Santosh Lamichhane
Academy Research fellow
santosh.lamichhane@utu.fi |
Lipidomics/Metabolomics
Gut microbial metabolism
Multivariate data analysis
Reverse Metabolomics
Molecular networking
Santosh Lamichhane is a Research Council of Finland Academy Research Fellow. He holds the title of Docent, equivalent to Associate Professor, in Metabolomics at the Department of Life Technologies, University of Turku.
As part of his research fellowship, Lamichhane will investigate the relationship between gut microbiota, lipids, and their clinical effects in early childhood.
Lamichhane was a Visiting Researcher at The Dorrestein Lab, University of California, San Diego, where he gained expertise in reverse and repository-scale metabolomics to better understand microbial chemistry and its influence on human metabolism.
Lamichhane's research interest lies in the interface of human health, diet and gut microbial activity. He wants to connect these dots (health, diet, microbes) by profiling small molecules (termed as metabolites), which circulates in our body. To be very specific Lamichhanes core interest are reflected by following keywords:
- Metabolomics-Metabolites-Small molecules
- Human Nutrition and health
- Pre and Probiotics / Gut Microbiome
- Human intervention study
Relating to Lamichhane's experience, he has spent approximately a decade profiling small molecules in relation to human heath and (or) gut metabolome. He is open to collaborations relating to gut, health, metabolites and microbiome.
Metabolomics lecture in Systems biology (SYS21012), Modern biotechnologies and bioinformatics course (BIOT1524), Bioanalytical Techniques (CHEMI6429) at University of Turku.
- Metabolic alterations in immune cells associate with progression to type 1 diabetes (2020)
- Diabetologia
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Prenatal exposure to perfluoroalkyl substances modulates neonatal serum phospholipids, increasing risk of type 1 diabetes (2020)
- Environment International
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Circulating metabolites in progression to islet autoimmunity and type 1 diabetes (2019)
- Diabetologia
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Cord-Blood Lipidome in Progression to Islet Autoimmunity and Type 1 Diabetes (2019)
- Biomolecules
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Lipidomes in health and disease: Analytical strategies and considerations (2019)
- Trends in Analytical Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - The Role of Omic Technologies in the Study of the Human Gut Microbiome (2019) Reference Module in Food Science Partho Sen, Santosh Lamichhane, Alex M Dickens, Matej Orešič
(A3 Vertaisarvioitu kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - A longitudinal plasma lipidomics dataset from children who developed islet autoimmunity and type 1 diabetes (2018)
- Scientific Data
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - An Overview of Metabolomics Data Analysis: Current Tools and Future Perspectives (2018) Comprehensive Analytical Chemistry Lamichhane S., Sen P., Dickens A., Hyötyläinen T., Orešič M.
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Dynamics of Plasma Lipidome in Progression to Islet Autoimmunity and Type 1 Diabetes - Type 1 Diabetes Prediction and Prevention Study (DIPP) (2018)
- Scientific Reports
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut metabolome meets microbiome: A methodological perspective to understand the relationship between host and microbe (2018)
- Methods
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - H-1 HR-MAS NMR-based metabolomics analysis for dry-fermented sausage characterization (2018)
- Food Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Metabolic Fate of C-13-Labeled Polydextrose and Impact on the Gut Microbiome: A Triple-Phase Study in a Colon Simulator (2018)
- Journal of Proteome Research
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Optimizing sampling strategies for NMR-based metabolomics of human feces: pooled vs. unpooled analyses (2017)
- Analytical Methods
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Gut microbial activity as influenced by fiber digestion: dynamic metabolomics in an in vitro colon simulator (2016)
- Metabolomics
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Impact of Freezing Delay Time on Tissue Samples for Metabolomic Studies (2016)
- Frontiers in Oncology
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Metabolic clusters of breast cancer in relation to gene- and protein expression subtypes (2016)
- Cancer and Metabolism
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - High-resolution magic angle spinning studies of semi-hard Danbo (30+) cheese - impact of processing condition and relation to sensory perception (2015)
- Special Publication- Royal Society of Chemistry
(B2 Vertaisarvioimaton kirjan tai muun kokoomateoksen osa) - Strategy for Nuclear-Magnetic-Resonance-Based Metabolomics of Human Feces (2015)
- Analytical Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Impact of Dietary Polydextrose Fiber on the Human Gut Metabolome (2014)
- Journal of Agricultural and Food Chemistry
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä ) - Metabolic characterization of triple negative breast cancer (2014)
- BMC Cancer
(A1 Vertaisarvioitu alkuperäisartikkeli tieteellisessä lehdessä )