Ph.D. Anssi Malinen - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Anssi Malinen
Ph.D.

- dosentti,
bioteknologian laitos (teknillinen tiedekunta)
- yliopistonlehtori,
biokemia (bioteknologian laitos)

ansmal@utu.fi

+358 29 450 4784

Tykistökatu 6

Turku

Työhuone: 6128

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-2987-2649

Group web page

https://malinenlab.utu.fi/

Asiantuntijuusalueet

Biokemia; entsyymi- ja proteiinikemia; entsyymikinetiikka; entsyymi-inhibiittorit; molekyylibiologia; geeniluenta; transkriptio; RNA-polymeraasi; biofysiikka; pyrofosfataasit; yliopisto-opettaja

Biografia

Yliopistonlehtori 9/2022-

Akatemiatutkija, tutkimusryhmänjohtaja 9/2017-8/2022 (viisivuotiskausi).
Tutkimusaihe: Geeniluennan säätely eukaryooteissa.

Tutkija / yliopisto-opettaja. Turun yliopisto, Biokemian laitos, 2016-2017.
Tutkimusaihe: Geeniluennan mekanismit & Membraanipyrofosfataasien molekyylievoluutio.

Tutkijatohtori. Oxfordin yliopisto, Fysiikan laitos, 2014-2016.
Tutkimusaihe: Bakteerien transkription aloituksen biofysiikka yksittäisten molekyylien tasolla.

Tutkijatohtori / yliopisto-opettaja. Turun yliopisto, Biokemian laitos, 2009-2014.
Tutkimusaihe: Bakteerien transkription pidentymisvaiheen mekanismit & Membraanipyrofosfataasien toimintamekanismi.

Tohtorikoulutettava. Turun yliopisto, Biokemian laitos, 2002-2009.
Tutkimusaihe: Membraanipyrofosfataasien rakenne ja toiminta.

Tutkimus

Geneettinen informaatio muodostaa eliön rakenteen ja toiminnan perustan. Informaatio on varastoituna DNA:han, mistä solu sitä valikoivasti hyödyntää. RNA-polymeraasi nimisellä proteiinilla on ratkaiseva rooli geeniluennan ensimmäisessä vaiheessa. Se muodostaa geeneistä RNA-kopioita, jotka toimivat proteiinien valmistusohjeena, säätelytehtävissä tai proteiineja valmistavien ribosomien rakennusosina. Nykyisen tutkimukseni tavoitteena on selvittää, miten ribosomien rakennusosien valmistamiseen erikoistunut RNA-polymeraasi I aloittaa RNA:n tuottamisen. Tämän monimutkaisen molekyylitason tapahtumasarjan ymmärtämiseksi käytämme biokemiaan ja yksittäisten molekyylien fluoresenssikuvantamiseen perustuvia tutkimusmenetelmiä. Motiivinamme on ymmärtää, miten geeniluentakoneisto reagoi ympäristön signaaleihin. RNA polymeraasi I:n toiminta on yliaktiivista monissa syöpäsoluissa, joten tutkimuksemme voi avata uusia mahdollisuuksia RNA polymeraasi I:n toimintaa hillitsevien syöpälääkkeiden kehittämisessä.

Opetus

Opetusalat:
Bioprosessitekniikka, nisäkässolut solutehtaina, entsyymi- ja proteiinikemia, geeniluenta (transkriptio), geenien säätely, biologiset membraanit.

Julkaisut

2/2

Pyrophosphate-Fueled Na+ and H+ Transport in Prokaryotes (2013)
- Microbiology and Molecular Biology Reviews
Baykov AA, Malinen AM, Luoto HH, Lahti R
(A2 Vertaisarvioitu katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä)
Pyrophosphate-Fueled Na+ and H+ Transport in Prokaryotes (vol 77, pg 267, 2013) (2013)
- Microbiology and Molecular Biology Reviews
BAYKOV AA, Malinen AM, Luoto HH, LAHTI R
(B1 Vertaisarvioimaton kirjoitus tieteellisessä lehdessä )
Active site opening and closure control translocation of multisubunit RNA polymerase (2012)
- Nucleic Acids Research
Malinen AM, Turtola M, Parthiban M, Vainonen L, Johnson MS, Belogurov GA
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Na+-translocating Membrane Pyrophosphatases Are Widespread in the Microbial World and Evolutionarily Precede H+-translocating Pyrophosphatases (2011)
- Journal of Biological Chemistry
Luoto HH, Belogurov GA, Baykov AA, Lahti R, Malinen AM
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Mutual Effects of Cationic Ligands and Substrate on Activity of the Na(+)-Transporting Pyrophosphatase of Methanosarcina mazei (2008)
- Biochemistry
Malinen AM, Baykov AA, Lahti R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Na+-pyrophosphatase: A novel primary sodium pump (2007)
- Biochemistry
Malinen AM, Belogurov GA, Baykov AA, Lahti R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Membrane-bound pyrophosphatase of Thermotoga maritima requires sodium for activity (2005)
- Biochemistry
Belogurov GA, Malinen AM, Turkina MV, Jalonen U, Rytkonen K, Baykov AA, Lahti R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Elucidating the role of conserved glutamates in H+-pyrophosphatase of Rhodospirillum rubrum (2004)
- Journal of Biological Chemistry
Malinen AM, Belogurov GA, Salminen M, Baykov AA, Lahti R
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )