Tuomas Borman - UTU Tutkimustietojärjestelmä - UTU Tutkimustietojärjestelmä

Tuomas Borman

- väitöskirjatutkija,
tietotekniikan laitos (teknillinen tiedekunta)
- tutkimusavustaja,
- projektitutkija,
- väitöskirjatutkija
data-analytiikka (tietotekniikan laitos)

tuomas.v.borman@utu.fi

ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0002-8563-8884

Julkaisut

HoloFoodR: a statistical programming framework for holo-omics data integration workflows (2025)
- Bioinformatics
Borman, Tuomas; Sannikov, Artur; Finn, Robert D; Limborg, Morten Tønsberg; Rogers, Alexander B; Kale, Varsha; Hanhineva, Kati; Lahti, Leo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
iSEEtree: interactive explorer for hierarchical data (2025)
- Bioinformatics Advances
Benedetti, Giulio; Seraidarian, Ely; Pralas, Theotime; Jeba, Akewak; Borman, Tuomas; Lahti, Leo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Multi-omics time-series analysis in microbiome research: a systematic review (2025)
- Briefings in Bioinformatics
Sherwani, Moiz Khan; Ruuskanen, Matti O.; Feldner-Busztin, Dylan; Nisantzis Firbas, Panos; Boza, Gergely; Móréh, Ágnes; Borman, Tuomas; Putu Erawijantari, Pande; Scheuring, István; Gopalakrishnan, Shyam; Lahti, Leo
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Fecal microbiota profiles of growing pigs and their relation to growth performance (2024)
- PLoS ONE
König, Emilia; Beasley, Shea; Heponiemi, Paulina; Kivinen, Sanni; Räkköläinen, Jaakko; Salminen, Seppo; Collado, Maria Carmen; Borman, Tuomas; Lahti, Leo; Piirainen, Virpi; Valros, Anna; Heinonen, Mari
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
Fewer culturable Lactobacillaceae species identified in faecal samples of pigs performing manipulative behaviour (2024)
- Scientific Reports
König Emilia, Heponiemi Paulina, Kivinen Sanni, Räkköläinen Jaakko, Beasley Shea, Borman Tuomas, Collado Maria Carmen, Hukkinen Vilja, Junnila Jouni, Lahti Leo, Norring Marianna, Piirainen Virpi, Salminen Seppo, Heinonen Mari, Valros Anna
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )
miaSim: an R/Bioconductor package to easily simulate microbial community dynamics (2023)
- Methods in Ecology and Evolution
Gao Yu, Şimşek Yağmur, Gheysen Emma, Borman Tuomas, Li Yi, Lahti Leo, Faust Karoline, Garza Daniel Rios
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )