Irma Saloniemi
Ph.D., Docent
irma.saloniemi@utu.fi +358 29 450 4276 +358 46 923 0948 Vesilinnantie 5 Turku Työhuone: 337 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-9083-4313 |
evoluutiobiologia; kvantitatiivinen genetiikka; luonnonvalinta; tilastotieteen biologiset sovellukset, muuntogeeniset organismit, glyfosaatti, kestävä maatalous, metsänhoito ja kalastus; bioturva;
Aloitin opiskeluni Helsingissä kovista luonnontieteistä, mutta pian huomasin että sisäinen maailmanparantajani kaipasi myös mahdollisuutta oppien soveltamiseen. Onneksi löysin biologian, ja päädyin Chicagon ja Oregonin yliopistoihin, joissa biologiaa ei liiaksi lokeroitu osa-alueisiinsa.
Olen toiminut opettajana ja tutkijana Turun yliopiston biologian laitoksella lähes koko työurani; toimin ensin ekologian osastolla, josta siirryin myöhemmin genetiikalle. Olen opettanut biologiaa ekologiasta genetiikkaan ja bioinformatiikasta agroekologiaan. Onneksi jossain välissä on ollut mahdollisuus tehdä myös tutkimusta, jossa omimmaksi alueeksi koen niiden evolutiivisten systeemien tutkimisen, joissa ihmistoimintaan vaikuttamalla pyritään vähentämään ongelmia. Esimerkkejä ovat vaikkapa kestävä maatalous, biotekniikan riskeihin varautuminen ja viimeisimpänä ilmastonmuutokseen varautuminen.
Erilaisten biologisten
ilmiöiden tilastolliset analyysit ovat olleet keskeisiä tutkimuksissani
varhaisista epidemiologisista alkane. Olen
tutkinut koivun ja sitä hyödyntävien organismien suhteita Kevolla ja
akatemioprojektissani (50452) “Trophic-level and life-history consequences of
transgenic resistance in plants”.
Yhteistyössä Luken kanssa
(PI Irma Kallio-Nyberg), olen selvittänyt nousevien lämpötilojen, kalastuksen
ja kalanviljelyn vaikutuksia lohikaloihin (lohi, taimen, sika) Itämeren
alueella.
Pitkäaikainen yhteistyöni Kari Saikkosen ja Marjo Helanderin kanssa natojen ja
niiden mikrobi-interaktioiden tutkimisessa on innostanut perehtymään laajemminkin
maatalouden evolutiivisiin sovelluksiin.
Tällä hetkellä työskentelen
pääosin kahdessa projektissa. Tutkin glyfosaatin vaikutuksia ei-kohde-eliöihin osana
Marjo Helanderin johtamaa akatemiaprojektia. Huolellisesti suunnitellut ja
toteutetut koejärjestelyt useilla organismeilla vastaavat ajankohtaisiin
kysymyksiin ja auttavat faktojen tuomisessa usein löysänä vellovaan
glyfosaattikeskusteluun.
Tärkein työni on Kevon
metsänrajapuutarhan (MRP) pitkäaikaisaineistojen dokumentointi ja analysointi. MRP-kokeet
ovat viiteen eri paikkaan Utsjoella, Inarissa, Kittilässä ja Ruissalossa
suunniteltuja koejärjestelyjä vapaapölytteisten pohjoisten koivuyksilöiden jälkeläisten
kasvattamiseksi samoilla paikoilla (common garden). Uusien mittausten yhdistäminen
vuosikymmeniä vanhoihin elinkiertomittauksiin, molekyylimenetelmät ja
kvantitatiivisen genetiikan analyysit tuottavat uusia ennusteita ja tietoa ilmastonmuutoksen
vaikutuksista, ympäristöön sopeutumisen mekanismeista ja koivun evoluutiosta.
Opetukseeni on viime
vuosina kuulunut BIOL1301 Genetiikan perusteet, BIOL2121 Evoluutiobiologia ja BIOL3050
Bioinformatiikkaa biologeille. Olen opettanut tilastotieteen kursseja
perusteista syventäviin opintoihin sekä biologialla että myös vuoden ajan
statistikkona tilastotieteen laitoksella. Olen soveltanut erityyppisiä lineaarisia
malleja evolutiivisiin ja kvantitatiivisen genetiikan tilanteisiin käyttäen
SAS- tai R-ympäristöjä.
Toimiessani ekologialla,
opetin Evolutiivisten interaktioiden ja Evolutiivisen ekologian kursseja.
Genetiikalla olen opettanut Populaatiogenetiikkaa, Evolutiivisia sovelluksia,
ja Evoluution lukupiiriä. Olen myös opettanut useita kertoja kurssia
Agroekologia ja –evoluutio yhdessä dos. Marjo Helanderin ja Luken henkilökunnan
kanssa.
Koen mieluisiksi
tilanteet, joissa voin aidosti jakaa opetusvastuun muiden opettajien kanssa.
Aina kun ajan, talouden ja hallinnon kannalta on mahdollista, haluan antaa
opiskelijoiden perehtyä ilmiöihin ja faktoihin itsenäisesti tai pienryhmissä.
- Spatial distribution of migratory Salmo trutta in the northern Baltic Sea (2017)
- Boreal Environment Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Alkaloid Quantities in Endophyte-Infected Tall Fescue are Affected by the Plant-Fungus Combination and Environment (2016)
- Journal of Chemical Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Geographic Variation in Festuca rubra L. Ploidy Levels and Systemic Fungal Endophyte Frequencies (2016)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Performance of Endophyte Infected Tall Fescue in Europe and North America (2016)
- PLoS ONE
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Differences between wild and reared Salmo salar stocks of two northern Baltic Sea rivers (2015)
- Fisheries Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effects of systemic fungal endophytes on the performance of meadow fescue and tall fescue in mixtures with red clover (2015)
- Grass and Forage Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glyfosaatin riskit ja vaihtoehdot selvitettävä. Vieraskynä pääkirjoitus 22.6.2015 (2015)
- Helsingin Sanomat
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - Growth of hatchery-reared sea trout (Salmo trutta trutta) on the Finnish coast of the Baltic Sea (2015)
- Boreal Environment Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Meritaimenen eloonjäänti heikentynyt (2015)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Viljelty lohi eroaa luonnon lohesta (2015)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Spawning-Age differences and their temporal trends in wild and sea-ranched Atlantic salmon stocks, from stock mixture data. (2014)
- Open Fish Science Journal
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Archaeologists, Biologists and Lactose Tolerance (2013) Humanities in the Societal Challenges - 12 compelling cases for policymakers Timo Vuorisalo, Olli Arjamaa, Anti Vasemägi, Jussi-Pekka Taavitsainen, Auli Tourunen, Irma Saloniemi
(E1 Yleistajuinen artikkeli lehdessä) - Effects of hatchery rearing and sea ranching of parents on the life history traits of released salmon offspring (2013)
- Aquaculture
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Vuosien viljely muuttaa lohenpoikasia (2013)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Genetic and Environmental Factors Behind Foliar Chemistry of the Mature Mountain Birch (2012)
- Journal of Chemical Ecology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Glyphosate in northern ecosystems (2012)
- Trends in Plant Science
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - High lactose tolerance in North Europeans: a result og migration, not in situ milk consumption (2012)
- Perspectives in Biology and Medicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Laktoosinsiedon synty (2012)
- Duodecim
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Lohet olisi pyydettävä isokokoisina (2012)
- Suomen Kalastuslehti
(D1 Artikkeli ammattilehdessä) - Suomalaisen laktoosinsiedon alkuperä - biologien ja arkeologien yhteistyöllä laktoosinsiedon alkulähteille (2012)
- Duodecim
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )