Ulla Pentikäinen
FT, Dos
ulla.pentikainen@utu.fi +358 50 501 2574 Tykistökatu 6 Turku Työhuone: 5090 ORCID-tunniste: https://orcid.org/0000-0001-6547-1282 |
Rakennebiologia; Röntgensädekristallografia; SAXS; proteiini-NMR; laskennallinen biofysiikka
Olen rakennebiologian tutkija, jolla laaja tausta kemiasta, biokemiasta,proteiinikemiasta ja erilaisista rakennebiologian menetelmistä sekä laskennallisesta bofysiikasta. Monipuolisen kokemuksen olen saanut toimimalla tutkijana eri tutkimusryhmissä sekä Suomessa (Turun yliopisto, entinen Kuopion yliopisto ja Jyväskylän yliopisto) että ulkomailla (Bristolin yliopisto, Iso-Briannia, ja Illinoisin Yliopisto, USA). Sitä mitä en vielä osaa, voin opetella. Olen kiinnostunut sairauksien syntymekanisemista molekyylitasolla, mikä elimistössä menee atomi-, molekyyli- ja proteiinitasolla vikaan niin, että sairastumme. Tutkimus edesauttaa uusien hoitomuotojen kehittämisen tutkimuksen kohteena oleviin sairauksiin, esimerkiksi erilaisiin syöpäsairauksiin.
Why diseases are developed? What goes wrong at molecular level in our body so that we get sick? The aim of my group is to learn to understand the molecular and structural level the underlying mechanisms behind different human diseases. Currently, we are focused on 1) mitral valve disease caused by the mutations in a cytoskeletal protein Filamin, and 2) cancer types developed due to the inhibition of protein phosphates 2A by different proteins. In addition, we are interested in how mechanical forces are mediated and propagated in cells, crucial for tissue development and having important implications for various diseases such valvular diseases, osteoporosis, and cancer.
In our research, we employ various structural biology methods, such as X-ray crystallography, protein NMR-spectroscopy, SAXS, as well as different theoretical biophysical simulations including MD and SMD simulations.
- Laaja opetuskokemus biokemiasta ja kemiasta
- Vastuuopettaja useilla luonto- ja laboratoriokursseilla Jyväskylän ja Turun yliopistoissa
- Opinto- ja tutkintokokonaisuus vastuuta
- Opettajan pedagoginen pätevyys
- Yliopisto-opettajan pedagoginen pätevyys
- The effect of secondary structure on cleavage of the phosphodiester bonds of RNA (2001)
- Cell Biochemistry and Biophysics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Allopurinol does not increase free radical scavenging capacity during reperfusion in coronary artery bypass graft patients (2000) Tarkka MR, Kaukinen S, Holm P, Kaukinen U, Sisto T, Kataja J, Huang WQ
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Effect of allopurinol on myocardial oxygen free radical production in coronary bypass surgery (2000) Tarkka MR, Vuolle M, Kaukinen S, Holm P, Eloranta J, Kaukinen U, Sisto T, Kataja J
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Age-related changes in the peroxyl radical scavenging capacity of human plasma. (1997)
- Free Radical Biology and Medicine
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )



