (Lasten ja nuorten klinikka, Tyks) emeritusprofessori Olli Simellin alaisuuteen. Tutkimukseni tavoitteena oli löytää Tyypin 1 diabeteksen autoimmuniteetin puhkeamiseen vaikuttavia tekijöitä.

Tutkimusurani neljäs vaihe alkoi maaliskuussa 2015 siirryttyäni erikoistutkijaksi Sydäntutkimuskeskukseen Akatemiaprofessori Olli Raitakarin koordinoimaan LASERI-tutkimukseen, missä tutkitaan sydän- ja verisuonitautien riskitekijöitä lapsuudesta aikuisuuteen. Kuten edellä kuvatuissa tutkimuksissa, myös LASERI hyödyntää ansiokkaasti erilaisia omiikkatyökaluja bionäytteiden tutkimiseen. Tutkimukseni päätavoitteena on lisätä ymmärrystämme kardiovaskulaaristen ja metabolisten tautien patofysiologiasta ja em. sairauksien riskitekijöiden monitahoisista yhteyksistä ihmisen genomiin, transkriptomiin ja metaboliaan.

Opetus

Opetustehtäviini kuuluu nuorten (bio)lääketieteen opiskelijoiden ohjaus joko syventävissä tai väitöskirjaan tähtäävissä jatko-opinnoissa.

Julkaisut

3/4

The role of innate immunity in Type 1 Diabetes (T1D) (2016)
- Scandinavian Journal of Immunology
Vaha-Makila M, Hellman V, Mykkanen J, Paavanen-Huhtala S, Ronnemaa T, Simell O, Knip M, Ilonen J, Veijola R, Toppari J
(O2 Muu julkaisu )
A method for reporting and classifying acute infectious diseases in a prospective study of young children: TEDDY (2015)
- BMC Pediatrics
Lonnrot M, Lynch K, Larsson HE, Lernmark A, Rewers M, Hagopian W, She JX, Simell O, Ziegler AG, Akolkar B, Krischer J, Hyoty H; and The TEDDY study group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Clinical features of celiac disease: a prospective birth cohort. (2015)
- Pediatrics
Agardh D, Lee HS, Kurppa K, Simell V, Aronsson CA, Jörneus O, Hummel M, Liu E, Koletzko S; for the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Dysfunction in macrophage toll-like receptor signaling caused by an inborn error of cationic amino acid transport (2015)
- Molecular Immunology
Kurko J, Vähä-Mäkilä M, Tringham M, Tanner L, Paavanen-Huhtala S, Saarinen M, Näntö-Salonen K, Simell O, Niinikoski H, Mykkänen J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Early Childhood Gut Microbiomes Show Strong Geographic Differences Among Subjects at High Risk for Type 1 Diabetes (2015)
- Diabetes Care
Kemppainen KM, Ardissone AN, Davis-Richardson AG, Fagen JR, Gano KA, Leon-Novelo LG, Vehik K, Casella G, Simell O, Ziegler AG, Rewers MJ, Lernmark A, Hagopian W, She JX, Krischer JP, Akolkar B, Schatz DA, Atkinson MA, Triplett EW; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Predictors of Progression From the Appearance of Islet Autoantibodies to Early Childhood Diabetes: The Environmental Determinants of Diabetes in the Young (TEDDY) (2015)
- Diabetes Care
Steck AK, Vehik K, Bonifacio E, Lernmark A, Ziegler AG, Hagopian WA, She JX, Simell O, Akolkar B, Krischer J, Schatz D, Rewers MJ; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Role of Type 1 diabetes associated SNPs on risk of autoantibody positivity in the TEDDY Study (2015)
- Diabetes
Törn C, Hadley D, Lee HS, Hagopian W, Lernmark A, Simell O, Rewers M, Ziegler A, Schatz D, Akolkar B, Onengut-Gumuscu S, Chen WM, Toppari J, Mykkänen J, Ilonen J, Rich SS, She JX, Steck AK, Krischer J; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Serum Proteomes Distinguish Children Developing Type 1 Diabetes in a Cohort With HLA-Conferred Susceptibility (2015)
- Diabetes
Moulder R, Bhosale SD, Erkkila T, Laajala E, Salmi J, Nguyen EV, Kallionpaa H, Mykkanen J, Vaha-Makila M, Hyoty H, Veijola R, Ilonen J, Simell T, Toppari J, Knip M, Goodlett DR, Lahdesmaki H, Simell O, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The 6 year incidence of diabetes-associated autoantibodies in genetically at-risk children: the TEDDY study (2015)
- Diabetologia
Krischer JP, Lynch KF, Schatz DA, Ilonen J, Lernmark A, Hagopian WA, Rewers MJ, She JX, Simell OG, Toppari J, Ziegler AG, Akolkar B, Bonifacio E; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
An Increase in Serum 25-Hydroxyvitamin D Concentrations Preceded a Plateau in Type 1 Diabetes Incidence in Finnish Children. (2014)
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism
Marjaana Mäkinen, Ville Simell, Juha Mykkänen, Jorma Ilonen, Riitta Veijola, Heikki Hyöty, Mikael Knip, Olli Simell, Jorma Toppari, and Robert Hermann
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Bacteroides dorei dominates gut microbiome prior to autoimmunity in Finnish children at high risk for type 1 diabetes (2014)
- Frontiers in Microbiology
Austin G.Davis-Richardson, Alexandria N.Ardissone, Raquel Dias, Ville Simell, Michael T. Leonard, Kaisa M. Kemppainen, Jennifer C. Drew, Desmond Schatz, Mark A. Atkinson, Bryan Kolaczkowski, Jorma Ilonen, Mikael Knip, Jorma Toppari, Noora Nurminen, Heikki Hyöty, Riitta Veijola, Tuula Simell, Juha Mykkänen, Olli Simell, Eric W. Triplett
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Biomarker discovery study design for type 1 diabetes in The Environmental Determinants of Diabetes in the Young (TEDDY) study. (2014)
- Diabetes/Metabolism Research and Reviews
Lee HS, Burkhardt BR, McLeod W, Smith S, Eberhard C, Lynch K, Hadley D, Rewers M, Simell O, She JX, Hagopian B, Lernmark A, Akolkar B, Ziegler AG, Krischer JP; TEDDY study group.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Children followed in the TEDDY study are diagnosed with type 1 diabetes at an early stage of disease. (2014)
- Pediatric Diabetes
Elding Larsson H, Vehik K, Gesualdo P, Akolkar B, Hagopian W, Krischer J, Lernmark Å, Rewers M, Simell O, She JX, Ziegler A, Haller MJ; and the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Factors Associated With Maternal-Reported Actions to Prevent Type 1 Diabetes in the First Year of the TEDDY Study (2014)
- Diabetes Care
Smith LB, Lynch KF, Baxter J, Lernmark B, Roth R, Simell T, Johnson SB; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Innate immune activity is detected prior to seroconversion in children with HLA-conferred type 1 diabetes susceptibility. (2014)
- Diabetes
Kallionpää Henna, Elo Laura, Laajala Essi, Mykkänen Juha, Ricaño-Ponce Isis, Vaarma Matti, Laajala Teemu Daniel, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Veijola Riitta, Simell Tuula, Wijmenga Cisca, Knip Mikael, Lähdesmäki Harri, Simell Olli, Lahesmaa Riitta
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Prevalence of obesity was related to HLA-DQ in 2-4-year-old children at genetic risk for type 1 diabetes (2014)
- International Journal of Obesity
Yang J, Lernmark A, Uusitalo UM, Lynch KF, Veijola R, Winkler C, Larsson HE, Rewers M, She JX, Ziegler AG, Simell OG, Hagopian WA, Akolkar B, Krischer JP, Vehik K; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Risk of pediatric celiac disease according to HLA haplotype and country. (2014)
- New England Journal of Medicine
Liu E, Lee HS, Aronsson CA, Hagopian WA, Koletzko S, Rewers MJ, Eisenbarth GS, Bingley PJ, Bonifacio E, Simell V, Agardh D; TEDDY Study Group.
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Cord Serum Lipidome in Prediction of Islet Autoimmunity and Type 1 Diabetes (2013)
- Diabetes
Oresic M, Gopalacharyulu P, Mykkänen J, Lietzen N, Mäkinen M, Nygren H, Simell S, Simell V, Hyöty H, Veijola R, Ilonen J, Sysi-Aho M, Knip M, Hyötyläinen T, Simell O
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Genome-wide comparison of two RNA-stabilizing reagents for transcriptional profiling of peripheral blood (2013)
- Translational Research
Nikula T, Mykkanen J, Simell O, Lahesmaa R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Insulin resistance, beta cell function and the effect of non-HLA genetic variants in Finnish DIPP study children with HLA-conferred risk for type 1 diabetes (2013)
- Diabetologia
Koskinen MK, Hermann R, Matomaki J, Mykkanen J, Vaha-Makila M, Simell T, Simell S, Makinen M, Simell V, Saarinen M, Ilonen J, Knip M, Simell O
(O2 Muu julkaisu )