Dosentti (Adjunct professor) Juha Mykkänen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Juha Mykkänen
Dosentti (Adjunct professor)

- erikoistutkija,
sydäntutkimuskeskus (väestötutkimuskeskus)
- dosentti,
biolääketieteen laitos (lääketieteellinen tiedekunta)

juha.mykkanen@utu.fi

+358 29 450 4364

+358 50 406 3612

Kiinamyllynkatu 10

Turku

Työhuone: B503

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9898-2660

Selected 20 Publications.pdf

The Cardiovascular Risk in Young Finns Study (YFS)

Asiantuntijuusalueet

sydän- ja verisuonitautien riskitekijät; obesiteetti; metaboliset taudit; molekyyligenetiikka; genomiikka; metabolomiikka; transkriptomiikka; lipidomiikka; data-analyysi; statistiikka; tyypin 1 diabetes; lysinuurinen proteiini-intoleranssi; tutkimusprojektisuunnittelu

Biografia

KOULUTUS JA OPPIARVO

2015 Dosentti (Molekyyligenetiikka), Turun yliopisto
2003 FT, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1998 FM, Perinnöllisyystiede, Turun yliopisto

TÄMÄNHETKINEN ASEMA

Erikoistutkija, Sydäntutkimuskeskus, Lääketieteellinen tiedekunta, Turun yliopisto

AIKAISEMPI TYÖKOKEMUS

2009 – 2015 Erikoistutkija, Type 1 Diabetes Prediction and Prevention (DIPP) -tutkimus, Lasten ja nuorten klinikka, Turun yliopistollinen keskussairaala (Tyks)
2005 – 2008 Suomen Akatemian Tutkijatohtori, Turun Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
2003 – 2008 Post-doc -tutkija, Turku Biotekniikan Keskus, Turun yliopisto
1998 – 2003 Tohtoriopiskelija, Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
2000 – 2002 Tuntiopettaja (osa-aikainen), Biologian laitos, Turun yliopisto
1998 – 1999 Assistentti (8 kk), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto
1995 – 1997 Tutkimusavustaja (osa-aikainen), Lääketieteellinen genetiikka, Turun yliopisto

Tutkimus

Olen koko tutkimusurani ajan tehnyt ihmisen terveyteen liittyvää tutkimusta. Tämä alkoi jo perusopintojeni aikana pro-gradu –vaiheessa työskennellessäni Turun yliopiston Lääketieteellisen genetiikan osastolla dos. Jaana Lähdetien tutkimusryhmässä aiheenani sädehoitoa saaneiden kivessyöpäpotilaiden siittiöiden aneuploidia. Tämän jälkeen olen perehtynyt lastentautien molekyyligenetiikkaan. Väitöskirjatyössäni tutkin perinnöllisen LPI-taudin molekyyligenetiikkaa emeritusprofessori Pertti Aulan ohjauksessa. Tänä aikana perehdyin lääketieteellisen genetiikan tutkimusalaan, erilaisiin ihmisgenomiikan menetelmiin ja nk. suomalaiseen tautiperintöön.

Tutkimusurani post-doc –vaiheessa siirryin Turun Biotekniikan Keskukseen tutkimaan tyypin 1 diabetesta osana suomalaista Tyypin 1 diabeteksen ennustaminen ja ehkäisy (DIPP) –tutkimusta, mentoreinani ja esimiehinäni emeritusprofessori Olli Simell ja professori Riitta Lahesmaa. Tänä aikana perehdyin tyypin 1 diabetekseen, molekyyli-immunologiaan ja erilaisiin genominlaajuisiin biolääketieteen tutkimusmenetelmiin, kuten cDNA- ja DNA-mikrosirut. Post-doc –kaudella toimin 2005-2008 Suomen Akatemian tutkijatohtorina, aiheena Tyypin 1 diabeteksen molekylaariset markkerit, missä DIPP-tutkimuslasten näytteitä tutkittiin eri mikrosirumenetelmin (Affymetrix ja Illumina) tarkoituksena löytää geenejä tai geeniverkkoja, joiden toiminta muuttuu varhaisessa vaiheessa tyypin 1 diabeteksen taudinkehityksen aikana.

Tutkimusurani kolmas vaihe alkoi vuoden 2009 alusta siirtyessäni tutkijaksi DIPP-tutkimusklinikalle (Lasten ja nuorten klinikka, Tyks) emeritusprofessori Olli Simellin alaisuuteen. Tutkimukseni tavoitteena oli löytää Tyypin 1 diabeteksen autoimmuniteetin puhkeamiseen vaikuttavia tekijöitä.

Tutkimusurani neljäs vaihe alkoi maaliskuussa 2015 siirryttyäni erikoistutkijaksi Sydäntutkimuskeskukseen Akatemiaprofessori Olli Raitakarin koordinoimaan LASERI-tutkimukseen, missä tutkitaan sydän- ja verisuonitautien riskitekijöitä lapsuudesta aikuisuuteen. Kuten edellä kuvatuissa tutkimuksissa, myös LASERI hyödyntää ansiokkaasti erilaisia omiikkatyökaluja bionäytteiden tutkimiseen. Tutkimukseni päätavoitteena on lisätä ymmärrystämme kardiovaskulaaristen ja metabolisten tautien patofysiologiasta ja em. sairauksien riskitekijöiden monitahoisista yhteyksistä ihmisen genomiin, transkriptomiin ja metaboliaan.

Opetus

Opetustehtäviini kuuluu nuorten (bio)lääketieteen opiskelijoiden ohjaus joko syventävissä tai väitöskirjaan tähtäävissä jatko-opinnoissa.

Julkaisut

2/4

The association between stressful life events and respiratory infections during the first 4 years of life: The Environmental Determinants of Diabetes in the Young study (2019)
- Stress and Health
Roth R, Lynch K, Hyöty H, Lönnrot M, Driscoll KA, Johnson SB; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Early Infant Diet and Islet Autoimmunity in the TEDDY Study (2018)
- Diabetes Care
Ulla Uusitalo, Hye-Seung Lee, Carin Andrén Aronsson, Kendra Vehik, Jimin Yang, Sandra Hummel, Katherine Silvis, Åke Lernmark, Marian Rewers, William Hagopian, Jin-Xiong She, Olli Simell, Jorma Toppari, Anette-G. Ziegler, Beena Akolkar, Jeffrey Krischer, Suvi M. Virtanen, Jill M. Norris; and the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Enterovirus-associated changes in blood transcriptomic profiles of children with genetic susceptibility to type 1 diabetes (2018)
- Diabetologia
Niina Lietzen, Le T. T. An, Maria K. Jaakkola, Henna Kallionpää, Sami Oikarinen, Juha Mykkänen, Mikael Knip, Riitta Veijola, Jorma Ilonen, Jorma Toppari, Heikki Hyöty, Riitta Lahesmaa, Laura L. Elo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Plasma 25-Hydroxyvitamin D Concentration and Risk of Islet Autoimmunity (2018)
- Diabetes
Norris JM, Lee HS, Frederiksen B, Erlund I, Uusitalo U, Yang JM, Lernmark A, Simell O, Toppari J, Rewers M, Ziegler AG, She JX, Onengut-Gumuscu S, Chen WM, Rich SS, Sundvall J, Akolkar B, Krischer J, Virtanen SM, Hagopian W; for the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Serum 25-hydroxyvitamin D concentration at birth in children screened for HLA-DQB1 conferred genetic risk for type 1 diabetes (2018)
- Diabetologia
Mäkinen Marjaana, Löyttyniemi Eliisa, Koskinen Maarit, Vähä-Mäkilä Mari, Siljander Heli, Nurmio Mirja, Mykkänen Juha, Virtanen Suvi M, Simell Olli, Hyöty Heikki, Ilonen Jorma, Knip Mikael, Veijola Riitta, Toppari Jorma
(O2 Muu julkaisu )
Genetic and Environmental Interactions Modify the Risk of Diabetes-Related Autoimmunity by 6 Years of Age: The TEDDY Study (2017)
- Diabetes Care
Krischer JP, Lynch KF, Lernmark A, Hagopian WA, Rewers MJ, She JX, Toppari J, Ziegler AG, Akolkar B; and the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Inhaled Sargramostim Induces Resolution of Pulmonary Alveolar Proteinosis in Lysinuric Protein Intolerance (2017)
- JIMD Reports
Laura M. Tanner, Johanna Kurko, Maaria Tringham, Heikki Aho, Juha Mykkänen, Kirsti Näntö-Salonen, Harri Niinikoski, Heikki Lukkarinen
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Joint modeling of longitudinal autoantibody patterns and progression to type 1 diabetes: results from the TEDDY study (2017)
- Acta Diabetologica
Kohler M, Beyerlein A, Vehik K, Greven S, Umlauf N, Lernmark A, Hagopian WA, Rewers M, She JX, Toppari J, Akolkar B, Krischer JP, Bonifacio E, Ziegler AG; The TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Residual beta-cell function in diabetes children followed and diagnosed in the TEDDY study compared to community controls (2017)
- Pediatric Diabetes
Steck AK, Larsson HE, Liu X, Veijola R, Toppari J, Hagopian WA, Haller MJ, Ahmed S, Akolkar B, Lernmark A, Rewers MJ, Krischer JP; and the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Respiratory infections are temporally associated with initiation of type 1 diabetes autoimmunity: the TEDDY study (2017)
- Diabetologia
Lonnrot M, Lynch KF, Larsson HE, Lernmark A, Rewers MJ, Torn C, Burkhardt BR, Briese T, Hagopian WA, She JX, Simell OG, Toppari J, Ziegler AG, Akolkar B, Krischer JP, Hyoty H; on behalf of the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
The feasibility of salivary sample collection in an international pediatric cohort: The the TEDDY study (2017)
- Developmental Psychobiology
Roth R, Baxter J, Vehik K, Hopkins D, Killian M, Gesualdo P, Melin J, Simell B, Strauss E, Lernmark A, Johnson SB; The TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Association of human bocavirus 1 infection with respiratory disease in childhood follow-up study (2016)
- Emerging Infectious Diseases
Meriluoto M, Hedman L, Tanner L, Simell V, Makinen M, Simell S, Mykkanen J, Korpelainen J, Ruuskanen O, Ilonen J, Knip M, Simell O, Hedman K, Soderlund-Venermo M
(O2 Muu julkaisu )
Complement gene variants in relation to autoantibodies to beta cell specific antigens and type 1 diabetes in the TEDDY Study (2016)
- Scientific Reports
Torn C, Liu X, Hagopian W, Lernmark A, Simell O, Rewers M, Ziegler AG, Schatz D, Akolkar B, Onengut-Gumuscu S, Chen WM, Toppari J, Mykkanen J, Ilonen J, Rich SS, She JX, Sharma A, Steck A, Krischer J & The TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Effects of Gluten Intake on Risk of Celiac Disease: A Case-Control Study on a Swedish Birth Cohort (2016)
- Clinical Gastroenterology and Hepatology
Andrén Aronsson C, Lee HS, Koletzko S, Uusitalo U, Yang J, Virtanen SM, Liu E, Lernmark å, Norris JM, Agardh D; the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Growth and Risk for Islet Autoimmunity and Progression to Type 1 Diabetes in Early Childhood: The Environmental Determinants of Diabetes in the Young Study (2016)
- Diabetes
Helena Elding Larsson, Kendra Vehik, Michael J. Haller, Xiang Liu, Beena Akolkar, William Hagopian, Jeffrey Krischer, åke Lernmark, Jin-Xiong She, Olli Simell, Jorma Toppari, Anette-G. Ziegler, Marian Rewers; for the TEDDY Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Identification of Non-HLA Genes Associated with Celiac Disease and Country-Specific Differences in a Large, International Pediatric Cohort (2016)
- PLoS ONE
Sharma A, Liu X, Hadley D, Hagopian W, Liu E, Chen WM, Onengut-Gumuscu S, Simell V, Rewers M, Ziegler AG, Lernmarklo A, Simell O, Toppari J, Krischer JP, Akolkar B, Rich SS, Agardh D, She JX; Teddy Study group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Imbalance of plasma amino acids, metabolites and lipids in patients with lysinuric protein intolerance (LPI) (2016)
- Metabolism
Kurko J, Tringham M, Tanner L, Nanto-Salonen K, Vaha-Makila M, Nygren H, Poho P, Lietzen N, Mattila I, Olkku A, Hyotylainen T, Oresic M, Simell O, Niinikoski H, Mykkanen J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Participant Experiences in the Environmental Determinants of Diabetes in the Young Study: Common Reasons for Withdrawing (2016)
- Journal of Diabetes Research
Lernmark B, Lynch K, Baxter J, Roth R, Simell T, Smith L, Swartling U, Johnson SB; and Teddy Study Group
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Reduced β-cell function in early preclinical type 1 diabetes (2016)
- European Journal of Endocrinology
Koskinen MK, Helminen O, Matomäki J, Aspholm S, Mykkänen J, Mäkinen M, Simell V, Vähä-Mäkilä M, Simell T, Ilonen J, Knip M, Veijola R, Toppari J, Simell OG
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Serum 25-Hydroxyvitamin D Concentrations in Children Progressing to Autoimmunity and Clinical Type 1 Diabetes (2016)
- Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism
Mäkinen M, Mykkänen J, Koskinen M, Simell V, Veijola R, Hyöty H, Ilonen J, Knip M, Simell O, Toppari J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )