Matti Ruuskanen
PhD, Docent
matti.ruuskanen@utu.fi ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0003-4221-2880 |
Mikrobiomit; bioinformatiikka; mikrobiologia; datatiede
Mikrobiomit ja terveys, mikrobiomien datatiede
Suoritin kandidaatin ja maisterinopintoni mikrobiologiassa Helsingin yliopistossa 2008-2014. Väitöskirjatutkimukseni tein Ottawan yliopistossa (Kanada) vuosina 2015-2019, jossa perehdyin arktisten järvisedimenttien mikrobiyhteisöihin ja niiden toimintaan. Vuosina 2019-2025 toimin Turun yliopistossa tutkijatohtorina Teemu Niirasen ja Leo Lahden ryhmissä. Projekteissani keskityin kroonisten sairauksien ja suolistomikrobiston yhteyksiin, sekä mikrobiomien datatieteen menetelmäkehitykseen. Olen saanut rahoitusta tutkimukseeni mm. Suomen Akatemialta, sekä Kulttuurirahastolta.
Olen aikaisemmin toiminut apuopettajana useilla laboratorio- ja luentokursseilla Helsingin yliopistossa ja Ottawan yliopistossa (Kanada). Turun yliopistolla opetin Machine Learning and Algorithmics (TKO_3121) kurssia vuosina 2021-2024.
Opetan tällä hetkellä kursseilla Solu ja Biomolekyylit -teoria (BKEM5030), Elintarvikelainsäädäntö ja elintarvikevalvonta (ETEK0003), sekä Mikrobiologia (BKEM5013).
Olen ohjannut 3 kandidaatintyötä, 3 gradutyötä, ja toimin kahden väitöskirjatutkijan toisena ohjaajana.
Minulla on dosenttisopimus Helsingin yliopistossa, ja olen suorittanut opettajan pedagogiset opinnot (60op) yliopistopedagogiikassa.
- Fertilizing with animal manure disseminates antibiotic resistance genes to the farm environment (2016)
- Journal of Environmental Quality
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )



